Adonis 分析 是基于距离矩阵的多变量方差置换分析，

代码示例：

默认使用bray 距离来计算样本间的距离矩阵

参考资料：

https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics/adonis

https://pdfs.semanticscholar.org/038e/8869b676aa365f2afdea935edf3f2003324d.pdf

vegan 包进行Adonis 分析的更多相关文章

  1. vegan 包进行 Bioenv 分析

    Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合: 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 Bray-Curtis ...

  2. R语言 vegan包计算物种累计曲线

    vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: library(vegan) data(BCI) sp1 <- spec ...

  3. 重磅︱R+NLP：text2vec包——New 文本分析生态系统 No.1（一,简介）

    每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 词向量的表示主流的有两种方式,一种当然是耳熟能 ...

  4. 捕获网络数据包并进行分析的开源库-WinPcap

    什么是WinPcap WinPcap是一个基于Win32平台的,用于捕获网络数据包并进行分析的开源库. 大多数网络应用程序通过被广泛使用的操作系统元件来访问网络,比如sockets.  这是一种简单的 ...

  5. 计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers（Wireshark抓包与协议分析实验）

    计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers(Wireshark抓包与协议分析实验) 前言:本博客包含Windows10下安装wget.Wireshark. 一些有用的 ...

  6. [转] TCP数据包重组实现分析

    PS: 这个实现对于某些特定情况未必是最佳实现,可以用数组来代替队列来实现 参照TCP/IP详解第二卷24~29章,详细论述了TCP协议的实现,大概总结一下TCP如何向应用层保证数据包的正确性.可靠性 ...

  7. golang中container/heap包源码分析

    学习golang难免需要分析源码包中一些实现,下面就来说说container/heap包的源码 heap的实现使用到了小根堆,下面先对堆做个简单说明 1. 堆概念 堆是一种经过排序的完全二叉树,其中任 ...

  8. 网络编程-SOCKET开发之----2. TCP粘包现象产生分析

    1. 粘包现象及产生原因 1)概念 指TCP协议中,发送方发送的若干个包数据到接收方接收时粘成一包.发送方粘包:发送方把若干个要发送的数据包封装成一个包,一次性发送,减少网络IO延迟:接收方粘包:接收 ...

  9. 1.Spring Boot入门及其jar包依赖模型分析

    Spring Boot介绍 Spring Boot是由Pivotal团队提供的新框架,其设计目的是简化Spring应用的搭建以及开发过程.其目标是: 为所有Spring开发提供一个从根本上更快,且方便 ...

随机推荐

  1. 开发openfire 消息拦截器插件PacketInterceptor

    开发消息拦截器的步骤跟开发简单插件步骤一样,要开发消息拦截器插件,首先继承PacketInterceptor包拦截类,然后在initializelPlugin()方法中注册拦截器,就可以实现inter ...

  2. strrchr()函数

    函数简介 函数名称: strrchr 函数原型:char *strrchr(const char *str, char c); 所属库: string.h 函数功能:查找一个字符c在另一个字符串str ...

  3. 树型结构递归 实体递归 JSON格式

    用递归实现无限级菜单,产品分类,盖楼式评论.留言等功能. 下列代码不能直接使用 CREATE TABLE [dbo].[P_Category]( [Code] [varchar](36) NOT NU ...

  4. JAVA-JSP内置对象之移除属性

    相关资料:<21天学通Java Web开发> 移除属性1.只需调用相应对象的removeAttribute()方法就可以移除指定属性 RemoveAttributeDemo.jsp < ...

  5. 真机调试报错error ==Error Domain=NSURLErrorDomain Code=-1009 "似乎已断开与互联网的连接。"

    真机调试报错error ==Error Domain=NSURLErrorDomain Code=-1009 "似乎已断开与互联网的连接." 请注意,错误代码是-1009,网上关于 ...

  6. select 操作选中添加、删除操作Javascript

    //添加选中项 function addItem() { var myMember = document.getElementById("myMember"); var other ...

  7. adi 程序烧写

    3.2 U-Boot Console Output Here we need set up minicom to open target board serial console. sudo mini ...

  8. Tomcat性能优化(三) Executor配置

    http://hello-nick-xu.iteye.com/blog/2113853 http://blog.chinaunix.net/uid-12115233-id-3358004.html

  9. keras系列︱迁移学习：利用InceptionV3进行fine-tuning及预测、完美案例（五）

    引自:http://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/72982230 之前在博客<keras系列︱图像多分类训练与利用bottlenec ...

  10. 中断描述符表（Interrupt Descriptor Table，IDT)

    中断描述符表(Interrupt Descriptor Table,IDT)将每个异常或中断向量分别与它们的处理过程联系起来.与GDT和LDT表类似,IDT也是由8字节长描述符组成的一个数组. #pr ...