最近处理数据的时候需要处理一些xml文件，但是xml文件的格式之前并不是很熟悉。幸好R有一些函数可以帮助快速处理xml文件。其中的xmlToList函数尤其方便，可以使你从陌生的XML迅速回到熟悉的R的数据结构。

library(XML)

url_experiment = "ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/dra/fastq/DRA001//DRA001860/DRA001860.experiment.xml"

xml_experiment_list = xmlToList(url_experiment) # 将XML文件转化为R的list

head(xml_experiment_list)

ChIPseq_Library = sapply(xml_experiment_list, function(x) x$TITLE)

#处理转化为list的data即可

R处理xml文件的更多相关文章

  1. 关于android开发添加菜单XML文件之后无法在R.java中生成ID的问题

    因为和同学分开做的android软件,现在想整合他做的界面部分,于是拷贝了res和src文件夹的文件,其中包括一个res.menu文件夹中的XML.但是每次将该文件导入到工程总无法自动在R.java中 ...

  2. 解决：eclipse导入android时工程下没有R文件的问题，以及style.xml文件报错

    解决:eclipse导入android时工程下没有R文件的问题,以及style.xml文件报错

  3. 编写xml文件不当时会出现R文件找不到情况

    1,先检查xml文件是否报错,报错的话直接找到报错行. 2,xml文件若不报错,可能是文本值得格式输入错误 比如android:text=“<0.5km”,此时的小于号就会引发错误,导致R文件找 ...

  4. 解决android中Layout文件下的xml文件配好后,R类中不能自动生成相应代码

    不能更新的原因: 1.在xml文件中代码错误或者格式错误 2.eclipse 编译器是老版本 3.布局文件的文件名有大写字母 4.含有相同文件名.格式的xml文件 解决方法: 1.找到出错的xml文件 ...

  5. eclipse android开发，文本编辑xml文件，给控件添加ID后，R.java，不自动的问题。

    直接编辑xml文件给控件添加id,不自动更新.原来的id写法:@id/et_tel 然后改写成这样:@+id/et_tel  然后就好了!操`1

  6. XML文件解析并利用SimpleAdapter将解析结果显示在Activity中

    首先创建一个实体类 Mp3Info用来存储解析的XML文件中的内容: public class Mp3Info implements Serializable{ private static fina ...

  7. .net中xml文件的导入使用（包括创建xml和导入xml）

    上次有说到.net 创建xml文件的方法(一种固定方式,一种动态方法),这次记录一下怎样导入xml文件 1.导入xml文件的方法 1)xml文件格式

  8. .net中创建xml文件的两种方法

    .net中创建xml文件的两种方法 方法1:根据xml结构一步一步构建xml文档,保存文件(动态方式) 方法2:直接加载xml结构,保存文件(固定方式) 方法1:动态创建xml文档 根据传递的值,构建 ...

  9. java解析XML文件

    dom4j是一个Java的XML API,类似于jdom,用来读写XML文件的.dom4j是一个非常非常优秀的Java XML API,具有性能优异.功能强大和极端易用使用的特点,同时它也是一个开放源 ...

随机推荐

  1. NSDate的运算

    NSDate存储的是世界标准时(UTC),输出时需要根据时区转换为本地时间 Dates NSDate类提供了创建date,比较date以及计算两个date之间间隔的功能.Date对象是不可改变的. 如 ...

  2. 在JavaScript 自定义对象来模拟Java中的Map

    直接看代码: //模拟一个Map对象 function Map(){ //声明一个容器 var container={}; //定义一个put方法,向容器中存值 this.put=function(k ...

  3. set常见操作：

    (1)sadd 向一个集合中添加一个元素.例如:sadd set1 Hello (2)smembers 查看集合中的所有元素.例如:smembers set1 (3)srem 删除集合中一个指定的元素 ...

  4. C#常用实例

    1 時間 1.1 顯示在走的時間 控件:TextBox為顯示日期時間,命名為txtDateTimer Timer為時鐘,命名為time private void dtDateTimer_Tick(ob ...

  5. 蓝桥杯 2015年省赛最后一题 生命之树（树形dp）

    题目描述: 生命之树 在X森林里,上帝创建了生命之树. 他给每棵树的每个节点(叶子也称为一个节点)上,都标了一个整数,代表这个点的和谐值.上帝要在这棵树内选出一个非空节点集S,使得对于S中的任意两个点 ...

  6. iOS开发中XML的DOM和SAX解析方法

    一.介绍 dom是w3c指定的一套规范标准,核心是按树形结构处理数据,dom解析器读入xml文件并在内存中建立一个结构一模一样的“树”,这树各节点和xml各标记对应,通过操纵此“树”来处理xml中的文 ...

  7. 移动设备和SharePoint 2013 - 第3部分：推送通知

    博客地址:http://blog.csdn.net/foxdave 原文地址 在该系列文章中,作者展示了SharePoint 2013最显著的新功能概观--对移动设备的支持. 该系列文章: 移动设备和 ...

  8. Mac下的SVN客户端工具Cornerstone使用教程

    前面几篇文章我介绍SVN服务器的安装,配置,实战.当然其中也加入了一些客户端测试的命令,使用命令当然是一个非常好的选择,但是对我们人类来说还是喜欢图形化界面的操作的.因此本文将介绍我喜欢的一款SVN客 ...

  9. poj1159 dp最长公共子串

    //Accepted 204 KB 891 ms //dp最长公共子串 //dp[i][j]=max(dp[i-1][j],dp[i][j-1]) //dp[i][j]=max(dp[i][j],dp ...

  10. POJ 2887 Big String （块状数组）

    题意:给一个字符串(<=1000000)和n个操作(<2000),每个操作可以在某个位置插入一个字符,或者查询该位置的字符.问查询结果. 思路:块状数组. 如果将原来的字符串都存在一起,每 ...