一些常用基本概念的介绍：
flowcell流动池

是指Illumina测序时，测序反应发生的位置，1个flowcell含有8条lane

lane通道

每一个flowcell上都有8条泳道，用于测序反应，可以添加试剂，洗脱等等

tile

每一次测序荧光扫描的最小单位

reads

指测序的结果，1条序列一般称为1条reads

bp

base pair碱基对，用于衡量序列长度

双端测序

指一条序列可能比较长如500bp，我们可以两端每端各测150bp

junction

上面说的双端测序，中间会留有200bp测不到的东西，我们叫junction

adapter

就是测序中需要的一段特定的序列，有类似于引物的功能

primer

PCR中的引物

illumina测序原理的更多相关文章

  1. 样本、文库、重复、lane、run - 二代测序原理及名词解释

    参考: 独占鳌头的Illumina仪器(二代测序篇) HiSeq2000测序原理.流程与仪器 NGS文库制备的方法比较[心得点评] 各种测序文库构建方式 样本:就是待测的DNA.RNA或蛋白序列,样本 ...

  2. NGS基础 - 高通量测序原理

    NGS基础 - 高通量测序原理 原创: 赑屃 生信宝典 2017-07-23 NGS系列文章包括NGS基础.转录组分析.ChIP-seq分析.DNA甲基化分析.重测序分析五部分内容. NGS基础系列文 ...

  3. 第三代PacBio测序技术的测序原理和读长

    针对PacBio单分子测序——第三代测序技术的测序原理和读长     DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业.测序技术的应用也扩展到了生物.医学.制 ...

  4. 测序原理 - PacBio技术资料

    手头有一套完整的PacBio技术资料,会慢慢的总结到博客上. 写在前面:PacBio公司主要有两个测序平台一个是RS,一个是最新的Sequel,下面如果没有指明则是在讲RS平台. SMRT测序技术总览 ...

  5. illumina SBS测序详解

    illumina SBS测序详解 2018年01月02日 09:33:56 sixu_9days 阅读数:9789 标签: 生物信息学二代测序 更多 个人分类: 测序原理   最近回头重新看了illl ...

  6. 解读生命密码的基本手段 ——DNA测序技术的前世今生

    解读生命密码的基本手段 ——DNA测序技术的前世今生 任鲁风  于军 (中国科学院基因组科学及信息重点实验室,北京基因组研究所) DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)是生命体的两种最基本组成物质 ...

  7. fastx_toolkit去除测序数据中的接头和低质量的reads

    高通量测序数据下机后得到了fastq的raw_data,通常测序公司在将数据返还给客户之前会做"clean"处理,即得到clean_data.然而,这些clean_data是否真的 ...

  8. Next generation sequencing (NGS)二代测序数据预处理与分析

    二代测序原理: 1.DNA待测文库构建. 超声波把DNA打断成小片段,一般200--500bp,两端加上不同的接头2.Flowcell.一个flowcell,8个channel,很多接头3.桥式PCR ...

  9. Illumina Sequence Identifiers 序列标识符 index详解

    大家基本都知道什么是 FASTA 和 FastQ 格式了,但这是不够的. 我们还需要了解世界上最大的测序公司自己定制的 FastQ 格式,因为你可能会经常用到,有时还会亲自去处理它们. 本文主题:Il ...

随机推荐

  1. 一致性哈希server的数据维护

    本文是实例说明一致性哈希server的数据维护用途. 理论说明參考:http://blog.csdn.net/chenjiayi_yun/article/details/41624603 例如以下图所 ...

  2. LINQ体验(11)——LINQ to SQL语句之Null语义和String/DateTime方法

    在本系列中.主要介绍LINQ to SQL基础的东西,由于LINQ太强大了,它对我们寻常使用不同的数据源有着不同的内容,其包含对于SQL Server 数据库的LINQ to SQL:对于XML 文档 ...

  3. nginx-tomcat负载均衡redis-session共享，静态资源分离

    nginx-tomcat负载均衡redis-session共享.静态资源分离 基本环境: redis-2.8 apache-tomcat-6.0.41 nginx1.6.2 1.redis配置 1,配 ...

  4. Linux网络编程：UDP Socket编程范例

    TCP协议提供的是一种可靠的,复杂的,面向连接的数据流(SOCK_STREAM)传输服务,它通过三段式握手过程建立连接.TCP有一种"重传确认"机制,即接收端收到数据后要发出一个肯 ...

  5. MVC之使用Nhibernate

    NHibernate是一个基于.Net,用于关系数据库的对象持久化类库.它是著名的Hibernate的.Net版本,NHibernate用于把你的.Net对象持久化到底层的关系数据库中.你完全不用自己 ...

  6. BusyBox telnetd配置

    配置telnetd遇到的一些坑,记录一下 BusyBox版本1.22.1 Networking Utilities -->[*] telnetd 错误1: Escape character is ...

  7. android5.1 Recovery添加从U盘升级功能【转】

    本文转载自:http://blog.csdn.net/tfslovexizi/article/details/73835594 之前看到过一个人写了4.4上添加U盘升级功能的博客http://blog ...

  8. linux下.a/.so/.la目标库区别

    在linux平台上编译时,常会遇到目标库的疑问,有静态库也有动态库,单个理解都不太难,但是对复杂的工程而言,一旦混合到一起去,对整个工程的理解和调用,将会造成很大困扰,本文就汇总这几种常见编译结果文件 ...

  9. codeforces round #414 div1+div2

    A:判断一下就可以了 #include<bits/stdc++.h> using namespace std; typedef long long ll; int a, b, c, n; ...

  10. 41. extjs--combobox下拉列表的triggerAction

    转自:https://icrwen.iteye.com/blog/939247 一般combobox的store先load加载数据,然后combobox的mode设置为local,则不会每次下拉列表都 ...