使用maxquant

设定修饰：

设定打分值：

设定有标定量方法：iBAQ，虽然是无标定量方法，但是设定该值后也会有相应有标定量方法的iBAQ值。

根据计算机性能设定线程数：

设定酶切位点

最后生成文件wps不能打开，需要将肽段定量和蛋白定量修改为xls文件

不足：没有中间数据

maxquant|的更多相关文章

  1. 无标定量|有标定量|谱图计数|XIC|AMT数据库|RT对对齐|母离子|子离子|SILVER|SRM|iBAQ|APEX|差异蛋白筛选|MaxQuant|PANDA|C-HPP

    生物医学大数据-蛋白质定量 现今肽段定量效率存在巨大差异.比如相同质量蛋白质,但是肽段和蛋白信号不均一,在物理条件一致时,仅有70%的重复率,并且当重复次数变多时,overlapping在变少. 无标 ...

  2. PEAKS|NovoHMM|Nover|DeepNovo|MAYUPercolator|UniprotKB|Swiss-prot|Mascot|SEQUEST|X!Tandem|pFind|MaxQuant|Msconvert|PEPMASS|LC|

    质谱仪: 质谱分析法是先将大分子电离为带电粒子,按质核比分离,由质谱仪识别电信号得到质谱图. Top-down直接得到结果是蛋白. Bottom down使用shutgun方法得到结果是肽段. 由蛋白 ...

  3. 【6】蛋白质组学鉴定定量软件之MaxQuant

    目录 1.简介 2.下载安装 3.配置与运行 4.结果 5.Perseus后处理 6.小结 1.简介 2016年,德国马普所的Cox和蛋白质组学领域巨擘Matthias Mann合作开发了MaxQua ...

  4. 解读人：李思奇，Development of a sensitive, scalable method for spatial, cell-type-resolved proteomics of the human brain. (一种用于研究人类大脑基于空间或细胞类型的蛋白质组学的灵敏方法)

    发表时间:(2019年4月) 一. 概述: 本文报道了一种可研究人类大脑组织中特定神经细胞的蛋白质组学的方法.作者通过激光捕获显微切割技术(LCM)从逝者大脑中分离出目的神经元细胞,接着尝试了一系列不 ...

  5. MCP|XN|Decreased Antibiotic Susceptibility Driven by Global Remodeling of the Klebsiella pneumoniae Proteome（肺炎杆菌通过整体重构蛋白质组降低抗生素敏感性）

    文献名:Decreased Antibiotic Susceptibility Driven by Global Remodeling of the Klebsiella pneumoniae Pro ...

  6. MCP|LQD|Data-independent acquisition improves quantitative cross-linking mass spectrometry （DIA方法可提升交联质谱定量分析）

    文献名:Data-independent acquisition improves quantitative cross-linking mass spectrometry (DIA方法可提升定量交联 ...

  7. Mol Cell Proteomics. |彭建祥| 人胃肠道间质瘤亚群蛋白质组图谱

    大家好,本周分享的是发表在Molecular & Cellular Proteomics 上的一篇关于人胃肠道间质瘤亚群蛋白质组图谱的文章,题目是Proteomic maps of human ...

  8. Significance A and B for protein ratios

    实验设计中,一般会做三个生物学重复来确保结果的准确性,尤其在下游分析中.但有时会遇到没有生物学重复,而又需要进行差异分析的情况,这时一般建议考虑foldchange即可,因为根本无法进行T-test等 ...

  9. Uncovering thousands of new peptides with sequence-mask-search hybrid de novo peptide sequencing framework （使用序列掩码搜索结合肽段从头测序框架发现了数千个新肽段）-解读人：刘佳维

    期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:(2019年12月) IF:4.828 单位: 朱拉隆功大学 费城威斯塔研究所 物种:人 技术:de novo ...

随机推荐

  1. Java并发分析—volatile

    在https://www.cnblogs.com/xyzyj/p/11148497.html中已经说明了在多线程并发的情况下,会出现数据的不一致问题,但归根结底就是一个原因,在宏观上就是线程的执行顺序 ...

  2. [Security] Web Security Essentials

    In this course, we'll learn how to exploit and then mitigate several common Web Security Vulnerabili ...

  3. 关于阿里云的远程连接和轻型桌面（xfce4）安装

    这里用的阿里云服务器是轻量应用服务器 先通过网页端的远程连接进入服务器,然后 安装xfce4 (1)先安装更新:apt-get update. (2)安装xrdp:输入apt-get install ...

  4. 运行roscore出现unable to contact my own server无法启动小海龟的部分故障问题解决

    运行roscore后,出现下图这种情况(unable to contact my own server) 原因是找不到http://后面那些,ping不到域名或IP. 参考http://www.ros ...

  5. UOJ #2 【NOI2014】起床困难综合症

    这道题我们设两个bitset(N和Y) \(N_i = cal(i,0) , Y_i=cal(i,1)\) cal(i) 即第i位经过题目中的计算后所得出来的值 然后贪心.倒序循环i,考虑第i位如何决 ...

  6. Hadoop的常用指令

    -help:查看帮助 hadoop fs -help rm -rm [-f] [-r|-R] [-skipTrash] <src> ... : Delete all files that ...

  7. tomcat运行方式详解

    tomcat的运行模式有3种 一.bio(blocking I/O) 即阻塞式I/O操作,表示Tomcat使用的是传统的Java I/O操作(即java.io包及其子包).是基于JAVA的HTTP/1 ...

  8. Ubuntu编译protobuf

    个人博客地址:http://www.bearoom.xyz/2019/08/24/ubunt-protobuf/ 因为编译了tensorflow C++的版本,然后提示protobuf的版本不对应引起 ...

  9. 深度学习在美团配送ETA预估中的探索与实践

    1.背景 ETA(Estimated Time of Arrival,“预计送达时间”),即用户下单后,配送人员在多长时间内将外卖送达到用户手中.送达时间预测的结果,将会以”预计送达时间”的形式,展现 ...

  10. JAVA多线程之状态转换图

    线程状态转换图如下: 1.新建(new):线程对象被创建后就进入了新建状态.如:Thread thread = new Thread(); 2.就绪状态(Runnable):也被称为“可执行状态”.线 ...