混合测序(Pooling)
什么是高通量测序技术中的多重测序?
多重测序是指将带有特殊分子标签(barcode或者index)的不同来源的DNA标本,放入一个反应体系进行测序的方法。与一次检测一种来源的DNA相比,多重检测通过分子标签来区分不同的DNA标本,从而在提高测序的高效性的同时也确保测序的准确性。
人类个体的基因组是30亿个碱基对,即3Gb(3 giga base pairs,即3X109碱基对)。目前的高通量测序仪,单次测序反应可以获得200Gb以上的数据量。例如,BGISEQ1000可以达到2300Gb。这种数据产量远远超越一个人的全基因组测序所需要的数据量,因此产生了将多个标本放入一个反应体系同时测序的多重测序技术。
参考:
混合测序(Pooling)的更多相关文章
- 混合(Pooling)样本测序研究
目录 1.混合测序基础 2. 点突变检测 3. BSA 4. BSR 5. 混合样本GWAS分析 6. 混合样本驯化研究 7. 小结 1.混合测序基础 测序成本虽然下降了,但对于植物育种应用研究来说还 ...
- 基因组所三代单分子测序PacBio完成技术升级—超长读长助力基因组学研究
基因组所三代单分子测序PacBio完成技术升级—超长读长助力基因组学研究 2015-09-23 | 作者:所级中心基因组平台 张兵 [关闭] 近日,基因组所所级中心基因组平台三代单分子实时测序PacB ...
- PacBio三代全长转录组/Iso-Seq技术及案例分析
参考:产品手册 PacBio三代全长转录组有什么优势? 近年来,随着高通量测序技术的发展,转录组测序已经成为研究基因表达调控的主要手段.但二代的转录本重构准确率很低,三代可以直接得到全长转录本,无需组 ...
- 如何通过RNA-Seq了解转录本的结构
[转载]如何通过RNA-Seq了解转录本的结构 已有 1942 次阅读 2014-12-26 15:22 |个人分类:转录组测序|系统分类:科研笔记|关键词:RNA-Seq,转录组测序,转录本结构| ...
- 关于RNA-Seq数据去接头(Adapter)这事需要讲一讲
关于RNA-Seq数据去接头(Adapter)这事需要讲一讲 RNA-Seq adapter barcode cutadapt 首先来了解一下三个概念: 1.adapter是一段短的序列已知的核酸链, ...
- RNA-Seq数据去接头(Adapter)
1.adapter是一段短的序列已知的核酸链,用于链接序列未知的目标测序片段. 2.barcode,也称为index,是一段很短的寡居核酸链,用于在多个样品混合测序时,标记不同的样品. 3.inser ...
- A survey of best practices for RNA-seq data analysis RNA-seq数据分析指南
A survey of best practices for RNA-seq data analysis RNA-seq数据分析指南 内容 前言 各位同学/老师,大家好,现在由我给大家讲讲我的文献阅读 ...
- 文献阅读 | Molecular Architecture of the Mouse Nervous System
文章亮点: 按level来管理和分析数据,文章有不同stage,每个stage有不同subtype,这应该是一个真tree,而不只是一个进化树,文章里出现最多的进化树把所有的stage都整合了. 空间 ...
- 样本、文库、重复、lane、run - 二代测序原理及名词解释
参考: 独占鳌头的Illumina仪器(二代测序篇) HiSeq2000测序原理.流程与仪器 NGS文库制备的方法比较[心得点评] 各种测序文库构建方式 样本:就是待测的DNA.RNA或蛋白序列,样本 ...
随机推荐
- 20145204张亚军——web安全基础实践
web安全基础实践 实验后回答问题 1.SQL注入原理,如何防御 SQL注入:就是通过把SQL命令插入到"Web表单递交"或"输入域名"或"页面请求& ...
- Starting MySQL ERROR! Couldn't find MySQL server (/usr/local/mysql/bin/mysqld_safe)
centos7.5 安装mysql数据库报错 问题: [root@db04-54 scripts]# /etc/init.d/mysqld start /etc/init.d/mysqld: line ...
- python --- 20 约束 异常处理 MD5 日志
一.类的约束 1.抛出异常 NotImplementedError 2.抽象方法 含有抽象方法的类是抽象类 抽象类中的方法全是抽象方法的是接口 抽象类不能创建对象 二.异常处理 处理完后代码可继 ...
- 三星固态硬盘ssd产品线收集
目录 三星ssd按时间展示: 三星ssd后缀带a与不带a的区别,举其中一例: 下面是从三星中国的官网截图的产品线: 产品线列表: 总结: 参考: 最近在淘宝看到了很多拆机ssd,三星作为世界上唯一一家 ...
- 记录一下 ajax的基础传送
传数据 var json = $("#form").serializeObject(); $.ajax({ url: "/getUser", type: &qu ...
- [java变量] - 字符串数组转long型数组
//定义字符串 String str = "1,3,6,9,4,2,1,6"; //截取字符串 String[] strArr = str.split(",") ...
- SAP月结操作讲解
SAP月结操作讲解 https://wenku.baidu.com/view/ac6fe45d312b3169a451a4b9.html 步聚 操作内容 事务码 是否必须 操作时间 月/年结 1 ...
- 小程序之根据参数更改title
是这样的,今天呢在写中英文切换功能,哇 从psd图里面去复制英文在去对应,真的是太难受了 okok 切回正题 当用户选择英文的时候 我的title也要是英文怎么办呢 wx.setNaviga ...
- 提高R语言速度--转载
1. 参考<R语言编程艺术>(Norman Matloff) chapter 14 & chapter 15 2. 方法 (1)向量化 与非向量化-循环做个对比: ...
- 前端性能优化之按需加载(React-router+webpack)
一.什么是按需加载 和异步加载script的目的一样(异步加载script的方法),按需加载/代码切割也可以解决首屏加载的速度. 什么时候需要按需加载 如果是大文件,使用按需加载就十分合适.比如一个近 ...