此小程序可以分析backrub,enzdes类的聚类logo分析,详细路径是:

/home/wangq/Programs/rosetta_2018.09.60072_bundle/tools/protein_tools/scripts/deep_analysis

帮助文档:

design_analysis.py -h

rosetta deep_analysis的更多相关文章

  1. rosetta common sh: mpiCC command not found解决方法

    在执行多线程编译rosetta时执行: python scons.py bin mode=release extras=mpi -j8 编译安装rosetta 会出现错误sh: mpiCC comma ...

  2. 酶设计软件rosetta安装

    1.Rosetta uses SCons as a compile assistant. You will likely need to download and install this first ...

  3. 外语学习强烈推荐Rosetta Stone

    外语学习强烈推荐Rosetta Stone 外语学习强烈推荐Rosetta Stone

  4. rosetta geometric constraint file(用于match和design)

    cst(constraint file)文件示例: CST::BEGIN TEMPLATE:: ATOM_MAP: atom_name: C6 O4 O2 TEMPLATE:: ATOM_MAP: r ...

  5. ROSETTA使用技巧随笔--relax使用

    Purpose: 主要说目的,relax的作用就是对一个给定的蛋白进行构象搜索,寻找与WT相似并能量低于WT的结构,既包含packer又包含minimizer.主要的应用在对一个结构构象进行取样,获得 ...

  6. ROSETTA使用技巧随笔--蛋白蛋白对接

    先写简略版,以后再详细写. 1. 对输入结构进行预处理(refine) $> relax.default.linuxgccrelease -in:file:s input_files/from_ ...

  7. ROSETTA使用技巧随笔--PyMOL实时观测ROSETTA模拟过程中的结构变化

    没有梦想的人,就是一只咸鱼,像我,就有一个梦想,就是让蛋白模拟过程变成动画,动起来! 虽然MD中有很多方法可以方模拟过程像动画一样播放出来,但是我一直想在ROSETTA中也找一个这样的功能,这不,我发 ...

  8. ROSETTA使用技巧随笔--控制Log输出等级

    一般运行ROSETTA,屏幕上的Log很多,而且很复杂,让我们看着眼晕,现在我们可以通过控制Log等级来控制屏幕上输出的东西.  Integer Level 0 Fatal 100 Error 200 ...

  9. ROSETTA使用技巧随笔--Full Atom Representation和Centroid Representation

    Full Atom Representation vs Centroid Representation Full Atom Representation即全原子标识,氨基酸残基的所有相关原子,均原封不 ...

随机推荐

  1. TensorFlow 图片resize方法

    参见这篇博客 tensorflow里面用于改变图像大小的函数是tf.image.resize_images(image, (w, h), method):image表示需要改变此存的图像,第二个参数改 ...

  2. C语言 · FBI树

    算法训练 FBI树   时间限制:1.0s   内存限制:256.0MB        锦囊1 二叉树. 问题描述 我们可以把由“0”和“1”组成的字符串分为三类:全“0”串称为B串,全“1”串称为I ...

  3. git clone 后误删除了分离出来的文件怎么恢复?

    git clone 后,会分离出项目的文件. 误删除了,可以使用以下命令恢复: #先检查一下git状态 git status #通过如下命令重新分离出文件 git checkout -f HEAD

  4. npm安装package.json中的模块依赖

    npm 一键安装 package.json里的依赖时有2种情况: 1.package.json不存在时 运行命令: npm init可自动创建package.json文件 2.package.json ...

  5. 磁盘 I/O 优化

    磁盘 I/O 优化 1. 性能检测 我们的应用程序通常都需要访问磁盘系统,而磁盘 I/O 通常都很耗时, 要判断 I/O 是否是一个瓶颈,有一些参数指标可以参考. 我们可以压力测试应用程序看系统的 I ...

  6. win2003远程桌面怎么切换到多用户?

    怎么用远程桌面切换server2003的多用户的问题?server2003操作系统的远程桌面是多用户的,就是你的机子远程桌面到服务器而其它机子也可以远程桌面,所以往往有时候你看不到原始的桌面的样子,所 ...

  7. Java Spring MVC 错误 及 常见问题 总结

    [参考]spring入门常见的问题及解决办法 错误: 从Git新获取项目 运行出现 1.org.springframework.beans.factory.BeanDefinitionStoreExc ...

  8. oracle 子查询中null的问题(in 和 not in)

    这里的in后面的句子可以理解为or拼接,简单举例即 in (9566,9839,null)可以等价于mgr=9566 or mgr=9839 or mgr=null, not in (9566,983 ...

  9. 1开放封闭原则OCP

    一.什么是开放封闭原则 开放封闭原则(Open-Closed Principle):一个软件实体 应当对扩展开放,则修改关闭. 在设计一个模块时,应当使得这个模块可以在不被修 改的前提下被扩展.也就是 ...

  10. 从composer上在本地创建一个项目

    在想要创建项目的目录下,输入以下代码