http://blog.163.com/bioinfor_cnu/blog/static/19446223720118205527863/
所有文章：http://blog.163.com/bioinfor_cnu/blog/#m=0
1. 成对HMM用于双序列比对的基本思想：

2. 状态转移矩阵：

3. 成对HMM的完整描述：

 

4. 成对HMM的Viterbi算法：

成对HMM（Pair HMMs）用于双序列比对--转载的更多相关文章

  1. 72. Edit Distance(困难，确实挺难的，但很经典，双序列DP问题)

    Given two words word1 and word2, find the minimum number of steps required to convert word1 to word2 ...

  2. python中的enumerate函数用于遍历序列中的元素以及它们的下标

    enumerate 函数用于遍历序列中的元素以及它们的下标: >>> for i,j in enumerate(('a','b','c')): print i,j 0 a1 b2 c ...

  3. sql把表格拼成字符串，多半使用于GROUP BY

    --假定要聚合的字段是id ,要统计的字段是tname --select a.tname from @T1 a for xml path('row') select id,REPLACE(replac ...

  4. Python 内建的filter()函数用于过滤序列。

    例如,在一个list中,删掉偶数,只保留奇数,可以这么写: def is_odd(n): return n % 2 == 1 list(filter(is_odd, [1, 2, 4, 5, 6, 9 ...

  5. 将HTML5封装成android应用APK文件的几种方法（转载）

    越来越多的开发者热衷于使用html5+JavaScript开发移动Web App.不过,HTML5 Web APP的出现能否在未来取代移动应用,就目前来说,还是个未知数.一方面,用户在使用习惯上,不喜 ...

  6. python3 基础数据类型

    一.基础数据类型分类 python的数据类型主要包括以下几种: 1.数字 2.字符串 3.列表 4.字典 5.元组 6.集合 1.数字 int 数字主要是用于计算用的,使用方法并不多 #bit_len ...

  7. 6专题总结-动态规划dynamic programming

    专题6--动态规划 1.动态规划基础知识 什么情况下可能是动态规划?满足下面三个条件之一:1. Maximum/Minimum -- 最大最小,最长,最短:写程序一般有max/min.2. Yes/N ...

  8. 隐马尔科夫模型HMM（四）维特比算法解码隐藏状态序列

    隐马尔科夫模型HMM(一)HMM模型 隐马尔科夫模型HMM(二)前向后向算法评估观察序列概率 隐马尔科夫模型HMM(三)鲍姆-韦尔奇算法求解HMM参数 隐马尔科夫模型HMM(四)维特比算法解码隐藏状态 ...

  9. HMM XSS检测

    HMM XSS检测 转自:http://www.freebuf.com/articles/web/133909.html 前言 上篇我们介绍了HMM的基本原理以及常见的基于参数的异常检测实现,这次我们 ...

随机推荐

  1. VMware Pro v14.0.0 官方版本及激活密钥

    热门虚拟机软件VMware Workstation Pro 14.0 全新版本发布,此次更新了诸多客户机操作系统版本,另外完全兼容Wind10创建者更新支持.12.0之后属于大型更新,专门为Win10 ...

  2. ABAP抓取异常的方法：try，endtry

    部分转自:http://www.cnblogs.com/jiangzhengjun/p/4292428.html +4.Funcion函数异常处理 说明: 异常处理机制可以有效避免 dump发生, : ...

  3. Python中使用中文正则表达式匹配指定的中文字符串

    业务场景: 从中文字句中匹配出指定的中文子字符串 .这样的情况我在工作中遇到非常多, 特梳理总结如下. 难点: 处理GBK和utf8之类的字符编码, 同时正则匹配Pattern中包含汉字,要汉字正常发 ...

  4. 基于androidstudio3.0的build文件配置问题

    最近,在研究APP自动化相关的东西,在搭建环境的时候,遇到的坑以及最后解决的方法,不过目前很多东西了解得还不是很细,暂时先简单的记录一下一.build配置文件 主要分为两种: 1.工程下的build配 ...

  5. jmeter 读取excel数据

    jmeter 读取excel数据使用的方法是使用Jmeter CSV Data Set Config参数化 但是将excel文件保存成csv格式后,jmeter读取后返回的数据总是出现乱码问题, 以下 ...

  6. set的一些数学运算

    python的set和其他语言类似, 是一个无序不重复元素集, 基本功能包括关系测试和消除重复元素. 集合对象还支持union(联合), intersection(交), difference(差)和 ...

  7. 使用 MtVerify.h头文件 ，用的时候把他头文件的内容添加到项目

    #include <windows.h>  //windodws变量相关头文件 MtVerify.h的内容如下:#pragma comment( lib, "USER32&quo ...

  8. 第一章SpringBoot入门

    一.简介 SpringBoot来简化Spring应用的开发,约定大于配置,去繁从简,just run就能创建一个独立的产品级别的应用. 背景: j2EE笨重的开发方法,繁多的配置,低下的开发效率,复杂 ...

  9. linux中vim的常用方法

    i 当前光标位置插入 a 当前光标后插入 0 另起一行插入 A 在光标所在行尾插入 I 在光标所在行首插入 :set nu设置 行号 :set nunu 取消行号 gg 到第一行 G 到最后一行 $ ...

  10. kendo 级联加带搜索的下拉框以及js赋值

    1‘.js给下拉框赋值 $("#UserRole").data("kendoDropDownList").value(dataItem.RoleName); $ ...