zero-base和one-base是生信会经常碰到的两套坐标系统。

zero-base是半开放式的，是不包括该点的，zero-base的文件有：bed;bam

one-base是封闭式的，是包括该点的，one-base的文件有：vcf,gff,sam

有人认为zero-base的好处就是在计算长度的时候不用+1，这样能提高编程的简洁性和计算速度，而one-base是便于人眼的观看。

举例：

1.bed文件,半开放式的。

chr1　　200　　220

包含的碱基是从200-219。200<=x<220

2.bismark的结果（zero-base start,one-base end）

chr2 11331 11332 100 1 0

只包括11332这个碱基。

参考资料：

https://www.biostars.org/p/6373/

zero-base coordinate 和one-base coordinate的更多相关文章

  1. Chromosome coordinate systems: 0-based, 1-based

    From: https://arnaudceol.wordpress.com/2014/09/18/chromosome-coordinate-systems-0-based-1-based/ I’v ...

  2. C#中base 关键字的作用

    引用:http://msdn.microsoft.com/en-us/library/hfw7t1ce.aspx base base 关键字用于从派生类中访问基类的成员: 调用基类上已被其他方法重写的 ...

  3. Google之Chromium浏览器源码学习——base公共通用库(四)

    本文将介绍debug调试相关的内容,包括调试器.性能分析.堆跟踪.跟踪事件等: alias.h:Alias函数,提供防止载微软的编译器优化某参数变量的操作,内部通过#pragma optimize(& ...

  4. Yii2的深入学习--yii\base\Event 类

    根据之前一篇文章,我们知道 Yii2 的事件分两类,一是类级别的事件,二是实例级别的事件.类级别的事件是基于 yii\base\Event 实现,实例级别的事件是基于 yii\base\Compone ...

  5. 封装常用的js（Base.js）——【01】理解库，获取节点，连缀，

    封装常用的js(Base.js)——[01]理解库,获取节点,连缀,  youjobit07 2014-10-10 15:32:59 前言:       现如今有太多优秀的开源javascript库, ...

  6. std::reverse_iterator::base

    google chromium base MRU_Cache 支持反向erase iterator Erase(iterator pos) {  deletor_(pos->second);  ...

  7. 【笔记】CAP原理和BASE思想

    摘自http://www.jdon.com/37625 分布式领域CAP理论,Consistency(一致性), 数据一致更新,所有数据变动都是同步的Availability(可用性), 好的响应性能 ...

  8. 如何更改Magento的Base URL

    Magento的Base URL是用于访问商店页面的URL,您也可以为单独一个store view设置一个Base Url.在改这项值之前请确保您的域名已经指向了网站所在服务器的IP,DNS解析完成后 ...

  9. 更改Magento的base url

    Magento的Base URL是用于访问商店页面的URL,您也可以为单独一个store view设置一个Base Url.在改这项值之前请确保您的域名已经指向了网站所在服务器的IP,DNS解析完成后 ...

  10. HTML笔记（七）head相关元素<base> & <meta>

    <head>元素是所有头部元素的容器. 可添加的标签有:<title>.<base>.<link>.<meta>.<script> ...

随机推荐

  1. Bootstrap的js插件之側边栏停靠(affix)

    以下是一个比較常见的側边栏停靠的样例: <!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta cha ...

  2. 《转》架设一个BLOG需要整合多少东西？

    本文转载自大CC 1 Wordpress本身需要花费功夫的地方不多,比较容易,但Themes要花不少功夫调整,有时还得改CSS.推荐几个Wordpress Themes网站: - http://the ...

  3. android sliding menu

    https://github.com/jfeinstein10/SlidingMenu/

  4. 160808、Java的不同版本：J2SE、J2EE、J2ME的区别

    来源:微学苑 在Java中,同一个类中的多个方法可以有相同的名字,只要它们的参数列表不同就可以,这被称为方法重载(method overloading). 参数列表又叫参数签名,包括参数的类型.参数的 ...

  5. MySQL安装和Navicat安装、破解

    1)mysql下载 地址:https://dev.mysql.com/downloads/mysql/ 2)一路next安装,安装好后文件目录如下(不包括data文件夹,my.ini文件) 3)新建文 ...

  6. mysql 中事件

    # 创建存储过程 /* delimiter // create procedure test() begin update test SET name = date_format(now(),'%Y- ...

  7. JavaScript表示x的y次幂

    一.指数运算符(**) 示例 console.log(2 ** 2); // 4 console.log(3 ** 2); // 9 console.log('3' ** '2'); // 9 con ...

  8. jquery根据值设置radio和select选中状态

    1.radio选中: $("input[name=test][value=34]").attr("checked",true);//value=34的radio ...

  9. view简写 TemplateView.as_view()

    view简写 TemplateView.as_view() https://code.ziqiangxuetang.com/django/django-generic-views.html (1)如果 ...

  10. 前端html/css/script基础

    1. 基础模板 <!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charert="utf-8" /> < ...