MATLAB实例:求相关系数、绘制热图并找到强相关对
MATLAB实例:求相关系数、绘制热图并找到强相关对
作者:凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/
用MATLAB编程,求给定数据不同维度之间的相关系数,并绘制热图,保存图片,找到强相关的维度对。
数据集来自UCI中的wine:https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Wine
1. demo.m
clear
clc
etea=0.8; %阈值
% 加载数据
data_load=dlmread('E:\scanplot\wine.data');
data=data_load(:,2:14);
[N, D]=size(data);
% 求维度之间的相关系数
rho = corr(data, 'type','pearson');
% 绘制热图
string_name={'Alcohol','Malic acid','Ash','Alcalinity of ash','Magnesium','Total phenols','Flavanoids','Nonflavanoid phenols','Proanthocyanins','Color intensity','Hue','Diluted wines','Proline'};
xvalues = string_name;
yvalues = string_name;
h = heatmap(xvalues,yvalues,rho, 'FontSize',10, 'FontName','Times New Roman');
h.Title = 'Correlation Coefficient';
colormap(jet)
saveas(gcf,sprintf('wine相关系数热图.jpg'),'bmp'); %保存图片
% 绝对值
rho=abs(rho);
rho_1=rho.*tril(ones(D,D),-1); %下三角
[row, col]=find(rho_1>etea); %找>etea的两个维度
[Num, ~]=size(row);
% A:存放相关系数>etea的两个维度及相关系数值
A=zeros(Num, 3);
for i=1:Num
A(i,:)=[row(i), col(i), rho_1(row(i), col(i))];
fprintf('强线性相关的两个维度是: 第%d个维度: %s与第%d个维度: %s, 两者的相关系数为:%f\n', row(i), string_name{row(i)}, col(i), string_name{col(i)}, rho_1(row(i), col(i)));
end
2. 结果
>> demo
强线性相关的两个维度是: 第7个维度: Flavanoids与第6个维度: Total phenols, 两者的相关系数为:0.864564

MATLAB查看并设置当前颜色图:colormap
MATLAB实例:求相关系数、绘制热图并找到强相关对的更多相关文章
- pheatmap绘制“热图”,你需要的都在这
热图可以聚合大量的数据,并可以用一种渐进色来优雅地表现,可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低. 本文利用R语言 pheatmap 包从头开始绘制各种漂亮的热图.参数像积木,拼凑出你最喜欢的热图即可 ...
- MATLAB实例:散点密度图
MATLAB实例:散点密度图 作者:凯鲁嘎吉 - 博客园http://www.cnblogs.com/kailugaji/ MATLAB绘制用颜色表示数据密度的散点图 数据来源:MATLAB中“fit ...
- MATLAB实例:聚类网络连接图
MATLAB实例:聚类网络连接图 作者:凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/ 本文给出一个简单实例,先生成2维高斯数据,得到数据之后,用模糊C均值( ...
- [R] 如何绘制各样本的pathway丰度热图?
前言 一般而言,我们做完pathway富集分析,就做下气泡图或bar图来进行展示,但它们实际上只考虑了富集因子和Pvalue.如果我们不关注这两个因素,而是在乎样本本身的pathway丰度呢? 对于K ...
- 基于matplotlib的数据可视化 - 热图imshow
热图: Display an image on the axes. 可以用来比较两个矩阵的相似程度 mp.imshow(z, cmap=颜色映射,origin=垂直轴向) imshow( X, cma ...
- 扩增子图表解读3热图:差异菌、OTU及功能
热图是使用颜色来展示数值矩阵的图形.通常还会结合行.列的聚类分析,以表达实验数据多方面的结果. 热图在生物学领域应用广泛,尤其在高通量测序的结果展示中很流行,如样品-基因表达,样品-OTU相对丰度矩 ...
- HTML5 WebAudioAPI(三)--绘制频谱图
HTML <style> #canvas { background: black; } </style> <div class="container" ...
- 用R包中heatmap画热图
一:导入R包及需要画热图的数据 library(pheatmap) data<- read.table("F:/R练习/R测试数据/heatmapdata.txt",head ...
- python matplotlib imshow热图坐标替换/映射
今天遇到了这样一个问题,使用matplotlib绘制热图数组中横纵坐标自然是图片的像素排列顺序, 但是这样带来的问题就是画出来的x,y轴中坐标点的数据任然是x,y在数组中的下标, 实际中我们可能期望坐 ...
随机推荐
- 最小生成树唯一性判断-UESTC1959天才钱vs学霸周
天才钱vs学霸周 Time Limit: 1000 MS Memory Limit: 256 MB Submit Status 有一天,天才钱和学霸周闲的无聊玩起了游戏,游戏内容是这样的,现在 ...
- 层叠机制和继承的概念以及CSS中选择器的优先级
层叠机制: 一个元素的某个特定的样式属性可能来自行间的style属性.内联样式表或者外部引入的样式表,以及浏览器自定义的样式,还有就是继承自父元素的样式,但是最终只会选择其中的某一个来表示,这个选择的 ...
- 云服务器+域名+hexo 搭建博客
1 阿里云服务器安全组规则中启用80,4000,22端口, 记得出方向也要设置,否则... 2 域名指向服务器ip 3 安装git yum install git 4 安装node.js 下载地址为: ...
- 使用Vim编辑器,如何退出
我们输入“冒号”,即":"(不需双引号),在下方会出现冒号,等待输入命令,我输入的是WQ.功能如下. W:write,写入 Q:quit,退出 再回车,就保存退出了 其实,保存退出 ...
- Rabbitmq-单机安装
Rabbitmq介绍 官网地址:https://www.rabbitmq.com RabbitMQ是一款在全球范围内使用非常广泛的开源消息队列中间件.它轻量级.易部署.并支持多种协议.它基于Erl ...
- JAVA 锁的终极状态
自旋锁 背景:互斥同步对性能最大的影响是阻塞,挂起和恢复线程都需要转入内核态中完成:并且通常情况下,共享数据的锁定状态只持续很短的一段时间,为了这很短的一段时间进行上下文切换并不值得. 原理:当一条线 ...
- 还不知道如何实践微服务的Java程序员,这遍文章千万不要错过!
作者:古霜卡比 前言 本文将介绍微服务架构和相关的组件,介绍他们是什么以及为什么要使用微服务架构和这些组件.本文侧重于简明地表达微服务架构的全局图景,因此不会涉及具体如何使用组件等细节. 要理解微服务 ...
- Nginx-HTTP Strict Transport Security(HSTS)
HTTP Strict Transport Security(HSTS) HTTP Strict Transport Security(通常简称为HSTS)是一个安全功能,它告诉浏览器只能通过HTTP ...
- springboot windows10风格 activiti 整合项目框架源码 shiro 安全框架 druid
官网:www.fhadmin.org 此项目为Springboot工作流版本 windows 风格,浏览器访问操作使用,非桌面应用程序. 1.代码生成器: [正反双向](单表.主表.明细表.树形表 ...
- 使用GDAL/OGR读写矢量文件
感觉GIS中矢量相关内容还是挺庞杂的,并且由于版本迭代的关系,使用GDAL/OGR读写矢量的资料也有点不太一样.这里总结了一个读写矢量的示例,实现代码如下: #include <iostream ...