题目网址:http://poj.org/problem?id=3080

思路:

以第一个DNA序列s为参考序列,开始做以下的操作。

1.将一个字母s[i]作为匹配串。(i为当前遍历到的下标)

2.遍历所有序列,看是否是所有序列的公共子串

3.是所有序列的子串的话,再往后增加一个字母,组成一个长度len+1的匹配串(设原先匹配串长度为len),重复步骤2

4.不是所有序列的子串的话,i=len+i;判断len是否大于3,是的话保存子串。len=0;重复步骤1。(为什么 i=len+i呢?因为len+i都是已经匹配到的,则从i+1 到 i+len 的匹配数会分别比当前匹配数小1…len-1 可以自己推一遍为什么)

5.对结果排序,找出最长,若长度相同的情况下,字典序最小的子串

代码:

 #include <cstdio>
#include <string>
#include <cstring>
#include <vector>
#include <iostream>
#include <map>
#include <algorithm>
using namespace std;
int n;
char s[][];
char temp[];
vector<string>v;
map<string,int>mp;
bool cmp(string x,string y){
if(x.length()==y.length()){
int i=;
while (x[i]==y[i]) i++;
return x[i]<y[i];
}
return x.length()>y.length();
}
int main(){
int t;
scanf("%d",&t);
while (t--) {
mp.clear();
v.clear();
scanf("%d",&n);
for (int i=; i<n; i++) scanf("%s",s[i]);
for (int i=; i<; i++) {
int ok=,l=;
string str="";
memset(temp, , sizeof(temp));
temp[]=s[][i];
while(l+i< && ok){
for (int i=; i<n; i++) {
if(strstr(s[i], temp)==NULL){
ok=;
break;
}
}
if(ok){
str+=s[][i+l];
l++;
temp[l]=s[][i+l];
}
}
if(mp[str]== && str.size()>=){
v.push_back(str);
mp[str]=;
i=l+i;
}
}
sort(v.begin(), v.end(), cmp);
if (v.size()>) cout<<v[]<<endl;
else printf("no significant commonalities\n");
}
}

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