ImageJ软件使用教程（三）：目标计数

目录

• 多点工具法
• 阀值分割法
  • 二值化
  • 填充分割
  • 自动计数
  • 显示结果
• 总结
• 参考资料

本文以钢筋计数为例，讲解一下如何使用ImageJ软件进行计数，这里只介绍两种方法：

• 多点工具法
• 阀值分割法
  
  

钢筋计数是我接触的第一个视觉项目，虽然项目最后不了了之，但作为我机器视觉的开荒项目还是很有纪念意义。

多点工具法

多点工具法适用于数目不多的情况，讲究大力出奇迹，纯手动计数。

右键点工具选择Multi-point Tool激活工具：

双击点工具，设置点的颜色、形状并勾选Label points：

手动点击目标即可计数，按住Alt键点击则可取消该点：

根据最后一个计数可得总共100根，也可以通过Analyze->Measure查看计数结果和标注点的坐标：

如果想把标注点保存在图片中，可以利用Image->Overlay->Flatten创建原始数据的一个副本，最后保存后的副本图片会存有标注点。

阀值分割法

阀值分割法适用于数目较多的情况，全自动化计数，相应的图片预处理会比较麻烦。

二值化

先打开图片，执行以下预处理操作：

• 点击Image->Type->8-bit，将图片转为灰度图
• 点击Image->Adjust->Threshold，调节阀值
• 点击Apply即可得到二值化后的图片

软件会自动给一个合适的阀值，适当调节阀值不要让横截面完全断开即可，横截面粘连和细小干扰项留到后面处理。

填充分割

二值化后，部分横截面存在空隙或粘连现象，可以通过以下操作进行处理：

• 选择 Process->Binary->Fill Holes填补截面空隙
• 选择 Process -> Binary -> Erode 腐蚀边缘毛刺
• 通过 Process->Binary->Watershed打断重叠部分

第二步的腐蚀操作是为了去除毛刺，降低第三步打断的难度，大约腐蚀两次左右即可。

自动计数

先随便选取一个截面大概测试一下面积，具体测量方法参考上一篇教程。这一步很重要，可以根据这个面积值过滤掉一些细小的干扰项。

测量结果如下，面积大概在2000个像素左右：

选择Analyze->Analyze Particles打开窗口，设置Size和Show：

• Size：1000-Infinity——指分析颗粒面积大于300（单位是pixel），一直到无穷大的颗粒（正常截面的面积在2000左右，最小值取1000很合理了）。
• Circularity：0.00-1.00——指圆度，1.00为标准圆，一般不需要设置。
• Show：Overlay Masks——在原图显示结果并标记，可以试试其它几种输出效果。
• 勾选Add to Manager——方便后面把ROI显示到原图。

点击OK弹出计数结果，总计100根钢筋：

显示结果

打开原图，选择Analyze->Tools->ROI Manager：

点击右下角Show All显示结果，根据需要保存图片：

总结

总的来说，多点计数适合数目小的目标计数，而阀值分割法适合数目多的目标计数。不过，如果图片质量比较差的话，使用阈值分割法会比较麻烦。

参考资料

• 【技术干货】超快速度完成细胞计数
• 『零基础』ImageJ + 机器学习图像处理
• ImageJ实用技巧——自动细胞计数(解放双手篇)