MongoDB中的数据存放具有相当的随意性，不具有MySQL在开始就定义好了。对运维人员来说，他们可能不清楚数据库内部数据的数据格式，这也会数据库的运维带来了麻烦。

1. 事务关系支持薄弱。这也是所有NoSQL数据库共同的缺陷，不过NoSQL并不是为了事务关系而设计的，具体应用还是很需求。

2. 稳定性有些欠缺，这点从上面的测试便可以看出。

3. MongoDB一方面在方便开发者的同时，另一方面对运维人员却提出了相当多的要求。业界并没有成熟的MongoDB运维经验，MongoDB中数据的存放格式也很随意，等等问题都对运维人员的考验。

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