转载:http://www.cnblogs.com/xudongliang/p/6497465.html

嵌合体序列:由来自两条或者多条模板链的序列组成,示意图如下:

在PCR反应中,在延伸阶段,由于不完全延伸,就会导致嵌合体序列的出现,以上图为例,

在扩增序列X的过程中,在序列延伸阶段,只产生了部分X序列延伸阶段就结束了,在下一轮的PCR反应中,这部分序列作为其相似序列Y的引物接着延伸,扩增就会形成X和Y的嵌合体序列;

在放一张具体一点的示意图,不完全延伸产生的序列作为下一轮PCR反应的产物,进行延伸

在PCR过程中,大概有1%的几率会出现嵌合体序列,所以在16S 扩增子测序的分析中,需要去除嵌合体序列

参考文章:http://drive5.com/usearch/manual/chimera_formation.html

24、嵌合体序列Chimeras的更多相关文章

  1. 扩增子分析解读4去嵌合体 非细菌序列 生成代表性序列和OTU表

    本节课程,需要先完成 扩增子分析解读1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类   先看一下扩增子分析的整体流程,从下向上逐层分析 分 ...

  2. 利用USearch去除嵌合体(chimeras)

    嵌合体序列指在pcr过程中,两条不同的序列产生杂交扩增的序列,属于人工污染,在ITS和16S分析中,应该首先去除,USearch提供去除嵌合体的功能 usearch -uchime_ref reads ...

  3. 剑指 Offer 题目汇总索引

    剑指 Offer 总目录:(共50道大题) 1. 赋值运算符函数(或应说复制拷贝函数问题) 2. 实现 Singleton 模式 (C#) 3.二维数组中的查找 4.替换空格              ...

  4. Chap4: question: 19 - 28

    19. 二叉树的镜像(递归) 即:交换所有节点的左右子树.从下往上 或 从上往下 都可以. #include <iostream> #include <string> usin ...

  5. Python内置函数详解——总结篇

    2个多月来,将3.5版本中的68个内置函数,按顺序逐个进行了自认为详细的解析,现在是时候进行个总结了.为了方便记忆,将这些内置函数进行了如下分类:     数学运算(7个)     类型转换(24个) ...

  6. SAMTOOLS使用 SAM BAM文件处理

    [怪毛匠子 整理] samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 #第一步:把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件 system"samtools view -bS m ...

  7. OTU(operational taxonomic units),即操作分类单元

    转自http://www.dxy.cn/bbs/topic/35655953 1.OTU是什么? OTU(operational taxonomic units),即操作分类单元.通过一定的距离度量方 ...

  8. Iso-seq 必备基础

    Iso-seq , 全称叫做 Isoform-sequencing, 是 Pacbio 公司对自己开发的转录本测序技术的规范化命名:是利用三代测序长读长的特点,不打断转录本,直接测序,从而得到全长转录 ...

  9. 5.python内置函数详解

    内置函数 声明,转载至这位大哥,感谢之至 http://blog.csdn.net/oaa608868/article/details/53506188 关于分类 数学运算(7个) 类型转换(24个) ...

随机推荐

  1. static{}块的作用

    本文转载自: https://www.cnblogs.com/caolaoshi/p/7824748.html static{}块,会且仅会在类被加载时执行一次,多用于定义静态变量或执行静态方法. 什 ...

  2. web框架详解之tornado 二 cookie

    一.tornado之cookie一 目录: <!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta c ...

  3. 在Ubuntu上为Android系统的Application Frameworks层增加硬件访问服务【转】

    本文转载自:http://blog.csdn.net/luoshengyang/article/details/6578352 在数字科技日新月异的今天,软件和硬件的完美结合,造就了智能移动设备的流行 ...

  4. 希尔排序(Shell Sort)

    一.思路 希尔排序是基于插入排序算法,通过允许不相邻的元素进行交换这一简单的改进,使数组变为局部有序,最终再用插入排序. 希尔排序的思想是使数组中任意间隔h的元素都是有序的.这样的数组被称为h有序数组 ...

  5. CSS基础语法和CSS经常用到的知识点总结

    1. [代码]css基础教程     CSS基础语法CSS 规则由两个主要的部分构成:选择器,以及一条或多条声明.每条声明由一个属性和一个值组成.每个属性有一个值.属性和值被冒号分开.例如:下面这行代 ...

  6. 仿联想商城laravel实战---4、验证(lavarel的表单验证如何使用)

    仿联想商城laravel实战---4.验证(lavarel的表单验证如何使用) 一.总结 一句话总结: 验证规则和验证信息的数组:在控制器的方法中 1.注册页面中的用户名正确(比如是否重名,字段长度是 ...

  7. 1W字看懂互联网知识经济

    互联网知识经济,发生关键变化的不是知识,而是经济. 今天和大家分享方军老师的新书<付费:互联网知识经济的兴起>.这本书是一个老互联网人看新知识经济,很有意思的视角在于,以互联网的发展为节点 ...

  8. WebElement接口获取值

    通过WebElement接口获取值 size 获取元素的尺寸 text 获取元素的文本 get_attribute(name) 获取属性值 location 获取元素坐标,先找到要获取的元素,再调用该 ...

  9. Java钉钉开发_02_免登授权(身份验证)

    源码已上传GitHub: https://github.com/shirayner/DingTalk_Demo 一.本节要点 1.免登授权的流程 (1)签名校验 (2)获取code,并传到后台 (3) ...

  10. poj-2420 A Star not a Tree?(模拟退火算法)

    题目链接: A Star not a Tree? Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 5219   Accepte ...