简单理解：

DAO数据库访问对象 实现连接数据库 修改、添加等细节 
service服务层 面向功能 把一个整个服务 细化 调用DAO
其实service其中都是一些方法 去调用DAO 甚至方法名都和DAO中一样的
如某个service是用作用户注册的
其中可能包括检测用户名是否存在和插入用户数据两部分
分别调用DAO中具体实现 操纵数据库
看起来逻辑更清晰而已

进一步说明：

Dao层实现是简单的CRUD操作。相当于sql中的单条select,insert,upate,delete语句。
而service层就是具体业务的实现。一般多次组合dao层的方法(dao层方法达到了重用目的)，是多个数据库操作的集合，可以看做数据库中的存储过程，而且事务一般控制在service层。这些数据库操作一起提交或回滚。
当然，简单的系统完全可以不划分service层，只用dao层。但那这样的话，代码从用性就不高。

用户的Dao层

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public class UserDaoHibernate extends BaseDaoHibernate implements
        IUserDao {
 
    /**
     * 增加用户
     * 
     * @param user
     */
    public Long addUser(User user) {
        return addEntityRetVal(user);
    }
 
    /**
     * 通过id删除用户
     * 
     * @param user
     */
    public void deleteUser(Long id) {
        User userPO = (User) getHibernateTemplate().load(
                User.class, id);
        deleteEntity(userPO);
    }
 
    /**
     * 删除用户
     * 
     * @param user
     */
    public void deleteUser(User user) {
        User userPO = (User) getHibernateTemplate().load(
                User.class, user.getUserid());
        deleteEntity(userPO);
    }
 
    /**
     * 更新用户
     * 
     * @param user
     */
    public void updateUser(User user) {
        User userPO = (User) getHibernateTemplate().load(
                User.class, user.getUserid());
        BeanUtil.copyProperties(userPO, user);
        updateEntity(userPO);
    }
 
    /**
     * 通过id查询用户
     * 
     * @param id
     * @return
     */
    public User queryUserById(Long id) {
        return (User) getHibernateTemplate().load(User.class, id);
    }
     
    /**
     * 通过用户名字查询用户实体   -- 这个方法存在SQL注入攻击问题
     * @param usernme
     * @return
     */
    public User queryUserByName(String username){
        String hql = "select u from User u where u.username = '" + username + "'";
        return (User) this.queryObjectByHql(hql);
    }
 
    /**
     * 查询所有用户
     * 
     * @return
     */
    public List<User> queryAllUser() {
        return queryAllEntitys(User.class);
    }
 
    /**
     * 分页查询用户
     */
    public List<User> queryAllUser(String hql, int currentPage,
            int pageSize) {
        return queryAllEntitys(currentPage,pageSize,hql);  //调用的是有currentPage的分页方法
    }
 
    /**
     * 
     * 通过用户id查询用户名称,查不到返回 null 
     * @param id
     * @return
     */
    public String queryNameById(Long id){
        String hql = " from User d where d.userId = ?";
        List<?> users = getHibernateTemplate().find(hql,id);
        if(users.size()>0){
           return ((User)users.get(0)).getUsername();
        }else{
           return null;
        }
         
    }
     
 
    /**
     * 得到用户分页记录总数
     * @param parentId
     * @return
     */
    /*
    public Long queryTotalNumberOfUser(){
        String hql = "select count(*) from User";
        List<?> childNumber = getHibernateTemplate().find(hql);
        return (Long)childNumber.get(0);
    }*/
     
    public int queryAllUserNubmer(String hql){
        return queryAllEntitysNumer(hql);
    }
     
    /**
     * 查询用户的权限
     * @param userId
     * @return
     */
    public List<UserAuth> queryFunctionOnlyByUserId(Long userId){
        String hql = "select ua from UserAuth ua where ua.userid = " + userId;
        List<UserAuth>  userAuths = queryAllObjectByHql(hql);
        return userAuths;
    }
 
    /**
     * 查询用户的角色
     * @param userId
     * @return
     */
    @SuppressWarnings("unchecked")
    public List<UserRole> queryRoleOnlyByUserId(Long userId){
        String hql = "select ur from UserRole ur where ur.userid = " + userId;
        List<UserRole>  userAuths =  queryAllObjectByHql(hql);
        return userAuths;
    }
     
     
}

service层，又可细化为查询业务UserHelper，还有增加，更新，删除业务集中在UserFacade中。这里贴出UserHelper.java

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@WebService
public class UserHelper implements IUserHelper {
 
    private IUserDao userDao = null;
    private IDepartmentDao departDao = null;
    private IFunctionHelper functionHelper = null;
    private IRoleHelper roleHelper = null;
 
    public void setUserDao(IUserDao userDao) {
        this.userDao = userDao;
    }
 
    public void setFunctionHelper(IFunctionHelper functionHelper) {
        this.functionHelper = functionHelper;
    }
 
    public void setDepartDao(IDepartmentDao departDao) {
        this.departDao = departDao;
    }
 
    public void setRoleHelper(IRoleHelper roleHelper) {
        this.roleHelper = roleHelper;
    }
 
    /**
     * 通过id查询权限,没有则返回null
     * 
     * @param id
     * @return
     */
    public UserVO queryUserById(Long id) throws GeneralException {
        User user = null;
        try {
            user = userDao.queryUserById(id);
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
            throw new GeneralException("error.userDeatil", "通过id查询权限时出错！");
        }
        // PO 转 VO
        UserVO userVO = userPoToVo(user);
        return userVO;
    }
 
    /**
     * 得到所有权限的集合,没有则返回 null
     * 
     * @return
     */
    public List<UserVO> queryAllUser() throws GeneralException {
        List<UserVO> allFuncVOs = new ArrayList<UserVO>();
        List<User> allFuncs = null;
        try {
            allFuncs = userDao.queryAllUser();
        } catch (Exception e) {
            throw new GeneralException("error.userList", "得到所有权限的集合时出错！");
        }
        for (Iterator<?> iterator = allFuncs.iterator(); iterator.hasNext();) {
            User user = (User) iterator.next();
            // PO 转 VO
            UserVO userVO = userPoToVo(user);
            allFuncVOs.add(userVO);
        }
        return allFuncVOs;
    }
 
 
    /**
     * 权限的PO 到 VO 转换的方法
     * 
     * @param user
     * @return
     */
    public UserVO userPoToVo(User user) throws GeneralException {
        UserVO userVO = new UserVO();
        BeanUtil.copyProperties(userVO, user);
        try {
            userVO.setDepartName(departDao.queryNameById(user.getDepartid())); // 设置部门名称
        } catch (Exception e) {
            throw new GeneralException("error.user", " 权限的PO 到 VO 转换时出错！");
        }
        if(userVO.getStatus().equals("1")){
            userVO.setStatus("可用");
        }else{
            userVO.setStatus("不可用");
        }
        userVO.setRegisterName("ZHANG");
        userVO.setChangerName("ZHANG");
        return userVO;
 
    }
 
    /**
     * 通过分页查询权限信息集合
     * 
     * @param hql
     * @param currentPage
     * @param pageSize
     * @return
     * @throws GeneralException
     */
    public List<UserVO> queryUserByPage(String hql, int currentPage,
            int pageSize) throws GeneralException {
        List<UserVO> allFuncVOs = new ArrayList<UserVO>();
        List<User> allFuncs = null;
        try {
            allFuncs = userDao.queryAllUser(hql, currentPage, pageSize);
        } catch (Exception e) {
            throw new GeneralException("error.userList", "分页得到权限的集合时出错！");
        }
        for (Iterator<?> iterator = allFuncs.iterator(); iterator.hasNext();) {
            User user = (User) iterator.next();
            // PO 转 VO
            UserVO userVO = userPoToVo(user);
            allFuncVOs.add(userVO);
        }
        return allFuncVOs;
    }
 
    /**
     * 返回User分页对象
     * 
     * @param currentPage
     * @return
     */
    public Pagination getPagination(int currentPage, String hql) {
        return new Pagination(currentPage,
                DisplayRecordCount.DISPLAY_IN_USER_LIST, userDao
                        .queryAllUserNubmer(hql));
    }
 
    /**
     * 查到用户的所有角色ID
     * 
     * @param userId
     * @return
     * @throws GeneralException
     */
    public List<Long> queryAllRoleidsOfUser(Long userId)
            throws GeneralException {
        List<Long> rolesOfUser = new ArrayList<Long>();
        List<UserRole> userRoles = null;
        try {
            userRoles = userDao.queryRoleOnlyByUserId(userId); // 查到角色权限
        } catch (Exception e) {
            throw new GeneralException("error.userRoleidsList",
                    "得到用户的角色ID集合出错！");
        }
        for (Iterator<?> iterator = userRoles.iterator(); iterator.hasNext();) {
            UserRole userRole = (UserRole) iterator.next();
            Long roleid = userRole.getRoleid();
            rolesOfUser.add(roleid);
 
        }
        return rolesOfUser;
    }
 
    /**
     * 查到用户的所有角色
     * 
     * @param userId
     * @return
     * @throws GeneralException
     */
    public List<RoleVO> queryAllRoleOfUser(Long userId) throws GeneralException {
        List<Long> rolesOfUser = new ArrayList<Long>();
        List<RoleVO> userRoles = new ArrayList<RoleVO>();
        try {
            rolesOfUser = queryAllRoleidsOfUser(userId);
            for (Iterator<?> iterator = rolesOfUser.iterator(); iterator
                    .hasNext();) {
                Long roleid = (Long) iterator.next();
                RoleVO roleVO = roleHelper.queryRoleById(roleid);
                userRoles.add(roleVO);
            }
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
            throw new GeneralException("error.userRoleList",
                    "得到用户的角色集合出错！");
        }
        return userRoles;
    }
 
    /**
     * 查询用户的所有权限 1.查询所有用户的权限 2.查询所有用户的角色 3.查询所有用户的权限+角色的权限-共同的权限
     * 
     * @param userId
     * @return
     */
    public List<FunctionVO> queryAllFunctionOfUser(Long userId,String system)
            throws GeneralException {
        Set<FunctionVO> userAllFuncs = new HashSet<FunctionVO>();
        List<FunctionVO> userAllFuncsList = new ArrayList<FunctionVO>();
        try {
            List<UserAuth> userFuncs = userDao
                    .queryFunctionOnlyByUserId(userId); // 查到权限
 
            if (userFuncs != null) {
                for (Iterator<?> iterator = userFuncs.iterator(); iterator
                        .hasNext();) {
                    UserAuth userFunc = (UserAuth) iterator.next();
                    Long funcId = userFunc.getFuncid();
                    FunctionVO funcVO = functionHelper
                            .queryFunctionById(funcId);
                    userAllFuncs.add(funcVO);
                }
            }
 
            List<UserRole> userRoles = userDao.queryRoleOnlyByUserId(userId); // 查到角色
 
            if (userRoles != null) {
                // 查到所有角色的所有权限，将权限放入到userAllFuncs中
                for (Iterator<?> iterator = userRoles.iterator(); iterator
                        .hasNext();) {
                    UserRole userRole = (UserRole) iterator.next();
                    Long roleId = userRole.getRoleid();
                    List<FunctionVO> funcVOs = roleHelper
                            .queryFunctionOfRole(roleId);
                    for (Iterator<?> iterator2 = funcVOs.iterator(); iterator2
                            .hasNext();) {
                        FunctionVO functionVO = (FunctionVO) iterator2.next();
                        userAllFuncs.add(functionVO);
                    }
                }
            }
 
            // 将筛选了数据的无序Set集合转换为有序的List集合.一定要从小到大，否则权限树显示就会有问题
 
            for (Iterator<?> iterator = userAllFuncs.iterator(); iterator
                    .hasNext();) {
                 
                FunctionVO userAllFun = (FunctionVO) iterator.next();
                if(system.equals("crm")){
                    if(userAllFun.getFuncid()>=20000000l){
                        userAllFuncsList.add(userAllFun);
                    }
                }else if(system.equals("hr")){
                    if(userAllFun.getFuncid()<20000000l){
                        userAllFuncsList.add(userAllFun);
                    }
                }
            }
 
            FunctionComparator fc = new FunctionComparator();
            Collections.sort(userAllFuncsList, fc);
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
            throw new GeneralException("error.userAllFuncsList", "得到用户的权限集合出错！");
        }
        return userAllFuncsList;
    }
 
}
dao层是sql的增删改查
service层是给dao层得到结果添加业务逻辑
以‘用户登录’为例
dao层只负责查询用户名是username、密码是password的用户返回list
service层添加逻辑判断，list的size如果大于0，返回用户；size小于0，提示‘用户名或密码错误’

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