LabVantage的仪器数据采集组件为LIMS CI,是一个独立的应用程序/服务,实现仪器数据的采集(GC、LC等带有工作站的仪器)。

将仪器输出数据转换为LIMS所需数据并传输,使用Talend这款ETL工具实现。

Talend支持Excel、CSV等传统的数据类文件的读取,对于Word、PDF等报告类文件的读取并不适用。

简单仪器,例如PH、天平等,使用串口(RS232)或网口(TCP)实现数据的采集。复杂仪器,例如GC、LC、ICP、HPLC等采集仪器输出的数据文件或报告文件。

几个目录的作用:

  • Import:仪器数据输出文件存放目录,相对于LIMS CI来说为输入目录。
  • Backup:采集时将文件拷贝到此处进行处理,此处的文件为处理中的文件。
  • FAIL:处理失败的文件
  • LOGS:日志记录
  • Export:导出LIMS的样品测试序列给仪器,具体格式视仪器上位机软件。

LabVantage仪器数据采集方案的更多相关文章

  1. LIMS系统仪器数据采集-使用xpdf解析pdf内容

    不同语言解析PDF内容都有各自的库,比如Java的pdfbox,.net的itextsharp. c#解析PDF文本,关键代码可参考: http://www.cnblogs.com/mahongbia ...

  2. Scrapy 分布式数据采集方案

    运行环境 CentOS7. + Python2. + Scrapy1. + MongoDB3. + BeautifulSoup4. 编程工具 PyCharm + Robomongo + Xshell ...

  3. 双汇大数据方案选型:从棘手的InfluxDB+Redis到毫秒级查询的TDengine

    双汇发展多个分厂的能源管控大数据系统主要采用两种技术栈:InfluxDB/Redis和Kafka/Redis/HBase/Flink,对于中小型研发团队来讲,无论是系统搭建,还是实施运维都非常棘手.经 ...

  4. TCP与UDP的区别(转)

    源:http://blog.chinaunix.net/uid-20745340-id-1878774.html 参考:TCP协议与UDP协议的区别 TCP与UDP的区别 中国移动.中国联通推行的GP ...

  5. Java设计模式(一)工厂模式

    一.场景描述 仪器数据文件的格式包含Pdf.Word.Excel等多种,不同种格式的文件其数据的采集方式不同,因此定义仪器数据采集接口,并定义PDF.Excel等不同的数据采集类实现该接口. 通过工厂 ...

  6. Java设计模式(四)Builder建造者模式

    一.场景描述 建造者模式同工厂模式.抽象工厂模式一样,用于创建继承类对象. 工厂模式:http://www.cnblogs.com/mahongbiao/p/8618970.html 抽象工厂模式:h ...

  7. Java设计模式(二)抽象工厂模式

    一.场景描述 接<Java设计模式(一)工厂模式>https://www.cnblogs.com/mahongbiao/p/8618970.html 工厂模式有一缺点,就是破坏了类的封闭性 ...

  8. THEKEY

    追溯历史,有据可查的身份证明是中国隋唐时期的“鱼符”,只为达官贵人证明身份等级,后演变为“龟符”.“牙牌”.“腰牌”等,直至近现代时期才出现真正意义的身份证,增加了个人信息描述.由于过去的生产力水平较 ...

  9. RNA测序的质量控制

    RNA测序的质量控制 发表评论 3,112 A+ 所属分类:Transcriptomics   收  藏 ENCODE项目向我们揭示,人类基因组中超过70%能得到转录,只不过不会发生在同一个细胞里.为 ...

随机推荐

  1. LuoguP3377 左偏树 (左偏树)

    TLE but corrct in most cases. inline int Find(int x){ //be careful with the way used for finding you ...

  2. Luogu1038 神经网络 (拓扑排序)

    拓扑排序,裸的,水的. 第一发:题读错,输出错,输入错,到处错 \(\longrightarrow\) 40pts (excuse me ?) 第二发:漏了输入层特判 \(\longrightarro ...

  3. 深入分析FragmentPagerAdapter和FragmentStatePagerAdapter

    最近遇到比较奇怪的bug,TableLayout+ViewPager实现点击顶部tab切换viewpager视图.但是在Viewpager设置dapter时,最开始设置的是FragmentPagerA ...

  4. java学习第三天常用类.day11

    工具类如何设计,在开发中有两种设计: 工具方法:静态方法的使用 非静态的方法使用: 使用单列模式,为了可重用代码.让代码更容易被他人理解.保证代码可靠性. 保证在整个应用中某一个类有且只有一个实例(一 ...

  5. Docker 拉取Nginx镜像 和运行

    Docker 镜像拉取 docker pull [OPTIONS] NAME[:TAG|@DIGEST] 镜像拉取命令 OPTIONS说明: -a :拉取所有 tagged 镜像 --disable- ...

  6. Redis变慢?深入浅出Redis性能诊断系列文章(二)

    (本文首发于"数据库架构师"公号,订阅"数据库架构师"公号,一起学习数据库技术) 本篇为Redis性能问题诊断系列的第二篇,本文主要从应用发起的典型命令使用上进 ...

  7. js 对象的深复制 解决不能复制undefined (递归)

    用普通的拷贝  JSON.parse和 JSON.stringify 进行对象拷贝是不会拷贝undefined //普通的拷贝   const obj = {         a: {         ...

  8. Java SE 四大内部类

    内部类 1.成员内部类 调用成员内部类 //在外面的类的最后,写一个方法,调用成员内部类(创建对象,在访问) class Outer08{ class Inner08{ //成员内部类 public ...

  9. 修改Windows10 命令终端cmd的编码为UTF-8 && IDEA控制台输出中文乱码

    临时修改 进入cmd窗口后,直接执行 chcp 65001 永久修改 在运行中输入regedit,找到HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Command Pro ...

  10. 容器监控:cAdvisor

    CAdvisor是Google开源的一款用于展示和分析容器运行状态的可视化工具.通过在主机上运行CAdvisor用户可以轻松的获取到当前主机上容器的运行统计信息,并以图表的形式向用户展示. 在本地运行 ...