Clustering 聚类

密度聚类——DBSCAN

  前面我们已经介绍了两种聚类算法:k-means和谱聚类。今天,我们来介绍一种基于密度的聚类算法——DBSCAN,它是最经典的密度聚类算法,是很多算法的基础,拥有很多聚类算法不具有的优势。今天,小编就带你理解密度聚类算法DBSCAN的实质。

DBSCAN

基础概念

作为最经典的密度聚类算法,DBSCAN使用一组关于“邻域”概念的参数来描述样本分布的紧密程度,将具有足够密度的区域划分成簇,且能在有噪声的条件下发现任意形状的簇。在学习具体算法前,我们先定义几个相关的概念:

  • 邻域:对于任意给定样本x和距离ε,x的ε邻域是指到x距离不超过ε的样本的集合;

  • 核心对象:若样本x的ε邻域内至少包含minPts个样本,则x是一个核心对象;

  • 密度直达:若样本b在a的ε邻域内,且a是核心对象,则称样本b由样本x密度直达;

  • 密度可达:对于样本a,b,如果存在样例p1,p2,...,pn,其中,p1=a,pn=b,且序列中每一个样本都与它的前一个样本密度直达,则称样本a与b密度可达;

  • 密度相连:对于样本a和b,若存在样本k使得a与k密度可达,且k与b密度可达,则a与b密度相连。

光看文字是不是绕晕了?下面我们用一个图来简单表示上面的密度关系:

当minPts=3时,虚线圈表示ε邻域,则从图中我们可以观察到:

  • x1是核心对象;

  • x2由x1密度直达;

  • x3由x1密度可达;

  • x3与x4密度相连。

为什么要定义这些看上去差不多又容易把人绕晕的概念呢?其实ε邻域使用(ε,minpts)这两个关键的参数来描述邻域样本分布的紧密程度,规定了在一定邻域阈值内样本的个数(这不就是密度嘛)。那有了这些概念,如何根据密度进行聚类呢?

DBSCAN聚类思想

  DBSCAN聚类的原理很简单:由密度可达关系导出最大密度相连的样本集合(聚类)。这样的一个集合中有一个或多个核心对象,如果只有一个核心对象,则簇中其他非核心对象都在这个核心对象的ε邻域内;如果是多个核心对象,那么任意一个核心对象的ε邻域内一定包含另一个核心对象(否则无法密度可达)。这些核心对象以及包含在它ε邻域内的所有样本构成一个类。

  那么,如何找到这样一个样本集合呢?一开始任意选择一个没有被标记的核心对象,找到它的所有密度可达对象,即一个簇,这些核心对象以及它们ε邻域内的点被标记为同一个类;然后再找一个未标记过的核心对象,重复上边的步骤,直到所有核心对象都被标记为止。

  算法的思想很简单,但是我们必须考虑一些细节问题才能产出一个好的聚类结果:

  • 首先对于一些不存在任何核心对象邻域内的点,再DBSCAN中我们将其标记为离群点(异常);
  • 第二个是距离度量,如欧式距离,在我们要确定ε邻域内的点时,必须要计算样本点到所有点之间的距离,对于样本数较少的场景,还可以应付,如果数据量特别大,一般采用KD树或者球树来快速搜索最近邻,不熟悉这两种方法的同学可以找相关文献看看,这里不再赘述;
  • 第三个问题是如果存在样本到两个核心对象的距离都小于ε,但这两个核心对象不属于同一个类,那么该样本属于哪一个类呢?一般DBSCAN采用先来后到的方法,样本将被标记成先聚成的类。

DBSCAN算法流程

DBSCAN算法小结

  之前我们学过了kmeans算法,用户需要给出聚类的个数k,然而我们往往对k的大小无法确定。DBSCAN算法最大的优势就是无需给定聚类个数k,且能够发现任意形状的聚类,且在聚类过程中能自动识别出离群点。那么,我们在什么时候使用DBSCAN算法来聚类呢?一般来说,如果数据集比较稠密且形状非凸,用密度聚类的方法效果要好一些。

DBSCAN算法优点:

  1. 不需要事先指定聚类个数,且可以发现任意形状的聚类;

  2. 对异常点不敏感,在聚类过程中能自动识别出异常点;

  3. 聚类结果不依赖于节点的遍历顺序;

DBSCAN缺点:

  1. 对于密度不均匀,聚类间分布差异大的数据集,聚类质量变差;

  2. 样本集较大时,算法收敛时间较长;

  3. 调参较复杂,要同时考虑两个参数;

小结:

基于密度的聚类算法是广为使用的算法,特别是对于任意形状聚类以及存在异常点的场景。上面我们也提到了DBSCAN算法的缺点,但是其实很多研究者已经在DBSCAN的基础上做出了改进,实现了多密度的聚类,针对海量数据的场景,提出了micro-cluster的结构来表征距离近的一小部分点,减少存储压力和计算压力...还有很多先进的密度聚类算法及其应用,相信看完这篇文章再去读相关的论文会比较轻松。

扫码关注

获取有趣的算法知识

聚类——密度聚类DBSCAN的更多相关文章

  1. DBSCAN密度聚类算法

    DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise,具有噪声的基于密度的聚类方法)是一种很典型的密度聚类算法,和K-M ...

  2. 基于密度聚类的DBSCAN和kmeans算法比较

    根据各行业特性,人们提出了多种聚类算法,简单分为:基于层次.划分.密度.图论.网格和模型的几大类. 其中,基于密度的聚类算法以DBSCAN最具有代表性.  场景 一 假设有如下图的一组数据, 生成数据 ...

  3. DBSCAN密度聚类

    1. 密度聚类概念 DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise,具有噪声的基于密度的聚类方法)是一种很典型的密 ...

  4. sklearn聚类模型:基于密度的DBSCAN;基于混合高斯模型的GMM

    1 sklearn聚类方法详解 2 对比不同聚类算法在不同数据集上的表现 3 用scikit-learn学习K-Means聚类 4 用scikit-learn学习DBSCAN聚类 (基于密度的聚类) ...

  5. 吴裕雄 python 机器学习——密度聚类DBSCAN模型

    import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn import cluster from sklearn.metrics ...

  6. (数据科学学习手札15)DBSCAN密度聚类法原理简介&Python与R的实现

    DBSCAN算法是一种很典型的密度聚类法,它与K-means等只能对凸样本集进行聚类的算法不同,它也可以处理非凸集. 关于DBSCAN算法的原理,笔者觉得下面这篇写的甚是清楚练达,推荐大家阅读: ht ...

  7. 【转】DBSCAN密度聚类算法

    DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise,具有噪声的基于密度的聚类方法)是一种很典型的密度聚类算法,和K-M ...

  8. 31(1).密度聚类---DBSCAN算法

    密度聚类density-based clustering假设聚类结构能够通过样本分布的紧密程度确定. 密度聚类算法从样本的密度的角度来考察样本之间的可连接性,并基于可连接样本的不断扩张聚类簇,从而获得 ...

  9. 密度聚类 - DBSCAN算法

    参考资料:python机器学习库sklearn——DBSCAN密度聚类,     Python实现DBScan import numpy as np from sklearn.cluster impo ...

随机推荐

  1. 02-25 scikit-learn库之决策树

    目录 scikit-learn库之决策树 一.DecisionTreeClassifier 1.1 使用场景 1.2 代码 1.3 参数详解 1.4 属性 1.5 方法 二.DecisionTreeR ...

  2. java并发之CAS详解

    前言 在高并发的应用当中,最关键的问题就是对共享变量的安全访问,通常我们都是通过加锁的方式,比如说synchronized.Lock来保证原子性,或者在某些应用当中,用voliate来保证变量的可见性 ...

  3. VBS定时关闭软件

    用TXT写以下代码另存为VBS格式,代码如下:doset bag=getobject("winmgmts:\\.\root\cimv2")set pipe=bag.execquer ...

  4. javascript 对象和字符串互转

    Object  =>  String : console.log(JSON.stringify(e)); String => Object : JSON.parse(str)

  5. webapck 按需加载及版本控制问题

    在启用webpack的懒加载(按需加载)后,我们会遇到要解决缓存的问题. 解决缓存问题有几种方法: 第一种就是加个hash值.便每次修改后所编译后的文件名都不一样.这样能达到预期解决缓存的效果.具体设 ...

  6. 剑指Offer(十九)——顺时针打印矩阵

    题目描述 输入一个矩阵,按照从外向里以顺时针的顺序依次打印出每一个数字. 例如,如果输入如下4 X 4矩阵: 1   2    3     4 5   6    7     8 9   10  11  ...

  7. java学习1-初始java程序

    # 第一个简单示例 public class Hello { public static void main(String[] args) { System.out.println("Hel ...

  8. ElasticSearch业务逻辑案例

    ElasticSearch业务逻辑案例 一.业务难题 我们有一个索引: myindex/mytype(为了方便,我们下文以a/b表示) 索引类型中的一个字段group之前是a.b.c(历史遗留问题), ...

  9. 百万年薪python之路 -- 并发编程之 多线程 三

    1. 阻塞,非阻塞,同步,异步 进程运行的三个状态: 运行,就绪,阻塞. 从执行的角度: ​ 阻塞: 进程运行时,遇到IO了,进程挂起,CPU被切走. ​ 非阻塞: 进程没有遇到IO 当进程遇到IO, ...

  10. int和string的相互装换 (c++)

    int和string的相互装换 (c++) int转换为string 第一种方法 to_string函数,这是c++11新增的函数 string to_string (int val); string ...