R scholar和rentrez | NCBI和Google scholar文献数据挖掘
主要会用到两个R包:
rentrez: 'Entrez' in R
scholar: Analyse Citation Data from Google Scholar
RISmed 包可以查询 PubMed 数据库中的信息。
目的1:输入检索词,从GSE数据库中爬取附带的参考文献。
R scholar包,Guangchuang Yu开发
Provides functions to extract citation data from Google Scholar. Convenience functions are also provided for comparing multiple scholars and predicting future h-index values.
可以得到期刊的详细信息,调用的是Google Scholar的数据接口,这里简单演示一下提取期刊的IF功能。
library(scholar)
id <- get_publications("bg0BZ-QAAAAJ&hl")
impact <- get_impactfactor(journals=id$journal, max.distance = 0.1)
id <- cbind(id, impact)
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