Linux写配置HDF5的python包h5py

闲言碎语不讲，直接进入正题。Python在科学计算的应用越来越丰度，而hdf(5)数据的应用也非常广泛。python提供了h5py包供开发者处理数据(http://www.h5py.org/)。在windows下配置h5py，可以通过安装Anaconda以及pythonxy来做相对方便，现在主要说在linux下该环境的配置。

（1）使用： sudo apt-get install python-pip安装pip工具，然后使用pip install numpy和pip install numpy安装基本环境。

（2）使用： sudo apt-get install libhdf5-dev安装hdf的开发库（重要）。否则会报出：

#include “hdf5.h”

compilation terminated.

error: command ‘gcc’ failed with exit status:1

（3）安装HDF5:按照官方文档的说明就可以（ftp://ftp.hdfgroup.org/HDF5/current/src/unpacked/release_docs/INSTALL）。

$tar zxf hdf5-X.Y.Z.tar.gz$ cd hdf5-X.Y.Z
$ ./configure --prefix=/your/install/dir <more configure_flags>
$ sudo make
$ sudo make check                # run test suite.
$ sudo make install
$ sudo make check-install        # verify installation.

这里也有一个安装教程，是我后来发现的：（http://www.aichengxu.com/view/24309）

（4）使用：sudo pip install h5py安装h5py库,当你看到Successfully install h5py. Cleaning up…就大功告成了。

（5）测试一下：

import h5py as h5

h5.run_tests()

成功运行。

具体使用可以参照帮助文档（http://docs.h5py.org/en/latest/build.html）