MATLAB实例:求相关系数、绘制热图并找到强相关对
MATLAB实例:求相关系数、绘制热图并找到强相关对
作者:凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/
用MATLAB编程,求给定数据不同维度之间的相关系数,并绘制热图,保存图片,找到强相关的维度对。
数据集来自UCI中的wine:https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Wine
1. demo.m
clear
clc
etea=0.8; %阈值
% 加载数据
data_load=dlmread('E:\scanplot\wine.data');
data=data_load(:,2:14);
[N, D]=size(data);
% 求维度之间的相关系数
rho = corr(data, 'type','pearson');
% 绘制热图
string_name={'Alcohol','Malic acid','Ash','Alcalinity of ash','Magnesium','Total phenols','Flavanoids','Nonflavanoid phenols','Proanthocyanins','Color intensity','Hue','Diluted wines','Proline'};
xvalues = string_name;
yvalues = string_name;
h = heatmap(xvalues,yvalues,rho, 'FontSize',10, 'FontName','Times New Roman');
h.Title = 'Correlation Coefficient';
colormap(jet)
saveas(gcf,sprintf('wine相关系数热图.jpg'),'bmp'); %保存图片
% 绝对值
rho=abs(rho);
rho_1=rho.*tril(ones(D,D),-1); %下三角
[row, col]=find(rho_1>etea); %找>etea的两个维度
[Num, ~]=size(row);
% A:存放相关系数>etea的两个维度及相关系数值
A=zeros(Num, 3);
for i=1:Num
A(i,:)=[row(i), col(i), rho_1(row(i), col(i))];
fprintf('强线性相关的两个维度是: 第%d个维度: %s与第%d个维度: %s, 两者的相关系数为:%f\n', row(i), string_name{row(i)}, col(i), string_name{col(i)}, rho_1(row(i), col(i)));
end
2. 结果
>> demo
强线性相关的两个维度是: 第7个维度: Flavanoids与第6个维度: Total phenols, 两者的相关系数为:0.864564

MATLAB查看并设置当前颜色图:colormap
MATLAB实例:求相关系数、绘制热图并找到强相关对的更多相关文章
- pheatmap绘制“热图”,你需要的都在这
热图可以聚合大量的数据,并可以用一种渐进色来优雅地表现,可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低. 本文利用R语言 pheatmap 包从头开始绘制各种漂亮的热图.参数像积木,拼凑出你最喜欢的热图即可 ...
- MATLAB实例:散点密度图
MATLAB实例:散点密度图 作者:凯鲁嘎吉 - 博客园http://www.cnblogs.com/kailugaji/ MATLAB绘制用颜色表示数据密度的散点图 数据来源:MATLAB中“fit ...
- MATLAB实例:聚类网络连接图
MATLAB实例:聚类网络连接图 作者:凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/ 本文给出一个简单实例,先生成2维高斯数据,得到数据之后,用模糊C均值( ...
- [R] 如何绘制各样本的pathway丰度热图?
前言 一般而言,我们做完pathway富集分析,就做下气泡图或bar图来进行展示,但它们实际上只考虑了富集因子和Pvalue.如果我们不关注这两个因素,而是在乎样本本身的pathway丰度呢? 对于K ...
- 基于matplotlib的数据可视化 - 热图imshow
热图: Display an image on the axes. 可以用来比较两个矩阵的相似程度 mp.imshow(z, cmap=颜色映射,origin=垂直轴向) imshow( X, cma ...
- 扩增子图表解读3热图:差异菌、OTU及功能
热图是使用颜色来展示数值矩阵的图形.通常还会结合行.列的聚类分析,以表达实验数据多方面的结果. 热图在生物学领域应用广泛,尤其在高通量测序的结果展示中很流行,如样品-基因表达,样品-OTU相对丰度矩 ...
- HTML5 WebAudioAPI(三)--绘制频谱图
HTML <style> #canvas { background: black; } </style> <div class="container" ...
- 用R包中heatmap画热图
一:导入R包及需要画热图的数据 library(pheatmap) data<- read.table("F:/R练习/R测试数据/heatmapdata.txt",head ...
- python matplotlib imshow热图坐标替换/映射
今天遇到了这样一个问题,使用matplotlib绘制热图数组中横纵坐标自然是图片的像素排列顺序, 但是这样带来的问题就是画出来的x,y轴中坐标点的数据任然是x,y在数组中的下标, 实际中我们可能期望坐 ...
随机推荐
- 用Python写一个游戏脚本,你会吗?
前言本文的文字及图片来源于网络,仅供学习.交流使用,不具有任何商业用途,版权归原作者所有,如有问题请及时联系我们以作处理.作者:ivat4u 学习python有一段时间了,由于python语言的强大 ...
- SpringSpringBoot上传文件到七牛云
准备工作 maven pom.xml添加七牛云的sdk依赖 <dependency> <groupId>com.qiniu</groupId> <artifa ...
- 一 UI基本的用法
1. UIView的基本用法 //打印屏幕的宽和高 CGRect screenBounds = [[UIScreen mainScreen] bounds]; NSLog(@"%f, %f& ...
- mysql #1062 - Duplicate entry '2147483647' for key '*'
一.当我看到这报错的时候,第一眼是认为存在重复记录,但是找了很久没找到2147483647 二.一条条的插入数据(有一批数据),直到找到报错的数据,发现是长度超了,定义了int插入的值却有11位长,哭 ...
- freemarker数据格式化问题(即数值超过三位后自动添加逗号问题)
实际数据:{value:1007, name:'通用设备'}, 浏览器回显数据: 得出: freemarker 当数据超过3位的时候,会自动用逗号截取 格式如:1,007 解决办法: 加?c,如:${ ...
- 《Dotnet9》建站-建站20天感悟
时间如流水,只能流去不流回! 点赞再看,养成习惯,这是您给我创作的动力! 本文 Dotnet9 https://dotnet9.com 已收录,站长乐于分享dotnet相关技术,比如Winform.W ...
- sql server重建全库索引和更新全库统计信息通用脚本
重建全库索引: exec sp_msforeachtable 'DBCC DBREINDEX(''?'')' 更新全库统计信息: --更新全部统计信息 exec sp_updatestats 实例反馈 ...
- Django的Form验证(2)
Django的Form验证(2) Form的含义及作用: 用于验证用户请求数据合法性的一个组件(校验数据的合法性) Django的Form实现步骤: 创建一个验证用户请求的模板 from django ...
- 约瑟夫问题 -- python实现
问题描述 N个人围成一个圈, 从第一个人开始报数, 报到M的人出圈, 剩下的人继续从1开始报数, 报到M的人出圈;如此往复, 直到所有人出圈. 列表解决 def solution_list(n, m) ...
- 菜鸟刷面试题(四、Spring/Spring MVC/Spring Boot/Spring Cloud篇)
目录: 为什么要使用 spring? 解释一下什么是 aop? 解释一下什么是 ioc? spring 有哪些主要模块? spring 常用的注入方式有哪些? spring 中的 bean 是线程安全 ...