bzoj1966: [Ahoi2005]VIRUS 病毒检测
Description
科学家们在Samuel星球上的探险仍在继续。非常幸运的,在Samuel星球的南极附近,探险机器人发现了一个巨大的冰湖!机器人在这个冰湖中搜集到了许多RNA片段运回了实验基地。科学家们经过几个昼夜的研究,发现这些RNA片段中有许多是未知的病毒!每个RNA片段都是由A、C、T、G组成的序列。科学家们也总结出了Samuel星球上的“病毒模版片段”。一个模版片段是由A、C、T、G的序列加上通配符 * 和 ? 来表示。其中 * 的意思是可以匹配上0个或任意多个字符,而 ? 的意思是匹配上任意一个字母。如果一个RNA片段能够和“病毒模版片段”相匹配,那么这个RNA片段就是未知的病毒。例如,假设“病毒模版片段”为A*G?C。RNA片段:AGTC,AGTGTC都是未知的病毒,而RNA片段AGTGC则不是病毒。由于,机器人搜集的这些RNA片段中除去病毒的其他部分都具有非常高的研究价值。所以科学家们希望能够分辨出其中哪些RNA片段不是病毒,并将不是病毒的RNA片段运回宇宙空间站继续进行研究。科学家将这项任务交给了小联。现在请你为小联编写程序统计哪些RNA片段不是病毒。
Input
第一行有一个字符串,由A、C、T、G、*、? 组成。表示“病毒模版片段”。“病毒模版片段”的长度不超过1000。第二行有一个整数N(0<N<500),表示机器人搜集到的RNA片段的数目。随后的N行,每一行有一个字符串,由A、C、T、G组成,表示一个RNA片段。每个RNA片段的长度不超过500。注意:“病毒模版片段”和RNA片段的长度都至少为1。
Output
只有一行输出,为整数M,即不是病毒的RNA片段的数目。
数据范围小所以n3能过。。
模板显然是一个简单的正则表达式,所以建一个NFA然后就可以O(n2)判定一个串是否匹配了,总复杂度还是 O(n3)
#include<cstdio>
#include<vector>
#include<cstring>
int n,ans=;
char s[];
int cid[],p=;
std::vector<int>nx[][];
bool d[],d1[];
void adde(int a,int b,int c){
nx[a][b].push_back(c);
}
int main(){
for(int i=;i<;i++)cid["ATGC#"[i]]=i;
scanf("%s",s+);
int l=strlen(s+),w=,w2=;
s[]=s[++l]='#';
for(int i=;i<=l;i++){
int c=s[i],u=++p;
if(c=='*'){
if(!w2){
for(c=;c<;c++)adde(w,c,u),adde(u,c,u);
w2=w;w=u;
}
}else if(c=='?'){
for(c=;c<;c++)adde(w,c,u);
if(w2){
for(c=;c<;c++)adde(w2,c,u);
w2=;
}
w=u;
}else{
c=cid[c];
adde(w,c,u);
if(w2)adde(w2,c,u),w2=;
w=u;
}
}
scanf("%d",&n);
while(n--){
scanf("%s",s+);
int len=strlen(s+);
s[]=s[++len]='#';
memset(d1,,);
d1[]=;
for(int i=;i<=len;i++){
memcpy(d,d1,p+);
memset(d1,,p+);
int c=cid[s[i]];
for(int j=;j<=p;j++)if(d[j]){
for(int k=;k<nx[j][c].size();k++)d1[nx[j][c][k]]=;
}
}
if(!d1[p])++ans;
}
printf("%d",ans);
return ;
}
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