此小程序可以分析backrub,enzdes类的聚类logo分析,详细路径是:

/home/wangq/Programs/rosetta_2018.09.60072_bundle/tools/protein_tools/scripts/deep_analysis

帮助文档:

design_analysis.py -h

rosetta deep_analysis的更多相关文章

  1. rosetta common sh: mpiCC command not found解决方法

    在执行多线程编译rosetta时执行: python scons.py bin mode=release extras=mpi -j8 编译安装rosetta 会出现错误sh: mpiCC comma ...

  2. 酶设计软件rosetta安装

    1.Rosetta uses SCons as a compile assistant. You will likely need to download and install this first ...

  3. 外语学习强烈推荐Rosetta Stone

    外语学习强烈推荐Rosetta Stone 外语学习强烈推荐Rosetta Stone

  4. rosetta geometric constraint file(用于match和design)

    cst(constraint file)文件示例: CST::BEGIN TEMPLATE:: ATOM_MAP: atom_name: C6 O4 O2 TEMPLATE:: ATOM_MAP: r ...

  5. ROSETTA使用技巧随笔--relax使用

    Purpose: 主要说目的,relax的作用就是对一个给定的蛋白进行构象搜索,寻找与WT相似并能量低于WT的结构,既包含packer又包含minimizer.主要的应用在对一个结构构象进行取样,获得 ...

  6. ROSETTA使用技巧随笔--蛋白蛋白对接

    先写简略版,以后再详细写. 1. 对输入结构进行预处理(refine) $> relax.default.linuxgccrelease -in:file:s input_files/from_ ...

  7. ROSETTA使用技巧随笔--PyMOL实时观测ROSETTA模拟过程中的结构变化

    没有梦想的人,就是一只咸鱼,像我,就有一个梦想,就是让蛋白模拟过程变成动画,动起来! 虽然MD中有很多方法可以方模拟过程像动画一样播放出来,但是我一直想在ROSETTA中也找一个这样的功能,这不,我发 ...

  8. ROSETTA使用技巧随笔--控制Log输出等级

    一般运行ROSETTA,屏幕上的Log很多,而且很复杂,让我们看着眼晕,现在我们可以通过控制Log等级来控制屏幕上输出的东西.  Integer Level 0 Fatal 100 Error 200 ...

  9. ROSETTA使用技巧随笔--Full Atom Representation和Centroid Representation

    Full Atom Representation vs Centroid Representation Full Atom Representation即全原子标识,氨基酸残基的所有相关原子,均原封不 ...

随机推荐

  1. python之字符串操作方法

    定义及特性: 以引号(单引号,双引号,三引号)包围且不能修改 a= ' \t aBcdE fgFijDlmNopq rSt uTwxy z 123 !@# \t ' 一.判断字符串,返回bool值:F ...

  2. 进一步聊聊weight initialization

    深度学习模型训练的过程本质是对weight(即参数W)进行更新,这需要每个参数有相应的初始值. 有人可能会说:"参数初始化有什么难点?直接将所有weight初始化为0或者初始化为随机数!&q ...

  3. 为什么要使用NoSQL

    转载自:http://www.infoq.com/cn/news/2011/01/nosql-why [编者按]NoSQL在2010年风生水起,大大小小的Web站点在追求高性能高可靠性方面,不由自主都 ...

  4. URLSearchParams和axios的post请求(防忘记)

    import axios from 'axios' Vue.prototype.axios = axios mounted () { let params = new URLSearchParams( ...

  5. Android开发怎么让自己的APP UI漂亮、大方(配色篇二)

    我们在没有效果图的app开发中有一件事情肯定很头疼:一个按钮的调色改过来改过去,还是很难看,最终只能暂时作罢,浪费了大量的开发时间和精力.开发规范篇见Android开发怎么让自己的APP UI漂亮.大 ...

  6. Python3输入输出

    Python两种输出值的方式: 表达式语句和 print() 函数. 第三种方式是使用文件对象的 write() 方法,标准输出文件可以用 sys.stdout 引用. 如果你希望输出的形式更加多样, ...

  7. redis安装相关下载

    redis-4.0.1.gem下载网址 https://rubygems.org/gems/redis/ rubyinstaller-2.3.3-x64.exe下载网址 http://dl.bintr ...

  8. 内存(RAM或ROM)和FLASH存储的真正区别总结

    转载自:http://blog.csdn.net/liangkaiyang/article/details/59556531.什么是内存     什么是内存呢?在计算机的组成结构中,有一个很重要的部分 ...

  9. x264_param_default分析

    {     /* 开辟内存空间*/     memset( param, 0, sizeof( x264_param_t ) );              /* CPU自动检测 */     par ...

  10. 关于npm的坑

    http://javascript.ruanyifeng.com/nodejs/packagejson.html 一.npm常用易忘指令 npm list --depth=0:查看所有高级的npm m ...