扩增子图表解读6韦恩图:比较组间共有和特有OTU或分类单元



扩增子图表解读6韦恩图:比较组间共有和特有OTU或分类单元的更多相关文章
- 扩增子图表解读5火山图:差异OTU的数量及变化规律
火山图 Volcano plot 在统计学上,火山图是一种类型的散点图,被用于在大数据中快速鉴定变化.由于它的形成像火山喷发的样子,所以被称为火山图.和上文讲的曼哈顿图类似. 火山图基本元素 火山 ...
- 扩增子图表解读3热图:差异菌、OTU及功能
热图是使用颜色来展示数值矩阵的图形.通常还会结合行.列的聚类分析,以表达实验数据多方面的结果. 热图在生物学领域应用广泛,尤其在高通量测序的结果展示中很流行,如样品-基因表达,样品-OTU相对丰度矩 ...
- 扩增子图表解读4曼哈顿图:差异分类级别Taxonomy
曼哈顿图 Manhattan Plot 曼哈顿图本质上是一个散点图,用于显示大量非零大范围波动数值,最早应用于全基因组关联分析(GWAS)研究展示高度相关位点.它得名源于样式与曼哈顿天际线相似(如下图 ...
- 扩增子图表解读1箱线图:Alpha多样性
箱线图 箱形图(Box-plot)又称为盒须图.盒式图或箱线图,是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图.因形状如箱子而得名.在宏基因组领域,常用于展示样品组中各样品Alpha多样性的分布 第一种情 ...
- 宏基因组扩增子图表解读2散点图:组间整体差异分析(Beta多样性)
散点图 数据点在直角坐标系平面上的分布图.在宏基因组领域,散点图常用于展示样品组间的Beta多样性,常用的分析方法有主成分分析(PCA),主坐标轴分析(PCoA/MDS)和限制条件的主坐标轴分析(CP ...
- 扩增子图表解读8网络图:节点OTU或类Venn比较
网络图 Network 网络图虽然给人高大上的感觉,但是由于信息太多,无法给读者提供读有效的可读信息或是读者不知道该理解什么,总是让人望尔却步.那是因为大家太不了解网络,自己读不懂网络想表达的意思及其 ...
- 扩增子分析解读6进化树 Alpha Beta多样性
分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾:我们的OTU获得了物种注释,并学习OTU表的各种操作————添加信息,格式转换,筛选信息. 接下来我们学习对OTU序列的 ...
- 网页图表Highcharts实践教程之标签组与载入动画
网页图表Highcharts实践教程之标签组与载入动画 Highcharts标签组 在图表的大部分元素都提供了标签功能.但很多时候,我们需要额外说明一些信息.这个时候借助原有的图表元素的标签功能就不是 ...
- 扩增子分析解读4去嵌合体 非细菌序列 生成代表性序列和OTU表
本节课程,需要先完成 扩增子分析解读1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类 先看一下扩增子分析的整体流程,从下向上逐层分析 分 ...
随机推荐
- Cisco IOU Web Interface : Web IOU
https://github.com/dainok http://sns.clnchina.com.cn/space.php?uid=404779&do=blog&id=4298 ht ...
- MongoDB:最简单的增删改查(Oops,可能太简单了)
热身运动: 1. 启动MongoDB shell => mongo.exe or ./mongo(先确保有一个mongod的实例): 2. 切换到一个用于练手的namespace => u ...
- unary operator expected
在centos系统从root用户切换到oracle用的时候,总是提示 : -bash- : :[: unary operator expected 能切换成功,就是总提示上面这个, 后来找到原因,在安 ...
- 使用CDN
CDN的全称是Content Delivery Network.中文直译过来是:内容交付网络. 它的主要意思是,将某些内容进行交付的网络.对于站点开发而言,我们所讲的内容通常指的是内容文件(比如jav ...
- Android学习之利用BitmapFactory工厂压缩图片
BufferedInputStream in = new BufferedInputStream( new FileInputStream(new File(path))); BitmapFactor ...
- 使用NDIS驱动监測以太网络活动
转载自: http://blog.csdn.net/ddtpower/article/details/656687 本论文提供了NDIS的主要的理解,应用程序怎样与驱动程序交互.发挥驱动程序最佳性 ...
- 转 java中5种创建对象的方法
作为Java开发者,我们每天创建很多对象,但我们通常使用依赖管理系统,比如spring去创建对象.然而这里有很多创建对象的方法,我们会在这篇文章中学到. Java中有5种创建对象的方式,下面给出它们的 ...
- ios MetalPerformanceShaders 使用总结
MPSCNNConvolution 1.初始化时传人 UnsafePointer<Float> 时要传入w,不能是 &(w[0]).否则w其实传入失败,卷积的结果是nan或inf. ...
- bzoj2243【SDOI2011】染色
2243: [SDOI2011]染色 Time Limit: 20 Sec Memory Limit: 512 MB Submit: 4537 Solved: 1702 [id=2243" ...
- 谈谈c++纯虚函数的意义!
纯虚函数的存在有什么意义呢?相信大学假设有c++这么课程.在讲到纯虚函数时,必然会讲到纯虚函数是面向接口编程的基础. 如今和大家分享下纯虚函数设计的原由.目的.产生的效果. 现代软件project很庞 ...