Interpreting the genomic landscape of speciation: a road map for finding barriers to gene flow

1、摘要

物种形成是种群间生殖隔离的进化过程，是连续的、复杂的，涉及多个相互作用的屏障。在完成之前，这一过程的影响会随着基因组的不同而变化，并可能导致具有分化和分化波峰和波谷的异质性基因组景观。当基因流在物种形成过程中发生时，基因组中局部限制基因流的屏障会导致异质性模式。然而，基因组异质性也可以通过背景选择和选择性扫描、重组和突变率变异以及异质性基因密度等因素的变异产生或改变。从这些修饰因子中提取基因流、分化选择和生殖分离的效应对物种形成基因组学提出了重大挑战。我们认为，该领域的主要目标之一是确定限制基因流动的障碍位点。我们首先在屏障基因座、与之相连的基因组区域以及整个基因组中总结预期的选择特征。然后，我们讨论了使观察到的基因组景观的解释复杂化的修饰因素。最后，我们提出了未来物种形成研究的路线图:如何解释这些改变因素，以及在理解屏障基因座的性质方面取得进展的建议。尽管解释经验数据有困难，但我们认为，有前途的技术和分析方法的可用性将进一步阐明基因流动和不同的选择在形成物种形成的基因组景观方面的重要作用。

2、简介

物种形成是种群间生殖隔离的进化过程。这一过程往往是连续和复杂的，涉及多个种群之间相互作用的生殖障碍的进化，这些障碍并不一定会同时影响整个基因组的变异模式。

名词解释：

1）Geneflow：https://en.wikipedia.org/wiki/Geneflow

2）Background selection：https://en.wikipedia.org/wiki/Background_selection

3）Selective sweep:https://en.wikipedia.org/wiki/Selective_sweep