limma:Linear Models for Microarray and RNA-Seq Data

http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/limma.html

安装

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager") BiocManager::install("limma")

使用

library("limma")

usersguide:http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/limma/inst/doc/usersguide.pdf

limma中的函数查询:http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/manuals/limma/man/limma.pdf

												

limma 包的更多相关文章

  1. 简单使用limma做差异分析

    简单使用limma做差异分析 Posted: 五月 12, 2017  Under: Transcriptomics  By Kai  no Comments 首先需要说明的是,limma是一个非常全 ...

  2. 使用limma、Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌

    使用limma.Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌 Charity Law1, Monther Alhamdoosh2, Shian Su3, Xueyi Dong3, Luyi ...

  3. R包安装的正确方式

    options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) if(! req ...

  4. R包MetaboAnalystR安装指南(Linux环境非root)

    前言 这是代谢组学数据分析的一个R包,包括用于代谢组学数据分析.可视化和功能注释等众多功能.最近有同事在集群中搭建蛋白和代谢流程,安装这个包出现了问题,于是我折腾了一上午. 这个包的介绍在:https ...

  5. 多组学分析及可视化R包

    最近打算开始写一个多组学(包括宏基因组/16S/转录组/蛋白组/代谢组)关联分析的R包,避免重复造轮子,在开始之前随便在网上调研了下目前已有的R包工具,部分罗列如下: 1. mixOmics 应该是在 ...

  6. Npm包的开发

    个人开发包的目录结构 ├── coverage //istanbul测试覆盖率生成的文件 ├── index.js //入口文件 ├── introduce.md //说明文件 ├── lib │   ...

  7. Windows server 2012 添加中文语言包(英文转为中文)(离线)

    Windows server 2012 添加中文语言包(英文转为中文)(离线) 相关资料: 公司环境:亚马孙aws虚拟机 英文版Windows2012 中文SQL Server2012安装包,需要安装 ...

  8. 如何在nuget上传自己的包+搭建自己公司的NuGet服务器(新方法)

    运维相关:http://www.cnblogs.com/dunitian/p/4822808.html#iis 先注册一个nuget账号https://www.nuget.org/ 下载并安装一下Nu ...

  9. android http 抓包

    有时候想开发的时候想看APP发出的http请求和响应是什么,这就需要抓包了,这可以得到一些不为人知的api,比如还可以干些“坏事”... 需要工具: Fiddler2 抓包(点击下载) Android ...

随机推荐

  1. 完全图解 HTTPS

    安全基础 我们先来看下数据在互联网上数据传递可能会出现的三个比较有代表性的问题,其实后面提到的所有方法,都是围绕解决这三个问题而提出来的. 窃听 伪造 否认 对称密钥加密 假设 A 正在通过互联网向  ...

  2. 对比度增强(二):直方图正规划与伽马变换 cv.normal()函数使用及原理

    直方图正规化: 图像为I,宽为W,高为H,I(r,c)代表I的第r行第c列的灰度值:输出图像记为O,为使得输出图像的灰度值在[Omin,Omax]范围里,可用如下公式:                 ...

  3. 电脑远程连接windows阿里云服务器解决卡顿【小白教程】

    我们在阿里云服务器网页上进行远程连接进行操作,会卡顿.解决办法如下: 1.登录阿里云服务器,进入服务器控制台,复制服务器IP:  2.回到桌面,打开cmd命令窗口,输入mstsc  3.在‘’计算机’ ...

  4. pandas-19 DataFrame读取写入文件的方法

    pandas-19 DataFrame读取写入文件的方法 DataFrame有非常丰富的IO方法,比如DataFrame读写csv文件excel文件等等,操作很简单.下面在代码中标记出来一些常用的读写 ...

  5. Node.js 连接 MongoDB数据库

    安装指令:npm install mongodb var mongodb = require("mongodb");// console.log(mongodb); var Mon ...

  6. echarts自定义悬浮框的显示

    最近在使用echarts的地图功能 ,业务需求是显示前五的具体信息,并且轮流显示,首先解决轮流显示的问题 var counta = 0; //播放所在下标 var mTime = setInterva ...

  7. jsonserver的安装及启动

    JsonServer 主要的作用就是搭建本地的数据接口,创建json文件,便于调试调用 是一个 Node 模块,运行 Express 服务器,可以指定一个 json 文件作为 api 的数据源 官网: ...

  8. The Vertu of the Dyamaund钻石

    dyamaund and the English words dyamaund The Vertu of the Dyamaund": Gemstones, Knowledge and Va ...

  9. 【故障处理】imp-00051,imp-00008

    [故障处理]imp-00051,imp-00008 1.1  BLOG文档结构图 1.2  故障分析及解决过程 imp导入报错: IMP-00051: Direct path exported dum ...

  10. Unity 渲染教程余下

    可能来源于(英文):https://catlikecoding.com/unity/tutorials/ Unity渲染教程(一):矩阵           http://gad.qq.com/pro ...