vegan 包进行Adonis 分析
Adonis 分析 是基于距离矩阵的多变量方差置换分析,
代码示例:

默认使用bray 距离来计算样本间的距离矩阵
参考资料:
https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics/adonis
https://pdfs.semanticscholar.org/038e/8869b676aa365f2afdea935edf3f2003324d.pdf
vegan 包进行Adonis 分析的更多相关文章
- vegan 包进行 Bioenv 分析
Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合: 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 Bray-Curtis ...
- R语言 vegan包计算物种累计曲线
vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: library(vegan) data(BCI) sp1 <- spec ...
- 重磅︱R+NLP:text2vec包——New 文本分析生态系统 No.1(一,简介)
每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 词向量的表示主流的有两种方式,一种当然是耳熟能 ...
- 捕获网络数据包并进行分析的开源库-WinPcap
什么是WinPcap WinPcap是一个基于Win32平台的,用于捕获网络数据包并进行分析的开源库. 大多数网络应用程序通过被广泛使用的操作系统元件来访问网络,比如sockets. 这是一种简单的 ...
- 计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers(Wireshark抓包与协议分析实验)
计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers(Wireshark抓包与协议分析实验) 前言:本博客包含Windows10下安装wget.Wireshark. 一些有用的 ...
- [转] TCP数据包重组实现分析
PS: 这个实现对于某些特定情况未必是最佳实现,可以用数组来代替队列来实现 参照TCP/IP详解第二卷24~29章,详细论述了TCP协议的实现,大概总结一下TCP如何向应用层保证数据包的正确性.可靠性 ...
- golang中container/heap包源码分析
学习golang难免需要分析源码包中一些实现,下面就来说说container/heap包的源码 heap的实现使用到了小根堆,下面先对堆做个简单说明 1. 堆概念 堆是一种经过排序的完全二叉树,其中任 ...
- 网络编程-SOCKET开发之----2. TCP粘包现象产生分析
1. 粘包现象及产生原因 1)概念 指TCP协议中,发送方发送的若干个包数据到接收方接收时粘成一包.发送方粘包:发送方把若干个要发送的数据包封装成一个包,一次性发送,减少网络IO延迟:接收方粘包:接收 ...
- 1.Spring Boot入门及其jar包依赖模型分析
Spring Boot介绍 Spring Boot是由Pivotal团队提供的新框架,其设计目的是简化Spring应用的搭建以及开发过程.其目标是: 为所有Spring开发提供一个从根本上更快,且方便 ...
随机推荐
- HA&Federation【转】
转自:http://blog.csdn.net/tutucute0000/article/details/39756123 从nameNode1.namenode2克隆出namenode3.namen ...
- Asp.Net时间方法大全
DateTime dt = DateTime.Now; //当前时间 DateTime startWeek = dt.AddDays(- Convert.ToInt32(dt.DayOfWeek.To ...
- crontab入门
参数 crontab是一个处理定时任务的命令,在终端输入man crontab可以得到使用方法提示,主要参数如下: crontab -u # 指定运行的账户,默认为当前账户 crontab -l # ...
- Python爬取爱奇艺【老子传奇】评论数据
# -*- coding: utf-8 -*- import requests import os import csv import time import random base_url = 'h ...
- java 多线程 27 :多线程组件之CountDownLatch
前言 在多线程环境下,JDK给开发者提供了许多的组件供用户使用(主要在java.util.concurrent下),使得用户不需要再去关心在具体场景下要如何写出同时兼顾线程安全性与高效率的代码.之前讲 ...
- (转载)设计模式之-策略模式(Strategy)
原文:http://blog.sina.com.cn/s/blog_48df74430100t2m7.html 前言 部门组织培训,<Effective Java>,每人每天给大家讲解一节 ...
- C#学习笔记(21)——C#获取文件夹下的所有文件的文件名
说明(2017-7-30 23:11:59): 1. 文件处理老是忘,学的不扎实. 2. 路径用Directory,文件名用file. 3. 我也推荐用第二种方法,可以拿到文件的所有信息,比如扩展名什 ...
- 3. 哈工大LTP解析
1. 通俗易懂解释知识图谱(Knowledge Graph) 2. 知识图谱-命名实体识别(NER)详解 3. 哈工大LTP解析 1. 前言 哈工大语言技术平台Language Technology ...
- kali Rolling安装之后的一些常用配置总结(更新)
原文: https://ssooking.github.io/kali-rolling-an-zhuang-zhi-hou-de-yi-xie-chang-yong-pei-zhi-zong-jie/ ...
- PHPUnit 手册(转)
PHPUnit 手册 PHPUnit 手册 Sebastian Bergmann 版权 © 2005, 2006, 2007, 2008, 2009, 2010, 2011, 2012, 2013, ...