生物医学大数据

Case study

由Human genome project提出之后,提出的精准医学。它的初衷是将数据standard后easy应用,我国重要重在疾病预警和疗效评价。

在疾病预警上的案例包括新生儿筛查和致癌基因检测,安杰利娜朱莉做了一个乳腺癌早期诊断并去除风险的推动者。但是因为早期诊断依然有很高的假阳性率,所以做出切除的判断还是存在很大风险的(不做怕是真的,做了怕是假的)。其假阳性率高的原因之一是突变不一定有表型,所以应对方法是reduced penetrance。孟德尔遗传病大部分是发育相关,所以用生物学实验解释困难。在基因角度我们发现了组合效应(细胞内组分之间;gene之间;通路之间),所以基于这个组合效应原理修正注释了一部分表型,COPE-PCG是系列软件。

 

reduced penetrance|COPE-PCG的更多相关文章

  1. 【英语魔法俱乐部——读书笔记】 3 高级句型-简化从句&倒装句(Reduced Clauses、Inverted Sentences) 【完结】

    [英语魔法俱乐部——读书笔记] 3 高级句型-简化从句&倒装句(Reduced Clauses.Inverted Sentences):(3.1)从属从句简化的通则.(3.2)形容词从句简化. ...

  2. How to Cope with Deadlocks

    http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/innodb-deadlocks.html How to Cope with Deadlocks This section ...

  3. G - Reduced ID Numbers(第二季水)

    Description T. Chur teaches various groups of students at university U. Every U-student has a unique ...

  4. poj 2769 Reduced ID Numbers(memset使用技巧)

    Description T. Chur teaches various groups of students at university U. Every U-student has a unique ...

  5. C - Reduced ID Numbers 寒假训练

    T. Chur teaches various groups of students at university U. Every U-student has a unique Student Ide ...

  6. 机器学习: 共轭梯度算法(PCG)

    今天介绍数值计算和优化方法中非常有效的一种数值解法,共轭梯度法.我们知道,在解大型线性方程组的时候,很少会有一步到位的精确解析解,一般都需要通过迭代来进行逼近,而 PCG 就是这样一种迭代逼近算法. ...

  7. Sara Cope关于text-shadow的介绍

    作者:Sara Cope p { text-shadow: 1px 1px 1px #000; } 你可以通过逗号“,”应用多个文本阴影. p { text-shadow: 1px 1px 1px # ...

  8. 【原创翻译】The Case for the Reduced Instruction Set Computer

    RISC机的例子 David A. Patterson 加州大学伯克利分校计算机科学系 David R. Ditzel 贝尔实验室计算科学研究中心 介绍 计算机体系结构最主要的目标之一就是设计比之前产 ...

  9. poj 2769 Reduced ID Numbers 同余定理

    链接:http://poj.org/problem?id=2769 题意:寻找数m,是的对于n个数的余数不同 思路:暴力,优化:同余部分不用测试 代码: #include <iostream&g ...

随机推荐

  1. ubuntu 插网线无法上网解决方案

    前言 不知道最近是什么情况,ubuntu链接网线总是上不去网,但是wifi还能用,一直也就没有捣鼓,不过今天连wifi都不能用了,只能开始修理了. 修复方案 使用ifconfig命令查看以太网的名称 ...

  2. 踩一踩win7安装neo4j的坑

    本文使用zip解压方式安装,下载社区版zip 解压到喜欢的文件夹,然后配置环境变量NEO4J_HOME=D:\neo4j-community-3.5.5(自己的解压目录) 配置Path=%NEO4J_ ...

  3. [Python]h5py/__init__.py:36:

    个人博客地址:https://www.bearoom.xyz/2019/08/24/python-devolop-env-hdf5-problem/ 安装tensorflow之后,在导入tensorf ...

  4. 图解:平衡二叉树,AVL树

    学习过了二叉查找树,想必大家有遇到一个问题.例如,将一个数组{1,2,3,4}依次插入树的时候,形成了图1的情况.有建立树与没建立树对于数据的增删查改已经没有了任何帮助,反而增添了维护的成本.而只有建 ...

  5. 移除手机端a标签点击自动出现的边框和背景

    手机端a标签会自动补充出现边框或者背景,使得用户知道a标签的点击状态,但样式很不好看 <!DOCTYPE html> <html> <head> <meta ...

  6. storm 机制

    storm基础系列之二----zookeeper的作用 https://www.cnblogs.com/xyang/p/5643745.html Zookeeper+Storm集群搭建 https:/ ...

  7. 吴裕雄--天生自然 JAVA开发学习:switch case 语句

    public class Test { public static void main(String args[]){ //char grade = args[0].charAt(0); char g ...

  8. poj2778 矩阵乘法+ac自动机

    题:http://poj.org/problem?id=2778 题意:给定m个模式串,问长度为n的字符串不包含这些模式串的有几种可能 分析:因为n很大,所以考虑矩阵ksm来解决,构造一个矩阵res[ ...

  9. Matlab高级教程_第一篇:Matlab基础知识提炼_03

    第七节:函数 编程的过程很像是画图纸,编程语言在平时使用的时候不会像是单个的命令去执行,大多数情况下我们把许多重复要执行或者一些常用的编辑好的功能“封装”到一起,方便来使用.函数-----就是这种过程 ...

  10. Windows、Linux(Ubuntu)修改 pip 镜像源

    一.Windows 修改 pip 镜像源 1.win + R 打开运行,输入  %APPDATA% 2.按下回车,打开文件夹. 3.在该文件夹下,新建文件夹,命名 pip. 4.进入 pip 文件夹, ...