sratookit
tar -zxvf sratoolkit.2.8.2-1-ubuntu64.tar.gz
移动到专门安装生物信息软件的目录下
mv sratoolkit.2.8.2-1-ubuntu64 ~/biosoft
echo 'PATH=$PATH:~/biosoft/sratoolkit.2.8.2-1-ubuntu64/bin' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
prefetch -v
prefetch -c SRR390728
fastq-dump --gzip --split-3 -O path -A accession
for i in `seq 56 62`
do
fastq-dump --gzip --split-3 -O ./fastq/ -A SRR35899${i}.sra
done
fastq-dump *.sra
fastq-dump --fasta *.sra
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