Greenplum 调优--数据倾斜排查(二)
上次有个朋友咨询我一个GP数据倾斜的问题,他说查看gp_toolkit.gp_skew_coefficients表时花费了20-30分钟左右才出来结果,后来指导他分析原因并给出其他方案来查看数据倾斜。
其实很多朋友经常使用如下的方式来检查数据分布:
select gp_segment_id,count(1) from person_info group by 1;

但是这种方法太简单,只有判断存储是否倾斜,不能够去对数据处理是否会出现倾斜做出判断。而且判断的维度很少,不直观。
后来Greenplum提供了gp_toolkit.gp_skew_coefficients等工具来进行检查判断。
首先我们来看一下gp_toolkit.gp_skew_coefficients这个视图的逻辑:
my_db_safe=# \d+ gp_toolkit.gp_skew_coefficients
View "gp_toolkit.gp_skew_coefficients"
View definition: SELECT skew.skewoid AS skcoid, pgn.nspname AS skcnamespace, pgc.relname AS skcrelname, skew.skewval AS skccoeff
FROM gp_toolkit.__gp_skew_coefficients() skew(skewoid, skewval)
JOIN pg_class pgc ON skew.skewoid = pgc.oid
JOIN pg_namespace pgn
ON pgc.relnamespace = pgn.oid;
当我们使用视图gp_toolkit.gp_skew_coefficients来检查表数据倾斜时,该视图会基于表的行数据量来检查,如果表数据量越大,检查时间就会越长。
select * from gp_toolkit.gp_skew_coefficients;

其中skccoeff 通过存储记录均值计算出的标准差,这个值越低说明数据存放约均匀,反之说明数据存储分布不均匀,要考虑分布键选择是否合理。
另外一个视图gp_toolkit.gp_skew_idle_fractions 通过计算表扫描过程中,系统闲置的百分比,帮助用户快速判断,是否存在分布键选择不合理,导致数据处理倾斜的问题。

siffraction字段表示表扫描过程中系统闲置的百分比,比如0.1表示10%的倾斜。
结合上面两个视图的结果,我们可以看到某些表的结论是数据倾斜很厉害,
比如ao_schedule表,但是实际上这些表是因为数据量太少,只有几条,那只能分布在某几个segment节点上,其他segment节点都没有数据,
比如:
select gp_segment_id,count(1) from os.ao_schedule group by 1;

可以看出,os.ao_schedule表只有5条数据,所有判断数据倾斜时要结合多方面来判断。
本文章会介绍一种替代上面两个视图低效查询数据倾斜的方式。
解决方案的原理:这次方案也是使用视图来观察每个segment上的每个表的文件大小。
它将仅仅输出那些表至少一个segment大小比预期的大20%以上。 下面一个工具,一个能够快速给出表倾斜的信息。
执行如下的创建函数的SQL:
CREATE OR REPLACE FUNCTION my_func_for_files_skew() RETURNS void AS $$ DECLARE v_function_name text := 'my_create_func_for_files_skew'; v_location_id int; v_sql text; v_db_oid text; v_number_segments numeric; v_skew_amount numeric; BEGIN --定义代码的位置,方便用来定位问题-- v_location_id := 1000; --获取当前数据库的oid-- SELECT oid INTO v_db_oid FROM pg_database WHERE datname = current_database(); --文件倾斜的视图并创建该视图-- v_location_id := 2000; v_sql := 'DROP VIEW IF EXISTS my_file_skew_view'; v_location_id := 2100; EXECUTE v_sql; --保存db文件的外部表并创建该外部表-- v_location_id := 2200; v_sql := 'DROP EXTERNAL TABLE IF EXISTS my_db_files_web_tbl'; v_location_id := 2300; EXECUTE v_sql; --获取 segment_id,relfilenode,filename,size 信息-- v_location_id := 3000; v_sql := 'CREATE EXTERNAL WEB TABLE my_db_files_web_tbl ' || '(segment_id int, relfilenode text, filename text, size numeric) ' || 'execute E''ls -l $GP_SEG_DATADIR/base/' || v_db_oid || ' | grep gpadmin | ' || E'awk {''''print ENVIRON["GP_SEGMENT_ID"] "\\t" $9 "\\t" ' || 'ENVIRON["GP_SEG_DATADIR"] "/' || v_db_oid || E'/" $9 "\\t" $5''''}'' on all ' || 'format ''text'''; v_location_id := 3100; EXECUTE v_sql; --获取所有primary segment的个数-- v_location_id := 4000; SELECT count(*) INTO v_number_segments FROM gp_segment_configuration WHERE preferred_role = 'p' AND content >= 0; --如果primary segment总数为40个,那么此处v_skew_amount=1.2*0.025=0.03-- v_location_id := 4100; v_skew_amount := 1.2*(1/v_number_segments); --创建记录文件倾斜的视图-- v_location_id := 4200; v_sql := 'CREATE OR REPLACE VIEW my_file_skew_view AS ' || 'SELECT schema_name, ' || 'table_name, ' || 'max(size)/sum(size) as largest_segment_percentage, ' || 'sum(size) as total_size ' || 'FROM ( ' || 'SELECT n.nspname AS schema_name, ' || ' c.relname AS table_name, ' || ' sum(db.size) as size ' || ' FROM my_db_files_web_tbl db ' || ' JOIN pg_class c ON ' || ' split_part(db.relfilenode, ''.'', 1) = c.relfilenode ' || ' JOIN pg_namespace n ON c.relnamespace = n.oid ' || ' WHERE c.relkind = ''r'' ' || ' GROUP BY n.nspname, c.relname, db.segment_id ' || ') as sub ' || 'GROUP BY schema_name, table_name ' || 'HAVING sum(size) > 0 and max(size)/sum(size) > ' || --只记录大于合适的才输出--- v_skew_amount::text || ' ' || 'ORDER BY largest_segment_percentage DESC, schema_name, ' || 'table_name'; v_location_id := 4300; EXECUTE v_sql; EXCEPTION WHEN OTHERS THEN RAISE EXCEPTION '(%:%:%)', v_function_name, v_location_id, sqlerrm;END;$$ language plpgsql;
然后我们执行函数,创建相关的对象:
select my_func_for_files_skew();

这时我们就可以查看我们计划的倾斜表:
select * from my_file_skew_view ;

我们也可以选择按照倾斜度的大小进行排序:
select * from my_file_skew_view order by largest_segment_percentage desc;

根据查看结果,需要我们关注的是largest_segment_percentage这个字段的值,越靠近1说明一个segment上面的数据比集群的其他节点更多,
比如os.ao_variables表的largest_segment_percentage为0.875,说明87.5%的数据在一个segment上面。
我们可以验证一下:

很显然,共有7条数据(总共8条数据)都在gp_segment_id为35的segment上面,占87.5%。
如果大家对Greenplum数据库熟悉的话,就会发现上面工具的一个问题,即表膨胀。
当我们对表执行DML操作时,对于删除的空间并没有立马释放给操作系统,所以我们的计算结果可能会包含这部分大小。
个人建议在执行这个查看表文件倾斜之前,对需要统计的表进行Vacuum回收空间,或使用CTAS方式进行表重建。
另外补充一点,如果你想对单个表进行统计倾斜度时,可以修改函数,添加一个参数,用来传入表名或表的oid即可。
整理自:
https://blog.csdn.net/jiangshouzhuang/article/details/51792580
Greenplum 调优--数据倾斜排查(二)的更多相关文章
- Greenplum 调优--数据倾斜排查(一)
对于分布式数据库来说,QUERY的运行效率取决于最慢的那个节点. 当数据出现倾斜时,某些节点的运算量可能比其他节点大.除了带来运行慢的问题,还有其他的问题,例如导致OOM,或者DISK FULL等问题 ...
- Spark调优 数据倾斜
1. Spark数据倾斜问题 Spark中的数据倾斜问题主要指shuffle过程中出现的数据倾斜问题,是由于不同的key对应的数据量不同导致的不同task所处理的数据量不同的问题. 例如,reduce ...
- spark调优——数据倾斜
Spark中的数据倾斜问题主要指shuffle过程中出现的数据倾斜问题,是由于不同的key对应的数据量不同导致的不同task所处理的数据量不同的问题. 例如,reduce点一共要处理100万条数据,第 ...
- spark性能调优 数据倾斜 内存不足 oom解决办法
[重要] Spark性能调优——扩展篇 : http://blog.csdn.net/zdy0_2004/article/details/51705043
- 1-Spark-1-性能调优-数据倾斜1-特征/常见原因/后果/常见调优方案
数据倾斜特征:个别Task处理大部分数据 后果:1.OOM;2.速度变慢,甚至变得慢的不可接受 常见原因: 数据倾斜的定位: 1.WebUI(查看Task运行的数据量的大小). 2.Log,查看log ...
- 2-Spark-1-性能调优-数据倾斜2-Join/Broadcast的使用场景
技术点:RDD的join操作可能产生数据倾斜,当两个RDD不是非常大的情况下,可以通过Broadcast的方式在reduce端进行类似(Join)的操作: broadcast是进程级别的,只读的. b ...
- Greenplum 调优--VACUUM系统表
Greenplum 调优--VACUUM系统表 1.VACUUM系统表原因 Greenplum是基于MVCC版本控制的,所有的delete并没有删除数据,而是将这一行数据标记为删除, 而且update ...
- [redis]复制机制,调优,故障排查
在redis的安装目录下首先启动一个redis服务,使用默认的配置文件,作为主服务 ubuntu@slave1:~/redis2$ ./redis-server ./redis.conf & ...
- 专访周金可:我们更倾向于Greenplum来解决数据倾斜的问题
周金可,就职于听云,维护MySQL和GreenPlum的正常运行,以及调研适合听云业务场景的数据库技术方案. 听云周金可 9月24日,周金可将参加在北京举办的线下活动,并做主题为<GreenPl ...
随机推荐
- Spring Boot的配置文件-yml文件的集合配置方式
yml集合数据的表示方式: 这种方式是配置普通的字符串—— 如果集合中装的是对象,就这么配置—— 行内配置方式—— map的配置方式——
- thrift原理与架构
是什么: 一个RPC框架.
- 动态script标签同步加载 ps:无打包编译,静态实现静态资源入口动态配置,无编译打包静态资源添加版本号
/**功能:创建动态标签加载css ,js文件,重点是js文件,利用onloading加递归实现动态标签的同步加载用法:在html文件body底部script内部声明并调用下列函数,obj中写要加载的 ...
- Codeforces Round #588 (Div. 1) 简要题解
1. 1229A Marcin and Training Camp 大意: 给定$n$个对$(a_i,b_i)$, 要求选出一个集合, 使得不存在一个元素好于集合中其他所有元素. 若$a_i$的二进制 ...
- 怎样获取全局对象 window
1. 使用window.self window.self === window; // true 2. 使用window.window window.window === window; // tru ...
- 在论坛中出现的比较难的sql问题:26(动态行专列+合并字符串、补足行数)
原文:在论坛中出现的比较难的sql问题:26(动态行专列+合并字符串.补足行数) 最近,在论坛中,遇到了不少比较难的sql问题,虽然自己都能解决,但发现过几天后,就记不起来了,也忘记解决的方法了. 所 ...
- 1.MVC基础-初识MVC,与WebForm比较
1.Net WebForm的开发模式
- 微信小程序 swiper 组件坑
swiper 组件高度被限制为150px了,所以内容无法撑开. 解决办法 给这组件重新设置个高度,然后在把里面的图片设置为自动适应容器大小.图片模式设置为 宽度不变 自动适应高度 <swiper ...
- rem em min-width: 30em 的意思
30em=30rem=30x16px=480px @media only screen and (min-width:30 em){ }
- .NET 对文件和文件夹操作的介绍
1 Directory和File类只包含静态方法,不能被实例化 2 DirectoryInfo和FileInfo他们是有状态的,需要被实例化 //构造函数初始化一个文件的路径 FileInfo myF ...