Adonis 分析 是基于距离矩阵的多变量方差置换分析,

代码示例:

默认使用bray 距离来计算样本间的距离矩阵

参考资料:

https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics/adonis

https://pdfs.semanticscholar.org/038e/8869b676aa365f2afdea935edf3f2003324d.pdf

vegan 包进行Adonis 分析的更多相关文章

  1. vegan 包进行 Bioenv 分析

    Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合: 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 Bray-Curtis ...

  2. R语言 vegan包计算物种累计曲线

    vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: library(vegan) data(BCI) sp1 <- spec ...

  3. 重磅︱R+NLP:text2vec包——New 文本分析生态系统 No.1(一,简介)

    每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 词向量的表示主流的有两种方式,一种当然是耳熟能 ...

  4. 捕获网络数据包并进行分析的开源库-WinPcap

    什么是WinPcap WinPcap是一个基于Win32平台的,用于捕获网络数据包并进行分析的开源库. 大多数网络应用程序通过被广泛使用的操作系统元件来访问网络,比如sockets.  这是一种简单的 ...

  5. 计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers(Wireshark抓包与协议分析实验)

    计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers(Wireshark抓包与协议分析实验) 前言:本博客包含Windows10下安装wget.Wireshark. 一些有用的 ...

  6. [转] TCP数据包重组实现分析

    PS: 这个实现对于某些特定情况未必是最佳实现,可以用数组来代替队列来实现 参照TCP/IP详解第二卷24~29章,详细论述了TCP协议的实现,大概总结一下TCP如何向应用层保证数据包的正确性.可靠性 ...

  7. golang中container/heap包源码分析

    学习golang难免需要分析源码包中一些实现,下面就来说说container/heap包的源码 heap的实现使用到了小根堆,下面先对堆做个简单说明 1. 堆概念 堆是一种经过排序的完全二叉树,其中任 ...

  8. 网络编程-SOCKET开发之----2. TCP粘包现象产生分析

    1. 粘包现象及产生原因 1)概念 指TCP协议中,发送方发送的若干个包数据到接收方接收时粘成一包.发送方粘包:发送方把若干个要发送的数据包封装成一个包,一次性发送,减少网络IO延迟:接收方粘包:接收 ...

  9. 1.Spring Boot入门及其jar包依赖模型分析

    Spring Boot介绍 Spring Boot是由Pivotal团队提供的新框架,其设计目的是简化Spring应用的搭建以及开发过程.其目标是: 为所有Spring开发提供一个从根本上更快,且方便 ...

随机推荐

  1. 【Windows】windows核心编程整理(下)

    windows核心编程整理(上) windows核心编程整理(下) 线程的堆栈 每当创建一个线程时,系统就会为线程的堆栈(每个线程有他自己的堆栈)保留一个堆栈空间区域,并将一些物理存储器提交给这个以保 ...

  2. 【Linux技术】ubuntu常用命令

    查看软件xxx安装内容:dpkg -L xxx查找软件库中的软件:apt-cache search 正则表达式查找软件库中的软件:aptitude search 软件包查找文件属于哪个包:dpkg - ...

  3. 隐藏windows任务栏中的窗口显示

    在实际应用中遇到类似下列需要: 隐藏windows窗口,在windows任务栏中窗口不可见,但应用程序在后台运行. windows应用程序的窗口默认会在任务栏中添加一个可见的窗口项,方便用户操作和在不 ...

  4. visual c++中预定义的宏

    一.主要目标 (由于visual studio通常包含很多开发环境,通常将其中c/c++的ide称为visual c++ 20xx) 整理下visual c++ 2010下预定义的宏.做一下备忘和了解 ...

  5. Eclipse - Mac Os Default JRE missing

    转:http://stackoverflow.com/questions/1736993/eclipse-mac-os-default-jre-missing 1) Follow Joshua's a ...

  6. SFTP文件上传与下载(window 上传文件到linux服务器)

    一.文件上传 说明1:所谓上传window上的文件上传到linux上 说明2:上传的文件会自动放到当前的用户的家目录 1:打开SFTP的窗口 Alt+p 输入上传命令: 语法: put  path/f ...

  7. C# JAVA 记录代码运行时间

    C# System.Diagnostics.Stopwatch stopwatch = new Stopwatch(); stopwatch.Start(); // 开始监视代码运行时间 // cod ...

  8. struts学习笔记

    ------struts in action 读书笔记 1. ActionServlet:Struts 的ActionServlet控制导航流.当ActionServlet从容器接到一个请求,它使用U ...

  9. 慢速HTTP拒接服务攻击(DoS)复现

    kali linux下有个神奇的工具叫“slowhttptest” 命令:slowhttptest -c 1000 -H -g -o slowhttp -i 10 -r 200 -t GET -u h ...

  10. Android NFC近场通信1——NFC概述

    最近对NFC挺感兴趣,而且新换的手机也支持NFC功能(最近换了Find5,感觉还不错O(∩_∩)O),所以打算学学NFC编程.NFC就是我们经常说的近场通信.通常距离是4厘米或更短.NFC工作频率是1 ...