vcf-query:

通过 vcf-query 提取DP (reads depth).

~/zengs/Tools/vcftools/perl/vcf-query -f '%CHROM\t%POS\t%REF\t%ALT\t%INFO/DP\n' my.vcf | awk '{if($1==1) print  $1"\t"$2"\t"$3"\t"$4"\t"$5 }'  > my.vcf.DP

　　

vcf-tools 笔记的更多相关文章

  1. Tools - 笔记记录方法Markdown

    Markdown 简介 轻量级标记语言,使用易读易写的纯文本格式和类似HTML的标记语法来编写具有一定的格式的文档. 语法简洁直观,易学易用,可以使用任何喜爱的文本编辑器来阅读和写作. 可精- 确控制 ...

  2. Learning ROS for Robotics Programming Second Edition学习笔记(二) indigo tools

    中文译著已经出版,详情请参考:http://blog.csdn.net/ZhangRelay/article/category/6506865 Learning ROS for Robotics Pr ...

  3. VMware workstation运维实践系列博客导航

    第一章:VMware workstation虚拟化1.1 VMware workstation计算网络存储介绍1.2 VMware workstation其他功能特性介绍1.3 VMware work ...

  4. ROCKETMQ源码分析笔记1：tools

    rocketmq源码解析笔记 大家好,先安利一下自己,本人男,35岁,已婚.目前就职于小资生活(北京),职位是开发总监. 姓名DaneBrown 好了.我保证本文绝不会太监!转载时请附上以上安利信息. ...

  5. Chrome development tools学习笔记(5)

    调试JavaScript 随着如今JavaScript应用的越来越广泛,在面对前端工作的时候,开发人员须要强大的调试工具来高速有效地解决这个问题.我们文章的主角,Chrome DevTools就提供了 ...

  6. Chrome development tools学习笔记(3)

    (上次DOM的部分做了些补充,欢迎查看Chrome development tools学习笔记(2)) 利用DevTools Elements工具来调试页面样式 CSS(Cascading Style ...

  7. Tools - 为知笔记

    为知笔记 Homepage Web登陆 帮助支持 功能 特色功能 发布到blog 便携版制作 模板 如何建立模板 下载为知笔记模版 Markdown http://www.wiz.cn/markdow ...

  8. 【Tools】Pro Git 一二章读书笔记

    记得知乎以前有个问题说:如果用一天的时间学习一门技能,选什么好?里面有个说学会Git是个很不错选择,今天就抽时间感受下Git的魅力吧.   Pro Git (Scott Chacon) 读书笔记:   ...

  9. 【转】树莓派学习笔记——I2C Tools 学习笔记

    原文网址:http://blog.csdn.net/xukai871105/article/details/15029843 1.安装     I2C驱动载入和速率修改请查看博文[树莓派学习笔记——I ...

  10. RH033读书笔记(9)-Lab 10 Understanding the Configuration Tools

    Lab 10 Understanding the Configuration Tools Sequence 1: Configuring the Network with system-config- ...

随机推荐

  1. c#根据当前时间获取本周，本月，本年度等时间段和DateTime日期格式化

    DateTime dt = DateTime.Now; //当前时间 DateTime startWeek = dt.AddDays( - Convert.ToInt32(dt.DayOfWeek.T ...

  2. php签到

    <?php namespace Member\Controller; use Member\Controller\MController; class IndexController exten ...

  3. 22、整合mybatis

    搭建环境: 1).创建工程需要的maven坐标 这个mybatis的starter是mybatis官方出的适应springboot 2).数据连接池的使用 引入Druid数据连接池 <depen ...

  4. XXE攻防——XML外部实体注入

    XXE攻防——XML外部实体注入 转自腾讯安全应急响应中心 一.XML基础知识 XML用于标记电子文件使其具有结构性的标记语言,可以用来标记数据.定义数据类型,是一种允许用户对自己的标记语言进行定义的 ...

  5. 再谈Spring Boot中的乱码和编码问题

    编码算不上一个大问题,即使你什么都不管,也有很大的可能你不会遇到任何问题,因为大部分框架都有默认的编码配置,有很多是UTF-8,那么遇到中文乱码的机会很低,所以很多人也忽视了. Spring系列产品大 ...

  6. 【转】SpringBoot学习笔记(7) SpringBoot整合Dubbo(使用yml配置)

    http://blog.csdn.net/a67474506/article/details/61640548 Dubbo是什么东西我这里就不详细介绍了,自己可以去谷歌 SpringBoot整合Dub ...

  7. python3爬虫编码问题

    使用爬虫爬取网页经常遇到各种编码问题,因此产生乱码今天折腾了一天,全部总结一遍环境:win10,pycharm,python3.41.首先先来网页编码是utf-8的:以百度首页为例:使用request ...

  8. Oracle批量删除表格数据

    在开发阶段往Oracle数据库中多个表格中导入了许多测试数据,倘若一张张表执行"truncate table tablename"语句显得十分繁琐.在PL/SQL中可以用代码进行批 ...

  9. 原生js实现简单轮播的淡入淡出效果

    实现这种淡入淡出的轮播关键在于css的一种设置  首先它不能像传统的轮播显示隐藏 或者左右浮动 他应该让其固定定位使其重叠在一起  达到这种效果  然后设置c3动画属性 transition:1s; ...

  10. PHP 中根据 IP 获取地址

    这里使用的是淘宝 IP 地址库提供的 API 接口. 淘宝 IP 地址库:http://ip.taobao.com/instructions.html API 文档说明:  使用事例: /** * 调 ...