interpro 数据库
interpro 通过整合多个蛋白相关的数据库,提供了一个方便的对蛋白序列进行功能注释的平台,功能注释的内容包括蛋白质家族预测,domain 和 结合位点预测
interoro 在整合多个数据库的同时,去掉了冗余,提供了一个统一的接口,用来对序列进行功能注释;而且还提供了interproscan 这样的命令行工具,可以方便的对
大规模的蛋白序列进行注释,目前, UniprotKB 和 Gene Ontology 就是使用 interproscan 对蛋白序列进行注释的。
interpro 数据库每两个月更新一次
interpro 的成员数据库包括:
CATH-Gene3D
CDD
MobiDB:
HAMAP:
PANTHER:
PIRSF:
PRINTS:
ProDom:
PROSITE:
SFLD:
SMART:
SUPERFAMILY:
TIGRFAMS:
Pfam
:
interpro 数据库的更多相关文章
- interproscan 软件对序列进行GO 注释
interproscan 软件实际上将对输入的查询序列和interpro 数据库中的序列去比对,将比对上的序列对应的GO信息作为查询序列的GO注释 在interpro 数据库中,每条蛋白质序列有一个唯 ...
- JSP应用开发 -------- 电纸书(未完待续)
http://www.educity.cn/jiaocheng/j9415.html JSP程序员常用的技术 第1章 JSP及其相关技术导航 [本章专家知识导学] JSP是一种编程语言,也是一种动 ...
- 生物信息大数据&数据库(NCBI、EBI、UCSC、TCGA)
想系统的学习生信数据库可以先看一下北大的公开课,有一章专门讲的数据库与软件: -生物信息学:导论与方法 北大\ 生物信息数据库及软件资源 一个优秀的生信开发者能够解决如下问题: 如何鉴定一个重要的且没 ...
- nodejs进阶(6)—连接MySQL数据库
1. 建库连库 连接MySQL数据库需要安装支持 npm install mysql 我们需要提前安装按mysql sever端 建一个数据库mydb1 mysql> CREATE DATABA ...
- GreenDao 数据库:使用Raw文件夹下的数据库文件以及数据库升级
一.使用Raw文件夹下的数据库文件 在使用GreenDao框架时,数据库和数据表都是根据生成的框架代码来自动创建的,从生成的DaoMaster中的OpenHelper类可以看出: public sta ...
- ASP.NET MVC with Entity Framework and CSS一书翻译系列文章之第二章:利用模型类创建视图、控制器和数据库
在这一章中,我们将直接进入项目,并且为产品和分类添加一些基本的模型类.我们将在Entity Framework的代码优先模式下,利用这些模型类创建一个数据库.我们还将学习如何在代码中创建数据库上下文类 ...
- Java MyBatis 插入数据库返回主键
最近在搞一个电商系统中由于业务需求,需要在插入一条产品信息后返回产品Id,刚开始遇到一些坑,这里做下笔记,以防今后忘记. 类似下面这段代码一样获取插入后的主键 User user = new User ...
- 在SQL2008查找某数据库中的列是否存在某个值
在SQL2008查找某数据库中的列是否存在某个值 --SQL2008查找某数据库中的列是否存在某个值 create proc spFind_Column_In_DB ( @type int,--类型: ...
- 分享一个SQLSERVER脚本(计算数据库中各个表的数据量和每行记录所占用空间)
分享一个SQLSERVER脚本(计算数据库中各个表的数据量和每行记录所占用空间) 很多时候我们都需要计算数据库中各个表的数据量和每行记录所占用空间 这里共享一个脚本 CREATE TABLE #tab ...
随机推荐
- webpack配置提取公共代码
公共代码提取功能是针对多入口文件的: 背景:在pageA.js和pageB.js中分别引用subPageA.js和subPageB.js webpack.config.js文件: var path = ...
- 事件驱动模型的简单Java实现
事件驱动模型的原理不再赘述,Swing是不错的实现.别人也有不错的博文来说明原理. 本文的目的是提供一种简单的,可供参考的简短代码,用来帮助理解该模型. Project Navigator Event ...
- LeetCode: Partition List 解题报告
Partition List Given a linked list and a value x, partition it such that all nodes less than x come ...
- 插入中国所有省和市的SQL语句--以后用
需要做根据省市过滤查询的,不得已写入数据库,这个留着方便以后用. 首先创建两张表 drop database if exists BSM; create database BSM; use BSM; ...
- 基于jQuery左右滑动切换特效
分享一款基于脚jQuery左右滑动切换特效.这是一款鼠标点击左右箭头按钮图片滚动切换,鼠标移到图片上显示透明边框特效.效果图如下: 在线预览 源码下载 实现的代码. html代码: <div ...
- Android 开发自己的网络收音机1——功能要求及设计方案
最近打算利用业余时间,编写一个Android的网络收音机.因为我自己偶尔也喜欢听听广播,所以打算用业余时间编写一个网络版收音机.说起收音机,其实在工作中已经编写过一个,不过那个收音机是需要硬件支持,也 ...
- OCMock 3 参考
Typorahtml, body {overflow-x: initial !important;}.CodeMirror { height: auto; } .CodeMirror-scroll { ...
- Winform仿制QQ微信聊天窗口气泡
因为公司业务原因,不能上传原始项目,这是简化版本. 临时设计的窗体和气泡样式,有需要可以重新设计.效果如下: 主要原理:一个TextBlock + 一个三角形 项目结构: -- Form1 窗体类 - ...
- Java并发编程 ReentrantLock 源码分析
ReentrantLock 一个可重入的互斥锁 Lock,它具有与使用 synchronized 方法和语句所访问的隐式监视器锁相同的一些基本行为和语义,但功能更强大. 这个类主要基于AQS(Abst ...
- 使用SoapUI 对WebService压力测试
SoapUI版本:5.0.0 测试步骤: 1.新建测试项目: 2.生成TestSuite以及LoadTest 以上操作完成以后项目如下: 开始测试: 双击LoadTest1,如下图: 点击左上角绿色三 ...