[E::hts_idx_push] NO_COOR reads not in a single block at the end 10 -1
在分析转录组数据时，用bowtie2比对生成的bam文件，下一步call peak使用m6Aviewer，需要bam文件的index文件。所以我直接敲命令
samtools index xx.bam
[E::hts_idx_push] NO_COOR reads not in a single block at the end -
报上面的错误。后来发现，samtools建索引时，bam或sam文件必须是排序好了的，而且必须使用samtools的默认排序方法，即坐标顺序排序。
time nohup samtools sort -@ .m6A.bam -o .m6A.sort.bam &
然后在进行index
[E::hts_idx_push] NO_COOR reads not in a single block at the end 10 -1的更多相关文章
- C语言的AES加密
C语言的AES加密 稍微封装了几个函数 方便使用 #if 1 #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <strin ...
- POJ1742Coins(并不理解是什么意思）
Coins Time Limit: 3000MS Memory Limit: 30000K Total Submissions: 32309 Accepted: 10986 Descripti ...
- Oracle Tuning 基础概述01 - Oracle 常见等待事件
对Oracle数据库整体性能的优化,首先要关注的是在有性能问题时数据库排名前几位等待事件是哪些.Oracle等待事件众多,随着版本的升级,数量还在不断增加,可以通过v$event_name查到当前数据 ...
- Coins
Description Whuacmers use coins.They have coins of value A1,A2,A3...An Silverland dollar. One day Hi ...
- POJ1742 Coins[多重背包可行性]
Coins Time Limit: 3000MS Memory Limit: 30000K Total Submissions: 34814 Accepted: 11828 Descripti ...
- HDU-2844 Coins(多重背包)
Problem Description Whuacmers use coins.They have coins of value A1,A2,A3...An Silverland dollar. On ...
- hdu 2844 多重背包coins
http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=2844 题意: 有n个硬币,知道其价值A1.....An.数量C1...Cn.问在1到m价值之间,最多能组成多少种 ...
- The Secrets of Oracle Row Chaining and Migration
from http://www.akadia.com/services/ora_chained_rows.html Overview If you notice poor performance in ...
- poj 1430 Binary Stirling Numbers
Binary Stirling Numbers Time Limit: 1000MS Memory Limit: 10000K Total Submissions: 1761 Accepted ...
随机推荐
- nginx启动脚本，手动编辑
nginx启动脚本,手动编辑 #! /bin/bash # chkconfig: - # description: nginx service XDIR=/www/server/nginx DESC= ...
- hiho-1015- KMP算法
#1015 : KMP算法 时间限制:1000ms 单点时限:1000ms 内存限制:256MB 描述 小Hi和小Ho是一对好朋友,出生在信息化社会的他们对编程产生了莫大的兴趣,他们约定好互相帮助,在 ...
- python 小白(无编程基础，无计算机基础)的开发之路，辅助知识6 python字符串/元组/列表/字典互转
神奇的相互转换,小白同学可以看看,很有帮助 #1.字典dict = {'name': 'Zara', 'age': 7, 'class': 'First'} #字典转为字符串,返回:<type ...
- javassist：字节码编辑器工具
简介: javassist是一款可以在运行时生成字节码的工具,可以通过它来构造一个新的class对象.method对象,这个class是运行时生成的.可以通过简短的几行代码就可以生成一个新的class ...
- [转]git问题ERROR: Repository not found.的解决
原文地址:http://blog.csdn.net/u010154424/article/details/51233966 在github中新增了一个项目,按照git的提示添加了远程仓库,但是提交的时 ...
- Hadoop介绍和环境配置
原文:http://www.cnblogs.com/edisonchou/ 一.Hadoop的发展历史 说到Hadoop的起源,不得不说到一个传奇的IT公司-全球IT技术的引领者Google.Goog ...
- 基于‘BOSS直聘的招聘信息’分析企业到底需要什么样的PHP程序员
原文地址:http://www.jtahstu.com/blog/scrapy_zhipin_php.html 基于'BOSS直聘的招聘信息'分析企业到底需要什么样的PHP程序员 标签(空格分隔): ...
- slurm-16.05.3任务调度系统部署与测试(1)
1.概述2.同步节点时间3.下载并解压文件4.编译安装munge-0.5.125.配置munge6.编译安装slurm-16.05.37.配置slurm8.配置MySQL数据库环境9.启动slur ...
- win8安装mysql5.5最后配置没有反应
win8安装mysql5.5最后配置没有反应 win8下安装mysql5.5一路顺利,可是到最后一步配置mysql服务及登录password后.注冊服务并启动服务界面一直没有不论什么反应: 本来以为是 ...
- mvc 中Range中max和min值晚绑定
对于Attribute : Range(min,max)的min和max必须在用的时候给,但是需求有时须要把这两个值存db.动态取出的.这时就须要razor帮忙了: @Html.TextBoxFor( ...