python 字典和列表的读取速度问题

最近在进行基因组数据处理的时候,需要读取较大数据(2.7G)存入字典中,然后对被处理数据进行字典key值的匹配,在被处理文件中每次读取一行进行处理后查找是否在字典的keys中,以下两段代码的效率差别非常大:

第一段:

if(pos in fre_dist.keys()):
newvalue= fre_dist[pos]

第二段:

if(pos in fre_dist):
newValue=fre_dist[pos]

在处理3万条数据时,第二段代码的速度是第一段代码速度的上千倍。

原因是:第一段代码 fre_dist.keys()变成了list,python在检索list的时候是比较慢的,第二段代码 fre_dist是字典,python在检索字典的时候速度是比较快的。

血的教训。

dict结构,我想大多数人都会想到 for key in dictobj 的方法,确实这个方法在大多数情况下都是适用的。但是并不是完全安全,请看下面这个例子:

复制代码代码如下:
#这里初始化一个dict
>>> d = {'a':1, 'b':0, 'c':1, 'd':0}
#本意是遍历dict,发现元素的值是0的话,就删掉
>>> for k in d:
...   if d[k] == 0:
...     del(d[k])
... 
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
RuntimeError: dictionary changed size during iteration
#结果抛出异常了,两个0的元素,也只删掉一个。
>>> d
{'a': 1, 'c': 1, 'd': 0}

>>> d = {'a':1, 'b':0, 'c':1, 'd':0}
#d.keys() 是一个下标的数组
>>> d.keys()
['a', 'c', 'b', 'd']
#这样遍历,就没问题了,因为其实其实这里遍历的是d.keys()这个list常量。
>>> for k in d.keys():
...   if d[k] == 0:
...     del(d[k])
... 
>>> d
{'a': 1, 'c': 1}
#结果也是对的
>>>

其实,这个例子是我简化过的,我是在一个多线程的程序里发现这个问题的,所以,我的建议是:遍历dict的时候,养成使用 for k in d.keys() 的习惯。
不过,如果是多线程的话,这样就绝对安全吗?也不见得:当两个线程都取完d.keys()以后,如果两个线程都去删同一个key的话,先删的会成功,后删的那个肯定会报 KeyError ,这个看来只能通过其他方式来保证了。

另一篇:dict 两种遍历方式的性能对比

关于纠结dict遍历中带括号与不带括号的性能问题

复制代码代码如下:
for (d,x) in dict.items():
     print "key:"+d+",value:"+str(x)

for d,x in dict.items():
    print "key:"+d+",value:"+str(x)

我们可以看出,dict条数在200一下的时候是带括号的性能比较高一点,但是在200条以上的数据后不带括号的执行时间会少些.

字典用花括号({})表示,里面的项成对出现,一个 key 对应一个 value;key 与 value
之间用冒号(:)分隔;不同的项之间用逗号(,)分隔。

Python Shell:

n = {'username':'zz',"password":123}
n.keys()
dict_keys(['username', 'password'])
n.values()
dict_keys(['zz', 123])

n.items()
dict_items([('username', 'zc'), ('password', 123)])

for (k,v) in n.items():
        print("this's key:%r" %k)
        print("this's value:%r" %v")

this's key:'username'
this's value:'zc'
this's key:'password'
this's value:123

zip():就是依次取出每一个数组的元素,然后组合

n = [1,2,3]
m = ['a','b','c']
a = zip(m,n)

for i in a:
    print(i)

('a', 1)
('b', 2)
('c', 3)
n = [1,2,3]
m = ['a','b','c']
a = zip(m,n)

for (m,n) in a:
        print(m,n)

a 1
b 2
c 3

range合并:

for i in range(48,58)+range(65,91):    c8=chr(i);

python 字典dict和列表list的读取速度问题, range合并的更多相关文章

  1. Python 字典 dict() 函数

    描述 Python 字典 dict() 函数用于创建一个新的字典,用法与 Pyhon 字典 update() 方法相似. 语法 dict() 函数函数语法: dict(key/value) 参数说明: ...

  2. 'dict_values' object does not support indexing, Python字典dict中由value查key

    Python字典dict中由value查key 众所周知,字典dict最大的好处就是查找或插入的速度极快,并且不想列表list一样,随着key的增加越来越复杂.但是dict需要占用较大的内存空间,换句 ...

  3. python 字典dict - python基础入门(15)

    前面的课程讲解了字符串str/列表list/元组tuple,还有最后一种比较重要的数据类型也需要介绍介绍,那就是python字典,俗称:dict. python中的字典可与字符串/列表/元组不同,因为 ...

  4. python字典dict的增、删、改、查操作

    ## python字典dict的增.删.改.查操作dict = {'age': 18, 'name': 'jin', 'sex': 'male', }#增# dict['heigh'] = 185 # ...

  5. python中的字典(dict),列表(list),元组(tuple)

    一,List:列表 python内置的一种数据类型是列表:list.list是一种有序的数据集合,可以随意的添加和删除其中的数据.比如列出班里所有的同学的名字,列出所有工厂员工的工号等都是可以用到列表 ...

  6. 使用 json 模块,使json数据格式与Python字典dict数据格式互相转换,获取数据更加方便

    一.定义 JSON 是一种数据格式 使用 javaScript (Java 死鬼破特)对象表示法 二.特点 1.JSON 与 XML格式数据的区别 ====== 两种格式的数据,都是跨语言,跨平台 c ...

  7. python 字典 dict 该注意的一些操作

    在用python处理dict 的时候,有几个该注意的地方,这里跟大家提一下: 1)操作dict 时,尽量少产生新的列表对象.比如: 遍历dict的时候,如果用 dic = {"a" ...

  8. python 字典(dict)按键和值排序

    python 字典(dict)的特点就是无序的,按照键(key)来提取相应值(value),如果我们需要字典按值排序的话,那可以用下面的方法来进行: 1 下面的是按照value的值从大到小的顺序来排序 ...

  9. Python字典(dict)使用技巧

    字典dict是Python中使用频率非常高的数据结构,关于它的使用,也有许多的小技巧,掌握这些小技巧会让你高效地的使用dict,也会让你的代码更简洁. 1.默认值 假设name_for_userid存 ...

随机推荐

  1. [BZOJ1040] [ZJOI2008]骑士 解题报告

    Description Z国的骑士团是一个很有势力的组织,帮会中汇聚了来自各地的精英.他们劫富济贫,惩恶扬善,受到社会各界的赞扬.最近发生了一件可怕的事情,邪恶的Y国发动了一场针对Z国的侵略战争.战火 ...

  2. Django【进阶】信号

    -信号 Django中提供了“信号调度”,用于在框架执行操作时解耦.通俗来讲,就是一些动作发生的时候,信号允许特定的发送者去提醒一些接受者.   问题:如何对所有数据库添加操作进行日志记录? 问题:信 ...

  3. Linux内核态抢占机制分析【转】

    转自:http://blog.csdn.net/yiyeguzhou100/article/details/53097665 目录(?)[-] 1非抢占式和可抢占式内核的区别 21 用户态抢占User ...

  4. TortoiseSVN安装使用【转】

    转自:http://www.cnblogs.com/rushoooooo/archive/2011/04/29/2032346.html TortoiseSVN是windows平台下Subversio ...

  5. Oracle exp

    --导出表exp userid=hr/oracle123 tables=employees direct=y file=/u01/employees.dmp log=/u01/employees.lo ...

  6. echarts 图表建立步骤

    需要引用的文件 <script src="web/mobile/js/jquery-1.8.3.min.js"></script> <script s ...

  7. 《锋利的jQuery》读书要点笔记6——制作商城网页:结构和样式设计

    第8章 用jQuery打造个性网站 做一个购物网站并用jQuery来完善.大体步骤是: 收集素材 确定网站结构 A. 文件结构,imagea文件夹用来存放将要用到的图片,styles文件夹存放CSS, ...

  8. MATLAB中的积分运算

    MATLAB中计算一元函数的(不)定积分使用int函数. ①int(s)计算符号表达式s的不定积分 syms x;s = x^2;int(s) 计算x^2的不定积分. ②int(s,x)计算符号表达式 ...

  9. MATLAB多项式及多项式拟合

    多项式均表示为数组形式,数组元素为多项式降幂系数 1.      polyval函数 求多项式在某一点或某几个点的值. p = [1,1,1];%x^2+x+1 x = [-1,0,1];y = po ...

  10. [转]CreateDIBitmap与CreateDIBSection

    首先明确最主要区别:CreateDIBitmap创建的是设备相关位图句柄 - HBITMAP.                               CreateDIBSection创建的是设备 ...