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# Copyright (C) 2015 All rights reserved.
#
# 文件名称:p.pl
# 创 建 者:
# 创建日期:2015年05月11日
# 描 述:
#
# 备 注:
#
######################################################################### use strict;
use warnings;
use Time::HiRes;
# please add your code here!
my $tmStarted=Time::HiRes::time;
if ( != scalar @ARGV)
{
&PrintUsage();
exit ;
}
=pod
Subroutine(s);
=cut
sub PrintUsage
{
print STDERR "perl program.pl [IN] ref_file [IN] input_file [OUT] output_file\n";
}
my $line = "";
my $linecount = ;
my %hash = ();
open FIN, "<$ARGV[0]" or die "can not open inputfile:$!\n";
open FOUT, ">$ARGV[1]" or die "can not create outputfile :$!\n";
while(defined($line=<FIN>))
{
chomp $line;
my @vec = split /\t/, $line;
my $size = scalar @vec;
if ($size < )
{
print STDERR "$line\n";
}
if (not defined($hash{$vec[]}))
{
my @vectemp = ();
push @vectemp, $vec[];
$hash{$vec[]} = \@vectemp;
}
else
{
push @{$hash{$vec[]}}, $vec[];
} }
close FIN;
foreach my $key (keys%hash)
{
my @vec2 = @{$hash{$key}};
my $size = scalar @vec2;
my $part = "";
for (my $i = ; $i <$size; $i++)
{
$part.=$vec2[$i];
if ($i < $size - )
{
$part.=",";
}
}
print FOUT "$key\t$part\n";
}
close FOUT;
print STDERR "$0 has finished,congratulations!\n";
print STDERR "Time elapsed:".(Time::HiRes::time-$tmStarted)."\n";

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