limma 包
limma:Linear Models for Microarray and RNA-Seq Data
http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/limma.html
安装
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("limma")
使用
library("limma")
usersguide:http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/limma/inst/doc/usersguide.pdf
limma中的函数查询:http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/manuals/limma/man/limma.pdf
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