Bioconductor软件安装与升级

1 安装工具
Bioc的软件包不能使用直接install.packages函数，它有自己的安装工具，使用下面的代码：

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite()

上面第二个语句将安装Bioconductor一些基础软件包，包括BiocInstaller软件包，这是必需的。

2 软件包安装
使用biocLite函数，如：

biocLite("affy")
3 升级
biocLite函数可以升级已安装的软件包。但是Bioconductor有版本控制，如果要使用最新软件包，需先升级安装工具。安装工具的升级让人摸不着头脑，经常出错，关键的问题可能是少了这么一个步骤：

remove.packages("BiocInstaller")

即：必需先把老版本的BiocInstaller删除。然后再次：

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite()
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作者：金子哦
来源：CSDN
原文：https://blog.csdn.net/u014801157/article/details/62884401
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