一些常用基本概念的介绍:
flowcell流动池

是指Illumina测序时,测序反应发生的位置,1个flowcell含有8条lane

lane通道

每一个flowcell上都有8条泳道,用于测序反应,可以添加试剂,洗脱等等

tile

每一次测序荧光扫描的最小单位

reads

指测序的结果,1条序列一般称为1条reads

bp

base pair碱基对,用于衡量序列长度

双端测序

指一条序列可能比较长如500bp,我们可以两端每端各测150bp

junction

上面说的双端测序,中间会留有200bp测不到的东西,我们叫junction

adapter

就是测序中需要的一段特定的序列,有类似于引物的功能

primer

PCR中的引物

illumina测序原理的更多相关文章

  1. 样本、文库、重复、lane、run - 二代测序原理及名词解释

    参考: 独占鳌头的Illumina仪器(二代测序篇) HiSeq2000测序原理.流程与仪器 NGS文库制备的方法比较[心得点评] 各种测序文库构建方式 样本:就是待测的DNA.RNA或蛋白序列,样本 ...

  2. NGS基础 - 高通量测序原理

    NGS基础 - 高通量测序原理 原创: 赑屃 生信宝典 2017-07-23 NGS系列文章包括NGS基础.转录组分析.ChIP-seq分析.DNA甲基化分析.重测序分析五部分内容. NGS基础系列文 ...

  3. 第三代PacBio测序技术的测序原理和读长

    针对PacBio单分子测序——第三代测序技术的测序原理和读长     DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业.测序技术的应用也扩展到了生物.医学.制 ...

  4. 测序原理 - PacBio技术资料

    手头有一套完整的PacBio技术资料,会慢慢的总结到博客上. 写在前面:PacBio公司主要有两个测序平台一个是RS,一个是最新的Sequel,下面如果没有指明则是在讲RS平台. SMRT测序技术总览 ...

  5. illumina SBS测序详解

    illumina SBS测序详解 2018年01月02日 09:33:56 sixu_9days 阅读数:9789 标签: 生物信息学二代测序 更多 个人分类: 测序原理   最近回头重新看了illl ...

  6. 解读生命密码的基本手段 ——DNA测序技术的前世今生

    解读生命密码的基本手段 ——DNA测序技术的前世今生 任鲁风  于军 (中国科学院基因组科学及信息重点实验室,北京基因组研究所) DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)是生命体的两种最基本组成物质 ...

  7. fastx_toolkit去除测序数据中的接头和低质量的reads

    高通量测序数据下机后得到了fastq的raw_data,通常测序公司在将数据返还给客户之前会做"clean"处理,即得到clean_data.然而,这些clean_data是否真的 ...

  8. Next generation sequencing (NGS)二代测序数据预处理与分析

    二代测序原理: 1.DNA待测文库构建. 超声波把DNA打断成小片段,一般200--500bp,两端加上不同的接头2.Flowcell.一个flowcell,8个channel,很多接头3.桥式PCR ...

  9. Illumina Sequence Identifiers 序列标识符 index详解

    大家基本都知道什么是 FASTA 和 FastQ 格式了,但这是不够的. 我们还需要了解世界上最大的测序公司自己定制的 FastQ 格式,因为你可能会经常用到,有时还会亲自去处理它们. 本文主题:Il ...

随机推荐

  1. 微信最新开源的PhxSQL

    在编者看到“[重磅]微信开源PhxSQL:高可用.强一致的MySQL集群”时,由衷赞叹,这等造福广大DBA及运维同仁的事情,真心赞.腾讯及微信的开放,真的不是说说而已. 本文由资深DB从业者撰写,相信 ...

  2. 两张图让git新手在项目中运用git命令行

    创建分支命令:    git branch (branchname) 切换分支命令:      git checkout (branchname) 当你切换分支的时候,Git 会用该分支的最后提交的快 ...

  3. spring mvc日期转换(前端到后端,后端到前端)

    在做web开发的时候,页面传入的都是String类型,SpringMVC可以对一些基本的类型进行转换,但是对于日期类的转换可能就需要我们配置. 1.如果查询类使我们自己写,那么在属性前面加上@Date ...

  4. Linux: 通过命令行上传文件到ftp服务器

    url -T fie-name ftp://server-address --user user:password

  5. 1.7-BGP②

    BGP的更新源(BGP Neighbor Update Source Address): 原则1: 在默认情况下, BGP路由器以自己路由表中,到达对方BGP邻居的地址的那条路由所指示的出接口(物理接 ...

  6. python基础学习之02 元组

    #encoding=utf-8 # 元组与列表一样,也是一种序列 print (1,2,3) print 1,2,3 print(1,) print 1, a=1 print(type(a)) a=1 ...

  7. BNU 13064 Dice (I) 前缀和优化DP

    Dice (I)   You have N dices; each of them has K faces numbered from 1 to K. Now you have arranged th ...

  8. jenkins对接gitlab和git

    1 需要的插件 jenkins的git插件和jenkins的gitlab插件. 2 对接gitlab 在系统配置中,随便起一个连接的名字,设置url,可以直接用ip地址,端口号默认是80,不需要写明. ...

  9. oc71--NSArray2

    // // Person.h #import <Foundation/Foundation.h> @interface Person : NSObject - (void)say; - ( ...

  10. luogu 3383【模板】线性筛素数

    我太菜了 %韩神 #include<iostream> #include<cstdio> #include<cmath> #include<cstdlib&g ...