【MPI学习7】MPI并行程序设计模式:MPI的进程组和通信域
基于都志辉老师MPI编程书中的第15章内容。
通信域是MPI的重要概念:MPI的通信在通信域的控制和维护下进行 → 所有MPI通信任务都直接或间接用到通信域这一参数 → 对通信域的重组和划分可以方便实现任务的划分
(1)通信域(communicator)是一个综合的通信概念。其包括上下文(context),进程组(group),虚拟处理器拓扑(topology)。其中进程组是比较重要的概念,表示通信域中所有进程的集合。一个通信域对应一个进程组。
(2)进程(process)与进程组(group)的关系。每个进程是客观上唯一的(一个进程对应一个pid号);同一个进程可以属于多个进程组(每个进程在不同进程组中有个各自的rank号);同一个进程可以属于不同的进程组,因此也可以属于不同的通信域。
(3)通信域产生的方法。根据看过的资料,大概有三种方法,先简要了解路子即可:
a. 在已有通信域基础上划分获得:MPI_Comm_split(MPI_Comm comm, int color, int key, MPI_Comm *newcomm)
b. 在已有通信域基础上复制获得:MPI_Comm_dup(MPI_Comm comm, MPI_Comm *newcomm)
c. 在已有进程组的基础上创建获得:MPI_Comm_create(MPI_Comm comm, MPI_Group group, MPI_Comm *newcomm)
(4)进程组产生的方法。进程组(group)可以当成一个集合的概念,可以通过“子、交、并、补”各种方法。所有进程组产生的方法都可以套到集合的各种运算,用到的时候现看函数就可以了。
(5)“当前进程”与“通信域产生函数”。如果在已有进程组的基础上创建新的通信域(即(3)中c方法),则newcomm有两种结果:如果调用MPI_Comm_create的当前进程在group中,则newcomm就是新产生的通信域对象;如果调用MPI_Comm_create的当前进程不在group中,则newcomm就是MPI_COMM_NULL。由于MPI是多进程编程,类似“当前进程”与“通信域产生函数”这种情况会比较频繁的出现,在设计思路上要适应并行编程这种改变。
(6)不同通信域间互不干扰。“互不干扰”严格来说并不完全正确,这里想说的意思是:同一个进程,可以属于不同的通信域;同一个进程可以同时参与不同通信域的通信,互不干扰。
下面通过一个例子来感受一下进程组和通信域在MPI多进程任务划分和处理上的应用。
代码做的事情如下:
(1)共有6个进程,在MPI_COMM_WORLD中的编号分别是{0,1,2,3,4,5}。
(2)将{1,3,5}进程形成一个新的通信域comm1;将编号为{0,2,4}的进程生成一个新的通信域comm2
(3)在comm1中执行MAX归约操作;在comm2中执行MIN归约操作;在MPI_COMM_WORLD中执行SUM归约操作
(4)显示各个通信域中归约操作的结果
具体代码如下:
#include "mpi.h"
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h> #define LEN 5 int main(int argc, char *argv[])
{
MPI_Init(&argc, &argv);
int world_rank, world_size;
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_rank);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_size); MPI_Group world_group;
MPI_Comm_group(MPI_COMM_WORLD, &world_group); int n = ;
const int ranks[] = {,,};
const int ori1[] = {};
const int ori2[] = {};
int root1, root2; // 从world_group进程组中构造出来两个进程组
MPI_Group group1, group2;
MPI_Group_incl(world_group, n, ranks, &group1);
MPI_Group_excl(world_group, n, ranks, &group2);
// 根据group1 group2分别构造两个通信域
MPI_Comm comm1, comm2;
MPI_Comm_create(MPI_COMM_WORLD, group1, &comm1);
MPI_Comm_create(MPI_COMM_WORLD, group2, &comm2); // 维护发送缓冲区和接受缓冲区
int i;
double *sbuf, *rbuf1, *rbuf2, *rbuf3;
sbuf = malloc(LEN*sizeof(double));
rbuf1 = malloc(LEN*sizeof(double));
rbuf2 = malloc(LEN*sizeof(double));
rbuf3 = malloc(LEN*sizeof(double));
srand(world_rank*);
for(i=; i<LEN; i++) sbuf[i] = (1.0*rand()) / RAND_MAX;
fprintf(stderr,"rank %d:\t", world_rank);
for(i=; i<LEN; i++) fprintf(stderr,"%f\t",sbuf[i]);
fprintf(stderr,"\n");
MPI_Group_translate_ranks(world_group, , ori1, group1, &root1);
MPI_Group_translate_ranks(world_group, , ori2, group2, &root2);
// MPI_COMM_WORLD comm1 comm2分别执行不同的归约操作
if (MPI_COMM_NULL!=comm1) { // comm1
MPI_Reduce(sbuf, rbuf1, LEN, MPI_DOUBLE, MPI_MAX, root1, comm1);
int rank_1;
MPI_Comm_rank(comm1, &rank_1);
if (root1==rank_1) {
fprintf(stderr,"MAX:\t");
for(i=; i<LEN; i++) fprintf(stderr,"%f\t",rbuf1[i]);
fprintf(stderr,"\n");
}
}
else if (MPI_COMM_NULL!=comm2) { // comm2
MPI_Reduce(sbuf, rbuf2, LEN, MPI_DOUBLE, MPI_MIN, root2, comm2);
int rank_2;
MPI_Comm_rank(comm2, &rank_2);
if (root2==rank_2) {
fprintf(stderr,"MIN:\t");
for(i=; i<LEN; i++) fprintf(stderr,"%f\t",rbuf2[i]);
fprintf(stderr,"\n");
}
}
MPI_Reduce(sbuf, rbuf3, LEN, MPI_DOUBLE, MPI_SUM, , MPI_COMM_WORLD); // MPI_COMM_WORLD
if (==world_rank) {
fprintf(stderr,"SUM:\t");
for(i=; i<LEN; i++) fprintf(stderr,"%f\t",rbuf3[i]);
fprintf(stderr,"\n");
}
// 清理进程组和通信域
if(MPI_GROUP_NULL!=group1) MPI_Group_free(&group1);
if(MPI_GROUP_NULL!=group2) MPI_Group_free(&group2);
if(MPI_COMM_NULL!=comm1) MPI_Comm_free(&comm1);
if(MPI_COMM_NULL!=comm2) MPI_Comm_free(&comm2);
MPI_Finalize();
}
代码执行结果如下:

可以看到:
a. MIN归约操作针对的是{0,2,4}
b. MAX归约操作针对的是{1,3,5}
c. SUM归约操作针对的是{0,1,2,3,4,5}
d. SUM与MIN或MAX归约操作在时间上可能是重叠的,参与归约操作的进程也有重叠,但在结果上没有互相干扰。
(7)组间通信域。不同的通信域之间也可以通信,核心的操作是需要构造一个新的通信域类型——组间通信域。与一般的通信域不同,组间通信域包含两个进程组:本地进程组,远程进程组。通过组间通信域可以实现上述两个不同进程组内进程之间的通信。组间通信域的创建,需要在本地组和远程组中的相关进程中都调用创建语句,而且创建语句的参数中local_leader和remote_leader还是对称的。
#include "mpi.h"
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h> int main(int argc, char *argv[])
{
MPI_Comm myComm; // 标示本地子组的组内通信域
MPI_Comm myFirstComm; // 组间通信域
MPI_Comm mySecondComm; // 组间通信域
int color; // split用到的key
int rank; MPI_Init(&argc, &argv);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank); // 划分子通信域
// split是如何划分的 翻阅了英文的mpi tutorial教程
// 通过split函数中第三个参数来控制 当前进程在新的通信域中的新rank值大小
color = rank % ;
MPI_Comm_split(MPI_COMM_WORLD, color, rank, &myComm); // 建立组间通信域
// 需要确定的问题是:
// 1. A1和A2构造的是01之间的通信域 A1的local leader和remote leader与A2的local leader和remote leader是不是互相对应的
// 2. 同理 B1和B2构造的是12之间的组间通信域 local leader和remote leader是否也是互相对应的
// 这是可以保证的 通过MPI_Comm_split语句中的第三个参数来保证
if (==color) {
// 01之间的组间通信域
// 1. 本地组的leader是0
// 2. remote组的leader在MPI_COMM_WORLD中的rank是1
// 3. tag是1 (tag起到什么作用?)
// 4. 组间通信域存在myFirstComm中
MPI_Intercomm_create(myComm, , MPI_COMM_WORLD, , , &myFirstComm); // A1
}
else if (==color) {
// 01之间的组间通信域
// 1. 本地组的leader是0 (本地组leader0应该是MPI_COMM_WORLD中的1 这是如何保证的?)
// 2. 同理, MPI_COMM_WORLD中的0应该是color=0那个组中rank为0的进程 这是如何保证的?
MPI_Intercomm_create(myComm, , MPI_COMM_WORLD, , , &myFirstComm); // A2
// 12之间的组间通信域
MPI_Intercomm_create(myComm, , MPI_COMM_WORLD, , , &mySecondComm); // B1
}
else if (==color) {
// 21之间的组间通信域
MPI_Intercomm_create(myComm, , MPI_COMM_WORLD, , , &myFirstComm); // B2
} if (==color || ==color) {
MPI_Comm_free(&myFirstComm);
}
else if (==color) {
MPI_Comm_free(&myFirstComm);
MPI_Comm_free(&mySecondComm);
}
MPI_Finalize();
}
【MPI学习7】MPI并行程序设计模式:MPI的进程组和通信域的更多相关文章
- 【MPI学习5】MPI并行程序设计模式:组通信MPI程序设计
相关章节:第13章组通信MPI程序设计. MPI组通信与点到点通信的一个重要区别就是:组通信需要特定组内所有成员参与,而点对点通信只涉及到发送方和接收方. 由于需要组内所有成员参与,因此也是一种比较复 ...
- 【MPI学习6】MPI并行程序设计模式:具有不连续数据发送的MPI程序设计
基于都志辉老师<MPI并行程序设计模式>第14章内容. 前面接触到的MPI发送的数据类型都是连续型的数据.非连续类型的数据,MPI也可以发送,但是需要预先处理,大概有两类方法: (1)用户 ...
- Java进阶7 并发优化2 并行程序设计模式
Java进阶7 并发优化2 并行程序设计模式20131114 1.Master-worker模式 前面讲解了Future模式,并且使用了简单的FutureTask来实现并发中的Future模式.下面介 ...
- 【MPI学习2】MPI并行程序设计模式:对等模式 & 主从模式
这里的内容主要是都志辉老师<高性能计算之并行编程技术——MPI并行程序设计> 书上有一些代码是FORTAN的,我在学习的过程中,将其都转换成C的代码,便于统一记录. 这章内容分为两个部分: ...
- 【MPI学习4】MPI并行程序设计模式:非阻塞通信MPI程序设计
这一章讲了MPI非阻塞通信的原理和一些函数接口,最后再用非阻塞通信方式实现Jacobi迭代,记录学习中的一些知识. (1)阻塞通信与非阻塞通信 阻塞通信调用时,整个程序只能执行通信相关的内容,而无法执 ...
- 【MPI学习3】MPI并行程序设计模式:不同通信模式MPI并行程序的设计
学习了MPI四种通信模式 及其函数用法: (1)标准通信模式:MPI_SEND (2)缓存通信模式:MPI_BSEND (3)同步通信模式:MPI_SSEND (4)就绪通信模式:MPI_RSEND ...
- Java并行程序设计模式小结
这里总结几种常用的并行程序设计方法,其中部分文字源自<Java程序性能优化>一书中,还有部分文字属于个人总结,如有不对,请大家指出讨论. Future模式 一句话,将客户端请求的处理过程从 ...
- 并行程序设计模式--Master-Worker模式
简介 Master-Worker模式是常用的并行设计模式.它的核心思想是,系统有两个进程协议工作:Master进程和Worker进程.Master进程负责接收和分配任务,Worker进程负责处理子任务 ...
- 转 Master-Worker模式 并行程序设计模式--Master-Worker模式
简介 Master-Worker模式是常用的并行设计模式.它的核心思想是,系统有两个进程协议工作:Master进程和Worker进程.Master进程负责接收和分配任务,Worker进程负责处理子任务 ...
随机推荐
- C#程序调用cmd执行命令
对于C#通过程序来调用cmd命令的操作,网上有很多类似的文章,但很多都不行,竟是漫天的拷贝.我自己测试整理了一下. 代码: string str = Console.ReadLine(); Syste ...
- Java读写txt文件
1.Java读取txt文件 1.1.使用FileInputStream: public static String readFile(File file, String charset){ //设置默 ...
- JSON转换类(一)--过滤特殊字符,格式化字符型、日期型、布尔型
/// <summary> /// 过滤特殊字符 /// </summary> private static string String2Json(String s) { St ...
- springMVC+jsp+ajax上传文件
工作中遇到的小问题,做个笔记 实现springMVC + jsp + ajax 上传文件 HTML <body> <form id="myform" method ...
- Solr字段配置错误
在站内搜索Solr Schema设计时,有个FTS_URL字段(之前设计url也会参与检索和打分),因此其配置信息如下: <field name="FTS_URL" type ...
- java方法可变参数的写法
jdk1.5之后出现的,该写法避免了当有多个不同个数的参数方法时,对方法的重载.其实就是数组. package com.shipin; /** * @author QiaoJiafei * @vers ...
- 怎样用ZBrush快速雕刻皮肤纹理
今天的ZBrush教程我们将对利用基础笔刷制作出的“亡灵僵尸”头部模型进行皮肤纹理的处理,主要用到了Layers 3D图层和Alpha笔触类型添加皮肤纹理. 详细的视频教程地址可前往:http://w ...
- HDU 5029 Relief grain --树链剖分第一题
题意:给一棵树,每次给两个节点间的所有节点发放第k种东西,问最后每个节点拿到的最多的东西是哪种. 解法:解决树的路径上的修改查询问题一般用到的是树链剖分+线段树,以前不会写,后来学了一下树链剖分,感觉 ...
- HTML设置超链接字体颜色和点击后的字体颜色
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/ ...
- 仙人掌(cactus)
仙人掌(cactus) Time Limit:1000ms Memory Limit:64MB 题目描述 LYK 在冲刺清华集训(THUSC) !于是它开始研究仙人掌,它想来和你一起分享它最近研究的 ...