Adonis 分析 是基于距离矩阵的多变量方差置换分析,

代码示例:

默认使用bray 距离来计算样本间的距离矩阵

参考资料:

https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics/adonis

https://pdfs.semanticscholar.org/038e/8869b676aa365f2afdea935edf3f2003324d.pdf

vegan 包进行Adonis 分析的更多相关文章

  1. vegan 包进行 Bioenv 分析

    Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合: 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 Bray-Curtis ...

  2. R语言 vegan包计算物种累计曲线

    vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: library(vegan) data(BCI) sp1 <- spec ...

  3. 重磅︱R+NLP:text2vec包——New 文本分析生态系统 No.1(一,简介)

    每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 词向量的表示主流的有两种方式,一种当然是耳熟能 ...

  4. 捕获网络数据包并进行分析的开源库-WinPcap

    什么是WinPcap WinPcap是一个基于Win32平台的,用于捕获网络数据包并进行分析的开源库. 大多数网络应用程序通过被广泛使用的操作系统元件来访问网络,比如sockets.  这是一种简单的 ...

  5. 计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers(Wireshark抓包与协议分析实验)

    计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers(Wireshark抓包与协议分析实验) 前言:本博客包含Windows10下安装wget.Wireshark. 一些有用的 ...

  6. [转] TCP数据包重组实现分析

    PS: 这个实现对于某些特定情况未必是最佳实现,可以用数组来代替队列来实现 参照TCP/IP详解第二卷24~29章,详细论述了TCP协议的实现,大概总结一下TCP如何向应用层保证数据包的正确性.可靠性 ...

  7. golang中container/heap包源码分析

    学习golang难免需要分析源码包中一些实现,下面就来说说container/heap包的源码 heap的实现使用到了小根堆,下面先对堆做个简单说明 1. 堆概念 堆是一种经过排序的完全二叉树,其中任 ...

  8. 网络编程-SOCKET开发之----2. TCP粘包现象产生分析

    1. 粘包现象及产生原因 1)概念 指TCP协议中,发送方发送的若干个包数据到接收方接收时粘成一包.发送方粘包:发送方把若干个要发送的数据包封装成一个包,一次性发送,减少网络IO延迟:接收方粘包:接收 ...

  9. 1.Spring Boot入门及其jar包依赖模型分析

    Spring Boot介绍 Spring Boot是由Pivotal团队提供的新框架,其设计目的是简化Spring应用的搭建以及开发过程.其目标是: 为所有Spring开发提供一个从根本上更快,且方便 ...

随机推荐

  1. layui的table中使用switch

    {{# if(false){ }} <input type="checkbox" name="switch" lay-skin="switch& ...

  2. APT典型应用示例

    Ubuntu下的APT(Advanced Packaging Tools,高级软件包管理工具)是用于在Ubuntu下用于软件安装.升级.维护的工具.注意运行apt指令需要root权限. 下面是一个简单 ...

  3. ftell函数使用注意事项

    ftell函数的原型如下: long ftell(FILE *stream); 主要功能是获取FILE指针在当前文件中的位置. 但在使用文本模式打开文件时,ftell函数返回值不一定跟FILE文件指针 ...

  4. java 多线程 29 :多线程组件之 Exchanger

    Exchanger Exchanger,从名字上理解就是交换.Exchanger用于在两个线程之间进行数据交换,注意也只能在两个线程之间进行数据交换.线程会阻塞在Exchanger的exchange方 ...

  5. Redis之 命令行 操作

    一.key pattern 查询相应的key (1)redis允许模糊查询key 有3个通配符  *.?.[] (2)randomkey:返回随机key (3)type key:返回key存储的类型 ...

  6. RMSprop

  7. [WPF源码分析]ContentControl依赖项属性的双向绑定,two-way binding view's DependencyProperty and ViewModel's variable

    问题:自定义控件的依赖项属性和VIewModel中的变量不能双向绑定 解决思路:对比.net源码 PresentationFramework  /   System.Windows.Controls ...

  8. Android——ViewPager滑动背景渐变(自定义view,ViewPager)

    效果: ActivityBackgroundImage,java(自定义视图) package com.example.chenshuai.test322; import android.conten ...

  9. Android——远程存储器存储:JDK方式和Volley框架的get和post

    注意:要搭建好环境,运行 用volley方法时要把包导入project下的模块下的libs目录下 package com.example.chenshuai.myapplication; import ...

  10. svn 剪短笔记

    post-commit.bat @echo off set REPOS="%1" set TXN="%2" "C:\Program Files\Vis ...