UMI标签学习【转载】
转自: https://club.1688.com/threadview/50123159.htm
简单介绍一下利用单分子标签(Unique Molecular Identifier,UMI)对残留噪音进行矫正或纠错的原理。
UMI矫正的原理有两个关键点:
第一,以单个DNA分子为测序样本,而不是传统胚系突变检测时所用的样本DNA整体。
第二,通过数量换质量,对标记后的单个DNA分子多次测序(也称为高深度测序),进一步提高单个分子的单碱基准确性。
流程下图所示,先将UMI标签添加至DNA分子(双端添加可用于区分正负链,进一步矫正),然后进行文库富集,这时候,不管是指数还是线性,单个分子都被复制成千万个带有相同标记的分子,然后再进行高通量测序。在测序数据中,通过单分子标记将他们重新聚集在一起统一分析,聚合酶错误和测序错误在高深度测序数据中是零散分布的,统计一致性序列后便得到了矫正后的精确序列,可用于对整个样本中的突变频率进行“绝对定量”。值得一提的是,单个UMI的效率,UMI自身的突变纠错以及不同UMI的均匀性等性能均需要在实际操作中进行优化,但这些都不影响该解决方案的实施。

//关键是通过对很多具有相同umi标签的序列进行 一致性统计,这样才能够确定真实序列信息吧。过滤掉测序错误的或者聚合酶错误的等等。
UMI标签学习【转载】的更多相关文章
- Java多线程学习(转载)
Java多线程学习(转载) 时间:2015-03-14 13:53:14 阅读:137413 评论:4 收藏:3 [点我收藏+] 转载 :http://blog ...
- java struts2入门学习--OGNL语言常用符号和常用标签学习
一.OGNL常用符号(接上一篇文章): 1.#号 1)<s:property value="#request.username"/> 作用于struts2的域对象,而不 ...
- 论文笔记:多标签学习综述(A review on multi-label learning algorithms)
2014 TKDE(IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering) 张敏灵,周志华 简单介绍 传统监督学习主要是单标签学习,而现实生活中目标样 ...
- HTML标签学习总结(2)
点我:HTLM标签学习总结(1) 11. 在网页制作过程过中,可以把一些独立的逻辑部分划分出来,放在一个<div>标签中,这个<div>标签的作用就相当于一个容器. 语法: & ...
- video标签学习使用
video标签学习使用 学习前的理解 video是HTML5中的新标签,可以用来播放视频.对于不同的浏览器支持的视频格式不一样,但是具体浏览器支持的类型并不清楚. 支持的类型 视频的格式分为编码格式和 ...
- HTML基础标签学习
HTML基础学习 前言 HTML基础学习会由HTML基础标签学习.HTML表单学习和一张思维导图总结HTML基础三篇文章构成,文章中博主会提取出重点常用的知识和经常出现的bug,提高学习的效率,后续会 ...
- git添加标签(转载)
From:http://git-scm.com/book/zh/v1/Git-%E5%9F%BA%E7%A1%80-%E6%89%93%E6%A0%87%E7%AD%BE 打标签 同大多数 VCS 一 ...
- html中的一些标签学习
今天看手册学习到了HTML5很多属性.现在总结如下 <body bgcolor="BED1A2" text="FFFFFF" link="yel ...
- (转)DEDECMS模板原理、模板标签学习 - .Little Hann
本文,小瀚想和大家一起来学习一下DEDECMS中目前所使用的模板技术的原理: 什么是编译式模板.解释式模板,它们的区别是什么? 模板标签有哪些种类,它们的区别是什么,都应用在哪些场景? 学习模板的机制 ...
随机推荐
- 【Spring源码分析系列】搭建Spring实现容器的基本实现
前言 bean是Spring中最核心的东西,因为Spring就像一个大水桶,而bean就像是容器中的水,先新建一个小例子来看一下: 一.使用eclipse构建项目,项目结构如下 二.类文件内容 < ...
- openstack-networking-neutron(二)---tun/tap
本博客已经添加"打赏"功能,"打赏"位置位于右边栏红色框中,感谢您赞助的咖啡. 简介 虚拟网卡Tun/tap驱动是一个开源项目,支持很多的类UNIX平台,Ope ...
- Ico初步理解
Ico定义:是一个重要的面向对象编程的法则来削减计算机程序的耦合问题(解耦).通俗理解:把运行中程式的控制权从程式本身那里拿过来,放到配置文件中,通过"反射"找到匹配配置文件总的对 ...
- jquery的ajax()函数中文传值出现乱码完美解决方案
1. jquery的ajax()函数 $.ajax({ type: "POST", dataType: "text", url: ".. ...
- 解决使用Foxmail客户端软件不能收取腾讯企业邮箱的全部邮件
一般说来,使用Foxmail客户端软件收取邮箱时,需要作如下几步: 1.进入邮箱web界面授权开启POP3/SMTP服务.IMAP/SMTP等服务 2.在邮箱web界面配置收取选项,可选择收取全部邮件 ...
- Thinkphp框架下对某个字段查询数据的时候进行唯一过滤,返回唯一不同的值
方法一. DISTINCT 方法用于返回唯一不同的值 . *distinct方法的参数是一个布尔值. 用法: $data = $Model->Distinct(true)->field(' ...
- java中String与StringBuilder的区别
相信大家对 String 和 StringBuffer 的区别也已经很了解了,但是估计还是会有很多同志对这两个类的工作原理有些不清楚的地方,今天我在这里重新把这个概念给大家复习一下,顺便牵出 J2SE ...
- MySQL异步复制
准备:主备库版本一致,正常安装软件. 1.主库上设置一个复制使用的账户: mysql> grant replication slave on *.* to 'rep1'@'192.168.100 ...
- js 基础 函数传值
让我忽略的函数传值问题 function box(num){ num += 10; // num(有色的num) 实际就是arguments[0] ,如果参数没有num,则函数体的num(有色的nu ...
- laravel5.1接收ajax数据
前台: $.ajax({ type: 'POST', url: '{!! url('aw/data') !!}', data:{'_token':'<?php echo csrf_token() ...