Cache占用过多内存导致Linux系统内存不足问题排查

问题描述

Linux服务器内存使用量超过阈值，触发报警。

问题排查

首先，通过free命令观察系统的内存使用情况，显示如下：

total       used       free     shared    buffers     cached
Mem:      24675796   24587144      88652          0     357012    1612488
-/+ buffers/cache:   22617644    2058152
Swap:      2096472     108224    1988248

其中，可以看出内存总量为24675796KB，已使用22617644KB，只剩余2058152KB。

然后，接着通过top命令，shift + M按内存排序后，观察系统中使用内存最大的进程情况，发现只占用了18GB内存，其他进程均很小，可忽略。

因此，还有将近4GB内存22617644KB-18GB，约4GB）用到什么地方了呢？

进一步，通过cat /proc/meminfo发现，其中有将近4GB3688732 KB）的Slab内存：

......
Mapped:          25212 kB
Slab:          3688732 kB
PageTables:      43524 kB
...... 

Slab是用于存放内核数据结构缓存，再通过slabtop命令查看这部分内存的使用情况：

OBJS ACTIVE  USE OBJ SIZE  SLABS OBJ/SLAB CACHE SIZE NAME
13926348 13926348 100%    0.21K 773686       18   3494744K dentry_cache
334040 262056  78%    0.09K   8351       40     33404K buffer_head
151040 150537  99%    0.74K  30208        5    120832K ext3_inode_cache

发现其中大部分大约3.5GB）都是用于了dentry_cache。

问题解决

1. 修改/proc/sys/vm/drop_caches，释放Slab占用的cache内存空间参考drop_caches的官方文档）：

Writing to this will cause the kernel to drop clean caches, dentries and inodes from memory, causing that memory to become free.
To free pagecache:
* echo 1 > /proc/sys/vm/drop_caches
To free dentries and inodes:
* echo 2 > /proc/sys/vm/drop_caches
To free pagecache, dentries and inodes:
* echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches
As this is a non-destructive operation, and dirty objects are notfreeable, the user should run "sync" first in order to make sure allcached objects are freed.
This tunable was added in 2.6.16.

2. 方法1需要用户具有root权限，如果不是root，但有sudo权限，可以通过sysctl命令进行设置：

$sync
$sudo sysctl -w vm.drop_caches=3
$sudo sysctl -w vm.drop_caches=0 #recovery drop_caches

操作后可以通过sudo sysctl -a | grep drop_caches查看是否生效。

3. 修改/proc/sys/vm/vfs_cache_pressure，调整清理inode/dentry caches的优先级默认为100），LinuxInsight中有相关的解释：

At the default value of vfs_cache_pressure = 100 the kernel will attempt to reclaim dentries and inodes at a “fair” rate with respect to pagecache and swapcache reclaim. Decreasing vfs_cache_pressure causes the kernel to prefer to retain dentry and inode caches. Increasing vfs_cache_pressure beyond 100 causes the kernel to prefer to reclaim dentries and inodes.

具体的设置方法，可以参考方法1或者方法2均可。

参考资料

https://www.kernel.org/doc/Documentation/sysctl/vm.txt

http://major.io/2008/12/03/reducing-inode-and-dentry-caches-to-keep-oom-killer-at-bay/

http://linux-mm.org/Drop_Caches

以下记录的是进一步排查的进展情况。

更深层次的原因

上文排查到Linux系统中有大量的dentry_cache占用内存，为什么会有如此多的dentry_cache呢？

1. 首先，弄清楚dentry_cache的概念及作用：目录项高速缓存，是Linux为了提高目录项对象的处理效率而设计的；它记录了目录项到inode的映射关系。因此，当应用程序发起stat系统调用时，就会创建对应的dentry_cache项更进一步，如果每次stat的文件都是不存在的文件，那么总是会有大量新的dentry_cache项被创建）。

2. 当前服务器是storm集群的节点，首先想到了storm相关的工作进程，strace一下storm的worker进程发现其中有非常频繁的stat系统调用发生，而且stat的文件总是新的文件名：

sudo strace -fp -e trace=stat

3. 进一步观察到storm的worker进程会在本地目录下频繁的创建、打开、关闭、删除心跳文件，每秒钟一个新的文件名：

sudo strace -fp -e trace=open,stat,close,unlink

以上就是系统中为何有如此多的dentry_cache的原因所在。

一个奇怪的现象

通过观察/proc/meminfo发现，slab内存分为两部分：

SReclaimable // 可回收的slab
SUnreclaim // 不可回收的slab

当时服务器的现状是：slab部分占用的内存，大部分显示的都是SReclaimable，也就是说可以被回收的。

但是通过slabtop观察到slab内存中最主要的部分dentry_cache）的OBJS几乎都是ACTIVE的，显示100%处于被使用状态。

OBJS ACTIVE  USE OBJ SIZE  SLABS OBJ/SLAB CACHE SIZE NAME
13926348 13926348 100%    0.21K 773686       18   3494744K dentry_cache
334040 262056  78%    0.09K   8351       40     33404K buffer_head
151040 150537  99%    0.74K  30208        5    120832K ext3_inode_cache

为什么显示可回收的，但是又处于ACTIVE状态呢？求Linux内核达人看到后热心解释下：

会不会由于是ACTIVE状态，导致dcache没有被自动回收释放掉呢？

让系统自动回收dcache

上一小节，我们已经提到，服务器上大部分的slab内存是SReclaimable可回收状态的，那么，我们能不能交给操作系统让他在某个时机自动触发回收操作呢？答案是肯定的。

查了一些关于Linux dcache的相关资料，发现操作系统会在到了内存临界阈值后，触发kswapd内核进程工作才进行释放，这个阈值的计算方法如下：

1. 首先，grep low /proc/zoneinfo，得到如下结果：

        low      1
        low      380
        low      12067

2. 将以上3列加起来，乘以4KB，就是这个阈值，通过这个方法计算后发现当前服务器的回收阈值只有48MB，因此很难看到这一现象，实际中可能等不到回收，操作系统就会hang住没响应了。

3. 可以通过以下方法调大这个阈值：将vm.extra_free_kbytes设置为vm.min_free_kbytes和一样大，则/proc/zoneinfo中对应的low阈值就会增大一倍，同时high阈值也会随之增长，以此类推。

$ sudo sysctl -a | grep free_kbytes
vm.min_free_kbytes = 39847
vm.extra_free_kbytes = 0
$ sudo sysctl -w vm.extra_free_kbytes=836787  ######1GB

4. 举个例子，当low阈值被设置为1GB的时候，当系统free的内存小于1GB时，观察到kswapd进程开始工作进程状态从Sleeping变为Running），同时dcache开始被系统回收，直到系统free的内存介于low阈值和high阈值之间，停止回收。

http://www.cnblogs.com/panfeng412/p/drop-caches-under-linux-system-2.html