最近处理数据的时候需要处理一些xml文件,但是xml文件的格式之前并不是很熟悉。幸好R有一些函数可以帮助快速处理xml文件。其中的xmlToList函数尤其方便,可以使你从陌生的XML迅速回到熟悉的R的数据结构。

library(XML)
url_experiment = "ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/dra/fastq/DRA001//DRA001860/DRA001860.experiment.xml"
xml_experiment_list = xmlToList(url_experiment) # 将XML文件转化为R的list
head(xml_experiment_list)
ChIPseq_Library = sapply(xml_experiment_list, function(x) x$TITLE)
#处理转化为list的data即可

R处理xml文件的更多相关文章

  1. 关于android开发添加菜单XML文件之后无法在R.java中生成ID的问题

    因为和同学分开做的android软件,现在想整合他做的界面部分,于是拷贝了res和src文件夹的文件,其中包括一个res.menu文件夹中的XML.但是每次将该文件导入到工程总无法自动在R.java中 ...

  2. 解决:eclipse导入android时工程下没有R文件的问题,以及style.xml文件报错

    解决:eclipse导入android时工程下没有R文件的问题,以及style.xml文件报错

  3. 编写xml文件不当时会出现R文件找不到情况

    1,先检查xml文件是否报错,报错的话直接找到报错行. 2,xml文件若不报错,可能是文本值得格式输入错误 比如android:text=“<0.5km”,此时的小于号就会引发错误,导致R文件找 ...

  4. 解决android中Layout文件下的xml文件配好后,R类中不能自动生成相应代码

    不能更新的原因: 1.在xml文件中代码错误或者格式错误 2.eclipse 编译器是老版本 3.布局文件的文件名有大写字母 4.含有相同文件名.格式的xml文件 解决方法: 1.找到出错的xml文件 ...

  5. eclipse android开发,文本编辑xml文件,给控件添加ID后,R.java,不自动的问题。

    直接编辑xml文件给控件添加id,不自动更新.原来的id写法:@id/et_tel 然后改写成这样:@+id/et_tel  然后就好了!操`1

  6. XML文件解析并利用SimpleAdapter将解析结果显示在Activity中

    首先创建一个实体类 Mp3Info用来存储解析的XML文件中的内容: public class Mp3Info implements Serializable{ private static fina ...

  7. .net中xml文件的导入使用(包括创建xml和导入xml)

    上次有说到.net 创建xml文件的方法(一种固定方式,一种动态方法),这次记录一下怎样导入xml文件 1.导入xml文件的方法 1)xml文件格式

  8. .net中创建xml文件的两种方法

    .net中创建xml文件的两种方法 方法1:根据xml结构一步一步构建xml文档,保存文件(动态方式) 方法2:直接加载xml结构,保存文件(固定方式) 方法1:动态创建xml文档 根据传递的值,构建 ...

  9. java解析XML文件

    dom4j是一个Java的XML API,类似于jdom,用来读写XML文件的.dom4j是一个非常非常优秀的Java XML API,具有性能优异.功能强大和极端易用使用的特点,同时它也是一个开放源 ...

随机推荐

  1. Ubuntu 13.10 Broadcom BCM4313问题

    开始找不到无线网卡,后来不知道怎么就出来了,但是速度很慢.用下面的方法解决的(我也不知道哪条命令起的作用,反正现在正常了): sudo apt-get remove --purge bcmwl-ker ...

  2. FusionCharts ajax 调用方式

    方式一:setJSONUrl function initChart() {                    var myChart = new FusionCharts("Fusion ...

  3. iOS产品开发流程

    iOS产品开发流程 a.产品经理做需求调研,确定产品需求,编写需求文档 b.产品人员完成产品原型 c.产品经理召开会议(产品,UI,UE,开发,测试,服务器) d.设计人员根据原型设计出一系列UI界面 ...

  4. JavaScript中字符串转Json方法小记

    例如: JSON字符串:var str1 = '{ "name": "cxh", "sex": "man" }'; JS ...

  5. python交互模式下cp65001异常

    unknown encoding: cp65001异常 python安装后进入命令行交互模式,输入任何代码都报unknown encoding: cp65001异常 需要将编码(UTF-8)修改为 简 ...

  6. LTP学习

    下载LTP源码和模型文件: https://github.com/linux-test-project/ltp 官方说明文档 http://ltp.readthedocs.org/zh_CN/late ...

  7. scikit-learn 机器学习工具包

    scikit-learn官网:http://scikit-learn.org/stable/ scikit-learn初始化学习:  http://scikit-learn.org/stable/in ...

  8. Linux-编译器gcc/g++编译步骤

    gcc和g++现在是gnu中最主要和最流行的c&c++编译器.g++是c++的命令,以.cpp为主:对于c语言后缀名一般为.c,这时候命令换做gcc即可.编译器是根据gcc还是g++来确定是按 ...

  9. 未能加载文件或程序集“DeveloperKit10.1/DotNet/ESRI.ArcGIS.ADF.Local.或它的某一个依赖项

    使用VS2010进行ArcGIS Engine 10.1进行开发过程中,出现: 错误 1 未能加载文件或程序集“file:///D:/ArcGIS/DeveloperKit10.0/DotNet/ES ...

  10. 未能加载文件或程序集“System.WEB.DataVisualization, Version=3.5.0.0, Culture=neutral

    项目打开 提示 如题错误. 最近用VS2010 + .NET Framework3.5SP1开发程序,使用了MsChart,但是部署到服务器的时候提示如下错误: 分析器错误消息: 未能加载文件或程序集 ...