I am calculating cox propotional hazards models with the coxph 
function from the survival package.  My data relates to failure of 
various types of endovascular interventions.  I can successfully 
obtain the LR, Wald, and Score test p-values from the coxph.object, as 
well as the hazard ratio as follows:

formula.obj = Surv(days, status) ~ type 
coxph.model = coxph(formula.obj, df) 
fit = summary(coxph.model) 
hazard.ratio = fit$conf.int[1] 
lower95 = fit$conf.int[3] 
upper95 = fit$conf.int[4] 
logrank.p.value = fit$sctest[3]  (Score (logrank) test)

wald.p.value = fit$waldtest[3]  (Wald test)

lr.p.value = fit$logtest[3]    ----    Likelihood ratio test (优先)

I had intended to report logrank P values with the hazard ratio and CI 
obtained from this function.  In one case the P was 0.04 yet the CI 
crossed one, which confused me, and certainly will raise questions by 
reviewers.  In retrospect I can see that the CI calculated by coxph is 
intimately related to the Wald p-value (which in this specific case 
was 0.06), so this would appear to me not a good strategy for 
reporting my results (mixing the logrank test with the HR and CIs from 
coxph).

I can report the Wald p-values instead, but I have read that the Wald 
test is inferior to the score test or LR test.  My questions for 
survival analysis jockeys out there / TT:

1. Should I just stop here and use the wald.p.value?  This appears to 
be what Stata does with the stcox function (albeit Breslow method).

2. Should I calculate HR and CIs that "agree" with the LR or logrank 
P?  How do I do that?

Thank you,

Coxph model Pvalue Select的更多相关文章

  1. Coxph model Pvalue Select2

    4   1) Put summary(coxphobject) into a variable summcph <- summary(coxphobject) 2) examine it wit ...

  2. 懒人小工具:自动生成Model,Insert,Select,Delete以及导出Excel的方法

    在开发的过程中,我们为了节约时间,往往会将大量重复机械的代码封装,考虑代码的复用性,这样我们可以节约很多时间来做别的事情.最近跳槽到一节webform开发的公司,主要是开发自己公司用的ERP.开始因为 ...

  3. 懒人小工具:T4自动生成Model,Insert,Select,Delete以及导出Excel的方法

    之前写了篇文章,懒人小工具:[自动生成Model,Insert,Select,Delete以及导出Excel的方法](http://www.jianshu.com/p/d5b11589174a),但是 ...

  4. 懒人小工具:T4生成实体类Model,Insert,Select,Delete以及导出Excel的方法

    由于最近公司在用webform开发ERP,用到大量重复机械的代码,之前写了篇文章,懒人小工具:自动生成Model,Insert,Select,Delete以及导出Excel的方法,但是有人觉得这种方法 ...

  5. 懒人小工具1:winform自动生成Model,Insert,Select,Delete以及导出Excel的方法

       懒人小工具2:T4自动生成Model,Insert,Select,Delete以及导出Excel的方法    github地址:https://github.com/Jimmey-Jiang/J ...

  6. mybatis和model关联

    <select id="getSubCreditLogBySubCreditId" parameterType="long" resultType=&qu ...

  7. QtSQL学习笔记(4)- 使用SQL Model类

    除了QSqlQuery,Qt提供了3个高级类用于访问数据库.这些类是QSqlQueryModel.QSqlTableModel和QSqlRelationalTableModel. 这些类是由QAbst ...

  8. Dos.ORM Select查询 自定义列

    自定义列 .Select( p = >new{ test = p.id}) // 同sql 列名 as 新列名 如下是 自己在写代码的例子,查询,分页,where条件,排序 var where ...

  9. Ibatis collect select用法详解

    问题:之前接触过Ibatis的使用,在做一对多的时候,一般都是手动去填充,非自动让ibatis去填充数据. 下面就用ibatis的自动填充功能来实现. 关键使用到collection 标签下的sele ...

随机推荐

  1. linux fdisk tf卡分区操作解析说明

    /***************************************************************************** * linux fdisk tf卡分区操作 ...

  2. Ubuntu 速配指南:开启3D桌面特效

     http://www.lupaworld.com/article-205494-1.html 安装compizconfig-settings-manager(以下简称ccsm) 在终端里输入:sud ...

  3. Python的学习之-计算机编码和二进制

    bit位,计算机中最小的表示单位 8bit = 1bytes字节,最小的储存单位,1bytes缩写为1b 1KB = 1024B 1MB = 1024KB 1GB = 1024MB 1TB = 102 ...

  4. test20180919 选择客栈

    题意 分析 不难发现把增加人数看成减少人数,上限是w 看成总数是w,问题就变成了询问有多少个子区间没有0. 考虑这个问题困难在哪里,就是区间加减法让我们不好判断0 的位置. 因为题目保证每个位置的值非 ...

  5. android 工具类 数据库管理

    版权声明:本文为博主原创文章,未经博主同意不得转载. https://blog.csdn.net/xuduzhoud/article/details/27540301 数据库工具类,优雅的管理andr ...

  6. Java安全管理器

    启动SecurityManager开关: 隐式: 启动时添加JVM启动参数: -Djava.security.manager :启动默认的安全管理器: -Djava.security.policy=& ...

  7. linux挂载SD卡

    (1)通过#fdisk -l命令确认板子上的linux系统是否识别SD卡 MP805M板子插入SD卡后显示 SD30 slot is without WPmmc1: new high speed SD ...

  8. hybrid app 知识点

    WebView能加载显示网页,可以将其视为一个浏览器. Android系统中,叫做 WebView ios系统中,新版是 WKWebView,旧版是 UIWebView Native App 和 We ...

  9. C#创建文件夹和文件

    一.创建文件夹,例: if (!Directory.Exists(path)) { Directory.CreateDirectory(path); } 二.创建文件,例: global::Syste ...

  10. Microsoft.Crm.Setup.SrsDataConector.RegisterServerAction 操作失败 Requested value 'Geo' was not found 的解决方法

    error installing ssrs data connector on sql server for dynamics crm 2011 I think the post title says ...