题目:

随便给定一条序列,如果GC含量超过65%,则认为高。

编程:

from __future__ import division #整数除法

def is_gc_rich(dna):
length = len(dna)
G_count = dna.upper().count('G')
C_count = dna.upper().count('C')
GC_content = (G_count + C_count) / length
if GC_content > 0.65:
print('GC content is high')
else:
print("GC content is normal")

测试

dna="agcTacGAcatgcacgtgcac"
is_gc_rich(dna)

解析

Python提供了__future__模块,把下一个新版本的特性导入到当前版本,于是我们就可以在当前版本中测试一些新版本的特性。

主要解决python2版本中和python3不同的一些问题,如print、整数除法、with用法、absolute_import等。上例中即引入了整数除法。

Ref:https://blog.csdn.net/zzc15806/article/details/81133045

https://www.liaoxuefeng.com/wiki/897692888725344/923030465280480

【Python小试】判断一条序列GC含量高低的更多相关文章

  1. perl练习——FASTA格式文件中序列GC含量计算&perl数组排序如何获得下标或者键

    一.关于程序: FUN:计算FASTA文件中每条序列中G和C的含量百分比,输出最大值及其id INPUT:FASTA格式文件 >seq1 CGCCGAGCGCTTGACCTCCAGCAAGACG ...

  2. 【Python小试】计算蛋白序列中指定氨基酸所占的比例

    编码 from __future__ import division def get_aa_percentage(protein, aa_list=['A','I','L','M','F','W',' ...

  3. 【Python小试】将核酸序列翻译成氨基酸序列

    三联密码表 gencode = { 'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M', 'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT' ...

  4. php 统计fasta 序列长度和GC含量

    最近php7的消息铺天盖地, 忍不住想尝试下.星期天看了下语法, 写个小脚本练下手: 这个脚本读取fasta 文件, 输出序列的长度和GC含量: <?php $fasta = "tes ...

  5. Swift处理堆栈问题——给定两组序列,其中一个序列表示栈的push 顺序,判断另一个序列有没有可能是对应的pop 顺序

    题目:输入两个整数序列.其中一个序列表示栈的push 顺序,判断另一个序列有没有可能是对应的pop 顺序.为了简单起见,我们假设push 序列的任意两个整数都是不相等的.比如输入的push 序列是1. ...

  6. 如何判断一条sql(update,delete)语句是否执行成功

    如何判断一条sql(update,delete)语句是否执行成功 catch  (SQLException    e)  {  }  catch不到错误应该就成功了.   ============== ...

  7. python学习笔记(一)元组,序列,字典

    python学习笔记(一)元组,序列,字典

  8. python if判断语句&计算

    python对缩进要求严格,代码块里的缩进必须一样,可以常用 tab键  表示4个空格 if 条件: 代码块 else: if判断语句如下: 1 print("吃饭,喝水,回家") ...

  9. 【剑指offer】判断出栈序列是否合法

    输入两个整数序列,第一个序列表示栈的压入顺序,请判断第二个序列是否可能为该栈的弹出顺序.假设压入栈的所有数字均不相等.例如序列1,2,3,4,5是某栈的压入顺序,序列4,5,3,2,1是该压栈序列对应 ...

随机推荐

  1. Java:static关键字小记

    Java:static关键字小记 对 Java 中的 static 关键字,做一个微不足道的小小小小记 static 修饰变量 静态变量:是被 static 修饰的变量,也称为类变量,它属于类,因此不 ...

  2. mybatis学习笔记(2)基本原理

    引言在mybatis的基础知识中我们已经可以对mybatis的工作方式窥斑见豹(参考:<MyBatis----基础知识>).但是,为什么还要要学习mybatis的工作原理?因为,随着myb ...

  3. [对对子队]会议记录4.15(Scrum Meeting 6)

    今天已完成的工作 何瑞 ​ 工作内容:制作了合成指南 ​ 相关issue:实现游戏内UI界面使用的组件 马嘉 ​ 工作内容:基本实现了箱子内物品列表 ​ 相关issue:实现游戏内UI界面使用的组件 ...

  4. OO_JAVA_表达式求导

    OO_JAVA_表达式求导_第一弹 ---------------------------------------------------表达式提取部分 词法分析 ​ 首先,每一个表达式内部都存在不可 ...

  5. js--数组的 fill() 填充方法详解

    前言 我们知道了很多了初始化数组的方法,但是初始化数组之后,数组中的每一项元素默认为 empty 空位占位,如何对数组这些空位添加默认的元素,ES6提供了 fill() 方法实现这一操作.本文总结数组 ...

  6. filebeat收集日志到elsticsearch中并使用ingest node的pipeline处理

    filebeat收集日志到elsticsearch中 一.需求 二.实现 1.filebeat.yml 配置文件的编写 2.创建自定义的索引模板 3.加密连接到es用户的密码 1.创建keystore ...

  7. 震惊,本Orzer下阶段直接怒送四个笑脸

    众所周知,在hzoi帝国中,Wzx是最菜的.那么究竟有多菜呢?下面就和小编一起来看看吧. 近日,hzoi最菜的wzx在第四阶段竟然怒送4个笑脸,同机房神犇直呼wzx太菜了! 以上就是wzx第四阶段怒送 ...

  8. 设计模式(1-2)-动态代理(newProxyInstance)

    上节设计模式(1-1)-代理模式,讲了代理模式的静态代理与动态代理的写法.本节,会从Proxy.newProxyInstance() 这个方法开始讲,上一节文末的那个class文件怎么一步步的来的. ...

  9. (转载)关于Linux C函数strtok的使用要点

    今天遇到了处理字符串的问题,比如分割问题,但是一时间想不起来什么方法,也不想手写一个类似java String中的split函数,于是百度了一下,发现了strtok这个好用的方法,以此作为总结. st ...

  10. (三)FastDFS 高可用集群架构学习---Client 接口开发

    一.Python3 与 FastDFS 交互 1.安装 py3fdfs模块 # pip3 install py3Fdfs 2.测试使用 py3Fdfs 与 Fastdfs 集群交互(上传文件) fro ...