上一篇讲述了data.table数据分析的一些基本方法,但是最近在用作数据分析时,发现在面对一些复杂场景时,这些基本的用法已经不能满足业务需求了,所以此篇就介绍data.table更进一步的用法。

先构建一个数据集,用于测试

name1 <- c("Bob","Mary","Jane","Kim")
weight <- c(60,65,45,55)
height <- c(170,165,140,135)
birth <- c("1990-1","1980-2","1995-5","1996-4")
accept <- c("no","ok","ok","no")
library(data.table)
ndt <- data.table(name1,weight,height,accept)

  设置key还有另外一个函数setkeyv

先去掉现有key

haskey(ndt)
key(ndt)
setkey(ndt,NULL)

 

by=.EACHI参数

by=.EACHI允许按每一个已知i的子集分组,在使用by=.EACHI时需要设置键值 , 必须设置i

.SD参数

.SD是一个data.table,他包含了各个分组,除了by中的变量的所有元素。.SD只能在位置j中使用

SDcols

.SDcols常于.SD用在一起,他可以指定.SD中所包含的列,也就是对.SD取子集

1. 宽数据 -> 长数据 - melt() in reshape2包

anthoming数据集如下所示:

其中expt和ctrl两列可以合并为一列。合并后的数据框相对合并前的叫长数据,而合并前的数据框相对合并后的数据叫宽数据,是不是很贴切呢?

如下R语言代码使用melt函数将上述数据集"拉长":

1
2
# melt函数:首参选定数据框,次参选定记录标识列,variable.name选定拉长后的属性名列,value.name选定拉长后的属性值列
melt(anthoming, id.vars = "angle", variable.name = "condition", value.name = "count")

拉长后的效果:

2. 长数据 -> 宽数据 - dcast() in reshape2包

plum数据集如下所示:

该数据框中length列和time列作为标识列, 如下R语言代码可将该数据框压扁:

1
2
# dcast函数:首参选定数据框,次参选定记录标识列和新的属性名列,value.var选定被拉长的属性值列
dcast(plum, length + time ~ survival, value.var = "count")

压扁后的效果:

下面介绍下data.table包的melt 和 dcast,和reshape2相比大部分参数都相同但是data.table不仅运行速度更快,而且增加了一些reshape2包没有的功能,melt和dcast函数都有改进。

# data.table包中的melt函数
melt(data, id.vars, measure.vars,
variable.name = "variable", value.name = "value",
..., na.rm = FALSE, variable.factor = TRUE,
value.factor = FALSE,
verbose = getOption("datatable.verbose"))

测试数据:

 melt

同样使用了measure.vars参数来控制要被融合的列 

注意到参数明明是id.vars, measure.vars,为什么我使用时就用了id和measure,这是参数的模糊匹配功能,只要提取前面的字符,不会发生歧义,就能代表这个参数,这里可以看到data.table的优势,可以模糊匹配,很方便。

如果用reshape2 包,那么只能

融合之后得到一列自动命名为variable和value,如果我想自己指定名字,就使用variable.name和value.name两个参数,在这个功能上,两个包没有区别。

cast

# data.table中的函数
dcast(data, formula, fun.aggregate = NULL, sep = "_",
..., margins = NULL, subset = NULL, fill = NULL,
drop = TRUE, value.var = guess(data),
verbose = getOption("datatable.verbose"))

两个包相同的参数margins/fill/drop/subset,相同的使用方法

  • margins=T或者字符串向量,可以对得到的矩阵的每行每列在使用该函数计算
  • fill当遇到缺失值时如何填充问题
  • drop是否要去除掉不匹配的行,即全是NA的行
  • subset提取结果的一部分进行展示

测试数据:

DT <- data.table(v1 = rep(1:2, each = 6),
v2 = rep(rep(1:3, 2), each = 2),
v3 = factor(rep(c(1,3),6),levels=1:3),
v4 = rnorm(6))

  

# drop 参数
# v3因子型,2没有出现过,在融合时还会与其他列进行匹配,就会出现一行全是NA的情况

value.var参数
每次输出结果时都会打印出如今选用的作为value的列是什么,我们如果想要自己指定哪一列作为value,就要用value.var参数

 

data.table特有

dcast(DT,v1~v3,mean,value.var=c("v4","v2")) # v3中的元素分别和v2和v4组合,生成四列
dcast(DT,v1~v3,fun=list(sum, mean),value.var="v2") # 同时使用两种计算函数生成四列
dcast(DT,v1~v3,fun=list(sum, mean),value.var=c("v4","v2")) # 二者结合,生成8列
dcast(DT,v1~v3,fun=list(sum, mean),value.var=list("v4","v2")) # v4的使用sum,v2的使用mean,生成4列

  

本文部分借鉴加以实践~~~~~~~~~~~~

R数据处理

 

data.table进阶的更多相关文章

  1. Spring Data JPA进阶——Specifications和Querydsl

    Spring Data JPA进阶--Specifications和Querydsl 本篇介绍一下spring Data JPA中能为数据访问程序的开发带来更多便利的特性,我们知道,Spring Da ...

  2. data.table包

    data.table 1.生成一个data.table对象 生成一个data.table对象,记为DT. library(data.table) :],V3=round(rnorm(),),V4=:) ...

  3. R之data.table -melt/dcast(数据合并和拆分)

    p.p1 { margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px; font: 30.0px "Helvetica Neue"; color: #323333 } p. ...

  4. R之data.table速查手册

    R语言data.table速查手册 介绍 R中的data.table包提供了一个data.frame的高级版本,让你的程序做数据整型的运算速度大大的增加.data.table已经在金融,基因工程学等领 ...

  5. 两种Data Table参数化设置的区别

    首先介绍Data Table的语法: 1.DataTable.value(ParameterID, SheetID) 2.DataTable(ParameterID, SheetID) 以上2种方法的 ...

  6. R语言数据分析利器data.table包 —— 数据框结构处理精讲

        R语言data.table包是自带包data.frame的升级版,用于数据框格式数据的处理,最大的特点快.包括两个方面,一方面是写的快,代码简洁,只要一行命令就可以完成诸多任务,另一方面是处理 ...

  7. R语言基因组数据分析可能会用到的data.table函数整理

    R语言data.table包是自带包data.frame的升级版,用于数据框格式数据的处理,最大的特点快.包括两个方面,一方面是写的快,代码简洁,只要一行命令就可以完成诸多任务,另一方面是处理快,内部 ...

  8. 将基因组数据分类并写出文件,python,awk,R data.table速度PK

    由于基因组数据过大,想进一步用R语言处理担心系统内存不够,因此想着将文件按染色体拆分,发现python,awk,R 语言都能够非常简单快捷的实现,那么速度是否有差距呢,因此在跑几个50G的大文件之前, ...

  9. data.table包简介

    data.table包主要特色是:设置keys.快速分组和滚得时序的快速合并.data.table主要通过二元检索法大大提高数据操作的效率,同时它也兼容适用于data.frame的向量检索法. req ...

随机推荐

  1. svn 脚本替换

    #!/bin/bashfor i in `find /home/20180629tmp/svnfwq/uadminv4 -name .svn` do echo $i aa=`dirname $i` b ...

  2. centos7系统根目录扩容

    比如 点击了后 点击创建虚拟磁盘 选择一个 20G  然后启动虚拟机使用fdisk查看所有的磁盘 看是否新增了一个20G的硬盘 [root@localhost ~]# fdisk -l 磁盘 /dev ...

  3. Task Scheduling

    Introduction In the past, developers have generated a Cron entry for each task they need to schedule ...

  4. treegrid-dnd.js

    (function($){ $.extend($.fn.treegrid.defaults, { onBeforeDrag: function(row){}, // return false to d ...

  5. php juery ajax 传值

    <script src="__PUBLIC__/jquery-1.11.2.min.js" type="text/javascript"></ ...

  6. Spring Boot自动配置类

    http://docs.spring.io/spring-boot/docs/current/api/overview-summary.html http://docs.spring.io/sprin ...

  7. Restful Web Service初识

    一.Web Services Web Services 是一种基于组件的软件平台,是面向服务的Internet 应用.Web Services 框架的核心技术包括SOAP ,WSDL 和UDDI ,它 ...

  8. thinkphp相关功能整合系列

    thinkphp整合系列之短信验证码.订单通知 thinkphp整合系列之rbac的升级版auth权限管理系统demo thinkphp整合系列之阿里云oss thinkphp整合系列之phpmail ...

  9. form 回车键(ENTER)

    <form class="clb_yyxx_nr" name="appointment_content" action="" onsu ...

  10. VS2008设置快捷键Ctrl+W关闭当前打开的文本编辑器窗口

    好多友好的软件关闭多标签页的当前页时都有Ctrl+W的快捷键,如Chrome浏览器,使用起来还是很方便的. 但是作为程序员,使用VS2008时有时会打开好多C++或C#源文件,需要关闭某个源文件时你需 ...