【python】文件处理行与行之间的内容
在处理文本文件时,很多时候需要我们处理跨行的数据,但是用for循环处理不是很方便,想了一个歪招来处理不是很大的数据。
核心思想就是将上一行的东西存在一个列表里,到下一行用完这个数据在循环体里将列表初始化,再将这行数据存到列表里,这样循环就可以把两行数据联系起来。
另外这样做的还有另外一个好处,就是可以初始化第一行,我们可以通过判断这个“传递列表”空与否来区分标题行的输入和其他循环体的输入情况。
from __future__ import division
from sys import argv
from itertools import islice
Mutation = open('DivFile_sort_chr' + argv[1] +'.txt',"r")
REC = open('GeneticMap_Chr' + argv[1],"r")
RECList = open('REC_Chr_' + argv[1], "a")
transList = []
SNPPosList = []
rholist = []
for lines in islice(Mutation, 1, None):
line = lines.strip('\n').split("\t")
POS = line[0]
SNPPosList.append(POS)
print "SNPPos done"
for lines in islice(REC, 1, None):
line = lines.strip('\n').split("\t")
if transList == []:
transList.append((line[0],line[1]))
RECList.write("position\trate\n")
RECList.write('%s\t%s\n' %(line[0],0))
print "headline"
else:
rho = (float(line[1]) - float(transList[0][1])) / (float(line[0]) - float(transList[0][0]))
for i in SNPPosList:
if int(i) < int(line[0]) and int(i) > int(transList[0][0]):
index = int(SNPPosList.index(i) - 1)
site_rho = (int(i) - int(SNPPosList[index])) * rho
RECList.write('%s\t%s\n' %(i,site_rho))
else:
continue
transList = []
transList.append((line[0],line[1],rho))
rholist.append(rho)
print rholist
for i in SNPPosList:
if i > int(transList[0][0]):
index = int(SNPPosList.index(i) - 1)
site_rho = (int(i) - int(SNPPosList[index])) * rho
RECList.write('%s\t%s\n' %(i,site_rho))
else:
continue
Mutation.close()
REC.close()
RECList.close()
【python】文件处理行与行之间的内容的更多相关文章
- Python文件使用“wb”方式打开,写入内容
Python文件使用"wb"方式打开,写入字符串会报错,因为这种打开方式为:以二进制格式打开一个文件只用于写入.如果该文件已存在则将其覆盖.如果该文件不存在,创建新文件. 所以写入 ...
- 如何用python爬取两个span之间的内容
Python用做数据处理还是相当不错的,如果你想要做爬虫,Python是很好的选择,它有很多已经写好的类包,只要调用,即可完成很多复杂的功能,此文中所有的功能都是基于BeautifulSoup这个包. ...
- 如何编写一个带命令行参数的Python文件
看到别人执行一个带命令行参数的python文件,瞬间觉得高大上起来.牛逼起来,那么如何编写一个带命令行参数的python脚本呢?不用紧张,下面将简单易懂地让你学会如何让自己的python脚本,支持带命 ...
- 解决命令行运行python文件,出现No module named *** 报错问题
有时候在一个项目中运行的时候,可能是之前已经mark成sources root 你自己忘记了, 于是就在命令行也执行python文件,然后就出现 No module named *** 等 相关你认为 ...
- python之模块csv之CSV文件的写入(按行写入)
# -*- coding: utf-8 -*- #python 27 #xiaodeng #CSV文件的写入(按行写入) import csv #csv文件,是一种常用的文本格式,用以存储表格数据,很 ...
- Python通过调用windows命令行处理sam文件
Python通过调用windows命令行处理sam文件 以samtools软件为例 一.下载或者索取得到windows版本的samtools软件,解压后如下: 进入文件内部,有如下几个文件: 二.将s ...
- python如何通过windows命令行运行一个python程序文件?
python如何通过windows命令行运行一个python程序文件? cmd 进入到py文件对应目录下或者直接在上面的文件地址栏输入cmd,敲入回车 定位到对应的目录下 输入python xxx.p ...
- shell脚本命令 运行python文件&python命令行运行python代码
单独的python文件运行的时候 报错: 在shell脚本中,运行shell脚本命令:在Python命令行中,运行Python代码.然而,“python hello.py”是一个脚本命令,不是pyth ...
- 如何用python最快的获取大文件的最后几行
工作中经常会遇到处理日志文件的问题:为了得到日志的最新状态,我们需要获取日志文件的最后部分行来做判断.那么,这种情况下我们应该怎么做呢? 1)常规方法:从前往后依次读取 步骤:open打开日志文件. ...
- python 文件单行循环读取的坑(一个程序中,文件默认只能按行循环读取一次,即使写到另一个循环里,它也只读取一次)
本来写了一个程序,想获取a文件中有,但是b文件中没有的行: 想到的方法是:1.一行一行提取a文件中数据,然后用a文件中的每一行与b文件中的每一行比较, 2.如果找到相同行就继续查找a中的下一行,如果找 ...
随机推荐
- python2和python3 安装pip冲突问题
系统:win10 问题:安装python2和Python3后 在cmd 中 pip和python命令会冲突 原因:先安装的python3,python3会自动配置path安装pip,pip和pytho ...
- PDF在线解除密码的方法是什么
大家在网上下载一些关于PDF文件的时候通常会发现有的PDF文件是有密码的,有密码的文件通常是不可以被转换的,这个时候我们就需要将其密码解除掉,这样后期不仅方便阅读也方便了PDF文件的转换. 操作工具: ...
- 关于Python中迭代器的作用
迭代器的定义:含有__iter__()方法和__next__()方法的就是迭代器,即(iterate) 含有__iter__()方法就可以使用for循环,即iterable(可迭代的) Iterabl ...
- $_SERVER服务器端
url = 'http://www.5idev.com/php/index.php/test/foo?username=hbolive' php 获取$_SERVER信息 $_SERVER['PHP_ ...
- 核心思想:决定你是富人还是穷人的11条标准(有强烈的赚钱意识,这也是他血液里的东西,太精彩了)good
原文地址:决定你是富人还是穷人的11条标准作者:谢仲华 1.自我认知 穷人:很少想到如何去赚钱和如何才能赚到钱,认为自己一辈子就该这样,不相信会有什么改变. 富人:骨子里就深信自己生下来不是要做穷人, ...
- Mybatis异常--There is no getter for property named 'XXX' in 'class java.lang.String'
第一种 在service层加@Param(value="ip") void deleteIpsetup(@Param(value="ip")String ip) ...
- 使用pushstate,指定回退地址
history.pushState(null,"testname", window.location.href); window.addEventListener('popstat ...
- com.alibaba.druid.pool.DruidDataSource : {dataSource-2} init error
这几天准备写一个项目,其中的整合druid的时候,发现出现了下面这个错误.找了好久都没有找到.网上的各种解决方法都不对. 2018-11-07 16:26:28.940 INFO 19684 --- ...
- 学号 20175201张驰 《Java程序设计》第4周学习总结
学号 20175201张驰 <Java程序设计>第4周学习总结 教材学习内容总结 第5章 继承:避免多个类间重复定义共同行为,用我们已经有的类,去创建新的类 任何子类都可以继承它的父类的成 ...
- 【LeetCode每天一题】Add Binary(二进制加法)
Given two binary strings, return their sum (also a binary string).The input strings are both non-emp ...