POJ 3691 AC自动机上的dp
题目大意:
给定一些不合理的DNA序列,再给一段较长的dna序列,问最少修改几次可以使序列中不存在任何不合理序列,不能找到修改方法输出-1
这里你修改某一个点的DNA可能会影响后面,我们不能单纯的找匹配数,因为你找到了你也不一定有方法改变它
这里用DP来解决
判断到第i位dna , 之前dp值保存了前面dna所能到达的所有状态:
dp[i][j] 也就是用了前i个dna所到达的状态至少需要修改的值
从所有状态出发,经过AGCT4种情况到达下一个状态,只要下一个状态不为非法状态即可
过程中只要判断你走的AGCT4种情况是否和当前字符相同,相同说明不用做出改变,即+0 , 否则+1,不断进行更新
#include <cstdio>
#include <cstring>
#include <queue>
#include <vector>
#include <iostream>
#include <algorithm>
#include <map>
using namespace std;
#define clr(x) memset(x , 0 , sizeof(x))
#define set(x) memset(x , -1 , sizeof(x))
typedef long long LL ; const int CHAR_SIZE = ;
const int MAX_SIZE = ;
const int M = ;
int n,m,p;
int mp[]; struct AC_Machine{
int ch[MAX_SIZE][CHAR_SIZE] , val[MAX_SIZE] , fail[MAX_SIZE];
int sz; void init(){
sz = ;
clr(ch[]) , clr(val);
} void insert(char *s){
int n = strlen(s);
int u= ;
for(int i= ; i<n ; i++){
int c = mp[s[i]];
if(!ch[u][c]){
clr(ch[sz]);
val[sz] = ;
ch[u][c] = sz++;
}
u = ch[u][c];
}
val[u] = ;
} void get_fail(){
queue<int> Q;
fail[] = ;
for(int c= ; c<CHAR_SIZE ; c++){
int u = ch[][c];
if(u){Q.push(u);fail[u]=;}
}
while(!Q.empty()){
int r = Q.front();
Q.pop();
val[r] |= val[fail[r]];
for(int c= ; c<CHAR_SIZE ; c++){
int u = ch[r][c];
if(!u){ch[r][c] = ch[fail[r]][c]; continue;}
fail[u] = ch[fail[r]][c];
Q.push(u);
}
}
}
}ac; char str[];
int f[][MAX_SIZE];
int solve()
{
memset(f , 0x3f , sizeof(f));
f[][] = ;
int len = strlen(str) , ret=0x3f3f3f3f;
for(int i= ; i<=len ; i++){
int v = mp[str[i-]];
for(int j= ; j<ac.sz ; j++){
for(int k= ; k<CHAR_SIZE ; k++){
if(!ac.val[ac.ch[j][k]]){
f[i][ac.ch[j][k]] = min(f[i-][j]+(v==k?:) , f[i][ac.ch[j][k]]);
}
}
}
}
for(int i= ; i<ac.sz ; i++){
ret = min(ret , f[len][i]);
}
if(ret == 0x3f3f3f3f) return -;
else return ret;
} int main()
{
// freopen("in.txt" , "r" , stdin);
// freopen("out.txt" , "w" , stdout);
mp['A'] = , mp['G'] = , mp['C'] = , mp['T'] = ;
int cas = ;
while(scanf("%d" , &n),n){
ac.init();
for(int i= ; i<=n ; i++){
scanf("%s" , str);
ac.insert(str);
}
ac.get_fail();
scanf("%s" , str);
printf("Case %d: " , ++cas);
printf("%d\n" , solve());
}
return ;
}
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