使用maxquant

设定修饰:

设定打分值:

设定有标定量方法:iBAQ,虽然是无标定量方法,但是设定该值后也会有相应有标定量方法的iBAQ值。

根据计算机性能设定线程数:

设定酶切位点

最后生成文件wps不能打开,需要将肽段定量和蛋白定量修改为xls文件

不足:没有中间数据

maxquant|的更多相关文章

  1. 无标定量|有标定量|谱图计数|XIC|AMT数据库|RT对对齐|母离子|子离子|SILVER|SRM|iBAQ|APEX|差异蛋白筛选|MaxQuant|PANDA|C-HPP

    生物医学大数据-蛋白质定量 现今肽段定量效率存在巨大差异.比如相同质量蛋白质,但是肽段和蛋白信号不均一,在物理条件一致时,仅有70%的重复率,并且当重复次数变多时,overlapping在变少. 无标 ...

  2. PEAKS|NovoHMM|Nover|DeepNovo|MAYUPercolator|UniprotKB|Swiss-prot|Mascot|SEQUEST|X!Tandem|pFind|MaxQuant|Msconvert|PEPMASS|LC|

    质谱仪: 质谱分析法是先将大分子电离为带电粒子,按质核比分离,由质谱仪识别电信号得到质谱图. Top-down直接得到结果是蛋白. Bottom down使用shutgun方法得到结果是肽段. 由蛋白 ...

  3. 【6】蛋白质组学鉴定定量软件之MaxQuant

    目录 1.简介 2.下载安装 3.配置与运行 4.结果 5.Perseus后处理 6.小结 1.简介 2016年,德国马普所的Cox和蛋白质组学领域巨擘Matthias Mann合作开发了MaxQua ...

  4. 解读人:李思奇,Development of a sensitive, scalable method for spatial, cell-type-resolved proteomics of the human brain. (一种用于研究人类大脑基于空间或细胞类型的蛋白质组学的灵敏方法)

    发表时间:(2019年4月) 一. 概述: 本文报道了一种可研究人类大脑组织中特定神经细胞的蛋白质组学的方法.作者通过激光捕获显微切割技术(LCM)从逝者大脑中分离出目的神经元细胞,接着尝试了一系列不 ...

  5. MCP|XN|Decreased Antibiotic Susceptibility Driven by Global Remodeling of the Klebsiella pneumoniae Proteome(肺炎杆菌通过整体重构蛋白质组降低抗生素敏感性)

    文献名:Decreased Antibiotic Susceptibility Driven by Global Remodeling of the Klebsiella pneumoniae Pro ...

  6. MCP|LQD|Data-independent acquisition improves quantitative cross-linking mass spectrometry (DIA方法可提升交联质谱定量分析)

    文献名:Data-independent acquisition improves quantitative cross-linking mass spectrometry (DIA方法可提升定量交联 ...

  7. Mol Cell Proteomics. |彭建祥| 人胃肠道间质瘤亚群蛋白质组图谱

    大家好,本周分享的是发表在Molecular & Cellular Proteomics 上的一篇关于人胃肠道间质瘤亚群蛋白质组图谱的文章,题目是Proteomic maps of human ...

  8. Significance A and B for protein ratios

    实验设计中,一般会做三个生物学重复来确保结果的准确性,尤其在下游分析中.但有时会遇到没有生物学重复,而又需要进行差异分析的情况,这时一般建议考虑foldchange即可,因为根本无法进行T-test等 ...

  9. Uncovering thousands of new peptides with sequence-mask-search hybrid de novo peptide sequencing framework (使用序列掩码搜索结合肽段从头测序框架发现了数千个新肽段)-解读人:刘佳维

    期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:(2019年12月) IF:4.828 单位: 朱拉隆功大学 费城威斯塔研究所 物种:人 技术:de novo ...

随机推荐

  1. 201709-2 公共钥匙盒 Java

    思路: 按上课开始时间排一下序,一个时刻一个时刻判断要不要还钥匙,要不要借钥匙 import java.util.ArrayList; import java.util.Collections; im ...

  2. 7)给tab下面添加一个子非模态对话框

    1)还是沿袭(6)那个代码 2)下面是步骤: ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~·~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 然后,修改这个对 ...

  3. JAVE官方文档

    官网地址:http://www.sauronsoftware.it/projects/jave/manual.php JAVE manual Installation and requirements ...

  4. GaussDB数据dump实现完全同步

    问题背景:搭建服务后端容灾集群,服务正常时容灾DB需要从业务DB完全同步数据,服务异常时,容灾DB停止抽取数据,自动从探针采集业务数据. 解决方案:常用的有两种思路,一是从服务后端定时每天拉取业务DB ...

  5. Java final 关键字的用法以及原理(7)

    /* final : 最终.作为一个修饰符, 1:可以修饰类,函数,变量. 2:被final修饰的类不可以被继承.为了避免被继承,被子类复写功能. 3:被final修饰的方法不可以被复写. 4:被fi ...

  6. ElasticSearch使用小结

    最近有个业务需求,即全文搜索关键字查询列表,因而转向ES的学习,也学习了大半个月了,做个笔记,总结下自己的学习历程. 独自学习一项新技术,总是难免走不少弯路的,在此推荐下ES的基础教程,对,好好学习官 ...

  7. mysql安装完之后,登陆后发现只有两个数据库

    mysql安装完之后,登陆后发现只有两个数据库:mysql> show databases;+--------------------+| Database           |+------ ...

  8. 吴裕雄--天生自然ShellX学习笔记:Shell 传递参数

    在执行 Shell 脚本时,向脚本传递参数,脚本内获取参数的格式为:$n.n 代表一个数字,1 为执行脚本的第一个参数,2 为执行脚本的第二个参数,以此类推…… 实例 以下实例我们向脚本传递三个参数, ...

  9. [Typora ] LaTeX公式输入

    [Typora 笔记] 数学输入整理 1.希腊字母表 大写 md 小写 md \(A\) A \(\alpha\) \alpha \(B\) B \(\beta\) \beta \(\Gamma\) ...

  10. Xpath编码问题解决

    使用Xpath获取属性时,出现乱码问题,解决办法找了好多,终于解决,特将办法贴在这,供大家尝试 不要直接简单的将爬取的网页设置为utf-8, 先通过print(r.encoding)输出看看爬取的是什 ...