illumina测序原理
是指Illumina测序时,测序反应发生的位置,1个flowcell含有8条lane
每一个flowcell上都有8条泳道,用于测序反应,可以添加试剂,洗脱等等
每一次测序荧光扫描的最小单位
指测序的结果,1条序列一般称为1条reads
base pair碱基对,用于衡量序列长度
指一条序列可能比较长如500bp,我们可以两端每端各测150bp
上面说的双端测序,中间会留有200bp测不到的东西,我们叫junction
就是测序中需要的一段特定的序列,有类似于引物的功能
PCR中的引物
illumina测序原理的更多相关文章
- 样本、文库、重复、lane、run - 二代测序原理及名词解释
参考: 独占鳌头的Illumina仪器(二代测序篇) HiSeq2000测序原理.流程与仪器 NGS文库制备的方法比较[心得点评] 各种测序文库构建方式 样本:就是待测的DNA.RNA或蛋白序列,样本 ...
- NGS基础 - 高通量测序原理
NGS基础 - 高通量测序原理 原创: 赑屃 生信宝典 2017-07-23 NGS系列文章包括NGS基础.转录组分析.ChIP-seq分析.DNA甲基化分析.重测序分析五部分内容. NGS基础系列文 ...
- 第三代PacBio测序技术的测序原理和读长
针对PacBio单分子测序——第三代测序技术的测序原理和读长 DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业.测序技术的应用也扩展到了生物.医学.制 ...
- 测序原理 - PacBio技术资料
手头有一套完整的PacBio技术资料,会慢慢的总结到博客上. 写在前面:PacBio公司主要有两个测序平台一个是RS,一个是最新的Sequel,下面如果没有指明则是在讲RS平台. SMRT测序技术总览 ...
- illumina SBS测序详解
illumina SBS测序详解 2018年01月02日 09:33:56 sixu_9days 阅读数:9789 标签: 生物信息学二代测序 更多 个人分类: 测序原理 最近回头重新看了illl ...
- 解读生命密码的基本手段 ——DNA测序技术的前世今生
解读生命密码的基本手段 ——DNA测序技术的前世今生 任鲁风 于军 (中国科学院基因组科学及信息重点实验室,北京基因组研究所) DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)是生命体的两种最基本组成物质 ...
- fastx_toolkit去除测序数据中的接头和低质量的reads
高通量测序数据下机后得到了fastq的raw_data,通常测序公司在将数据返还给客户之前会做"clean"处理,即得到clean_data.然而,这些clean_data是否真的 ...
- Next generation sequencing (NGS)二代测序数据预处理与分析
二代测序原理: 1.DNA待测文库构建. 超声波把DNA打断成小片段,一般200--500bp,两端加上不同的接头2.Flowcell.一个flowcell,8个channel,很多接头3.桥式PCR ...
- Illumina Sequence Identifiers 序列标识符 index详解
大家基本都知道什么是 FASTA 和 FastQ 格式了,但这是不够的. 我们还需要了解世界上最大的测序公司自己定制的 FastQ 格式,因为你可能会经常用到,有时还会亲自去处理它们. 本文主题:Il ...
随机推荐
- pga_aggregate_target, sga_target, memory_target
对于这三个参数有一些了解,但是又有一些疑惑. pga_aggregate_target 最初的了解: 这个参数控制着PGA的大小,如果work_area_policy 设置成auto,则oracle采 ...
- golang 中timer,ticker 的使用
写一个程序, 5s, 10s后能定时执行一个任务,同时能不停的处理来的消息. ------------------------------------------------------------- ...
- sendredirect()和forward()的区别 (转)
sendRedirect() 和forward()的区别 HttpServletResponse.sendRedirect与RequestDispatcher.forward方法都可以实现获取相应UR ...
- swift 2.0语法 元组
import UIKit /*: 元祖 * 可以将多个值保存在一起 * 格式: (数值1, 数值2, 数值3) * 特点: 元祖可以保存不同数据类型的值 * 用途: 在C/OC中如果一个函数想返回多个 ...
- WebView与JavaScript交互--Android
转载请注明出处: http://blog.csdn.net/forwardyzk/article/details/46819925 在工作中,有一个这种需求,须要用到WebView与javascri ...
- open_basedir restriction in effect,解决php引入文件权限问题 lnmp
1.配置了虚拟域名 vim /usr/local/nginx/conf/vhost/siemens.conf server { listen 80; #listen [::]:80 default_s ...
- InfluxDB 分布式时间序列数据库环境搭建——据qcon大会2016qiniu说集群很坑且闭源了
InfluxDB 分布式时间序列数据库环境搭建 1. 环境说明 Ubuntu14.04 + influxDB V0.10.1 搭建3个节点的分布式数据库,副本数量2,各节点之间自动进行数据备份并 ...
- 修改select默认样式
http://www.qkzone.com/code/2015-11-26/1.html
- 什么是IaaS,PaaS和SaaS及其区别
云计算的三种服务模式:IaaS,PaaS和SaaS Infrastructure(基础设施)-as-a-Service,Platform(平台)-as-a-Service,Software(软件)-a ...
- Android.mk添加第三方jar包(转载)
转自:www.cnblogs.com/hopetribe/archive/2012/04/23/2467060.html LOCAL_PATH:= $(call my-dir)include $(CL ...