limma 包
limma:Linear Models for Microarray and RNA-Seq Data
http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/limma.html
安装
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("limma")
使用
library("limma")
usersguide:http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/limma/inst/doc/usersguide.pdf
limma中的函数查询:http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/manuals/limma/man/limma.pdf
limma 包的更多相关文章
- 简单使用limma做差异分析
简单使用limma做差异分析 Posted: 五月 12, 2017 Under: Transcriptomics By Kai no Comments 首先需要说明的是,limma是一个非常全 ...
- 使用limma、Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌
使用limma.Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌 Charity Law1, Monther Alhamdoosh2, Shian Su3, Xueyi Dong3, Luyi ...
- R包安装的正确方式
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) if(! req ...
- R包MetaboAnalystR安装指南(Linux环境非root)
前言 这是代谢组学数据分析的一个R包,包括用于代谢组学数据分析.可视化和功能注释等众多功能.最近有同事在集群中搭建蛋白和代谢流程,安装这个包出现了问题,于是我折腾了一上午. 这个包的介绍在:https ...
- 多组学分析及可视化R包
最近打算开始写一个多组学(包括宏基因组/16S/转录组/蛋白组/代谢组)关联分析的R包,避免重复造轮子,在开始之前随便在网上调研了下目前已有的R包工具,部分罗列如下: 1. mixOmics 应该是在 ...
- Npm包的开发
个人开发包的目录结构 ├── coverage //istanbul测试覆盖率生成的文件 ├── index.js //入口文件 ├── introduce.md //说明文件 ├── lib │ ...
- Windows server 2012 添加中文语言包(英文转为中文)(离线)
Windows server 2012 添加中文语言包(英文转为中文)(离线) 相关资料: 公司环境:亚马孙aws虚拟机 英文版Windows2012 中文SQL Server2012安装包,需要安装 ...
- 如何在nuget上传自己的包+搭建自己公司的NuGet服务器(新方法)
运维相关:http://www.cnblogs.com/dunitian/p/4822808.html#iis 先注册一个nuget账号https://www.nuget.org/ 下载并安装一下Nu ...
- android http 抓包
有时候想开发的时候想看APP发出的http请求和响应是什么,这就需要抓包了,这可以得到一些不为人知的api,比如还可以干些“坏事”... 需要工具: Fiddler2 抓包(点击下载) Android ...
随机推荐
- 解决老大难疑惑:指针 vs 引用
▶疑问描述 1. 引用reference的本质: 常指针 ——> 什么时候用指针?= 就按Java中的引用变量那样用? ——> 什么时候用引用? ①函数的入参/返回值时 ②T&am ...
- [Windows] - DNS防污染工具Pcap_DNSProxy
最近试过非常多的DNS防污染工具(包括:dnsforwarder.dnsforwarder.dnscrypt-proxy.SimpleDNSCrypt等),感觉这个Pcap_DNSProxy简单.快捷 ...
- Java自学-数字与字符串 字符串
Java中的字符串String 示例 1 : 创建字符串 字符串即字符的组合,在Java中,字符串是一个类,所以我们见到的字符串都是对象 常见创建字符串手段: 每当有一个字面值出现的时候,虚拟机就会创 ...
- 网址URL分解
http://www.joymood.cn:8080/test.php?user=admin&pwd=admin#login 1.location.href:得到整个如上的完整url 2.lo ...
- Java 之 异常基础
一.异常概念 异常:指的是程序在执行过程中,出现的非正常的情况,最终会导致 JVM 的非正常停止. 在 Java 等面向对象的编程语言中,异常本身就是一个类,产生异常就是创建异常对象并抛出了一个异常对 ...
- JavaScript 之 取消 a 标签的默认行为
方式一 语法格式: <a href="javascript:;">百度</a> javascript: 是一个伪协议,其他的伪协议还有 mail: tel ...
- 英语apyrite红碧玺apyrite单词
红碧玺(apyrite)是粉红.桃红.玫瑰红.深红.紫红等以红色调为主的碧玺,矿物学上主要属于锂电气石和镁电气石.红色起因可能与微量锰及锂和铯有关. 红色是碧玺中价值最高的,其中以紫红色和玫瑰红色最佳 ...
- AI面试刷题版
(1)代码题(leetcode类型),主要考察数据结构和基础算法,以及代码基本功 虽然这部分跟机器学习,深度学习关系不大,但也是面试的重中之重.基本每家公司的面试都问了大量的算法题和代码题,即使是商汤 ...
- Java 7 NIO.2学习(Ing)
Path类 1.Path的基本用法 Path代表文件系统中的位置,即文件的逻辑路径,并不代表物理路径,程序运行的时候JVM会把Path(逻辑路径)对应到运行时的物理位置上. package com.j ...
- 购买了一台阿里云ECS后安装Java项目运行环境
在docker等虚拟化技术大行其道的今天,我原本也想在我买的ECS服务器里全系使用docker技术,只可惜在我尝试后发现我的ECS配置不够高,整个服务器卡到爆炸,无奈只能使用最原始的方式. 我买的服务 ...