0803-PyTorch的Debug指南

0803-PyTorch的Debug指南

目录

• 一、ipdb 介绍
• 二、ipdb 的使用
• 三、在 PyTorch 中 Debug
• 四、 通过PyTorch实现项目中容易遇到的问题
• 五、第八章总结

pytorch完整教程目录：https://www.cnblogs.com/nickchen121/p/14662511.html

一、ipdb 介绍

很多初学 python 的同学会使用 print 或 log 调试程序，但是这只在小规模的程序下调试很方便，更好的调试应该是在一边运行的时候一边检查里面的变量和方法。

感兴趣的可以去了解 pycharm 的 debug 模式，功能也很强大，能够满足一般的需求，这里不多做赘述，我们这里介绍一个更适用于 pytorch 的一个灵活的 pdb 交互式调试工具。

Pdb 是一个交互式的调试工具，集成与 Python 标准库中，它能让你根据需求跳转到任意的 Python 代码断点、查看任意变量、单步执行代码，甚至还能修改变量的值，而没有必要去重启程序。

ipdb 则是一个增强版的 pdb，它提供了调试模式下的代码自动补全，还有更好的语法高亮和代码溯源，以及更好的内省功能，最重要的是它和 pdb 接口完全兼容，可以通过 pip install ipdb 安装。

二、ipdb 的使用

首先看一个例子，要使用 ipdb 的话，只需要在想要进行调试的地方插入 ipdb.set_trace()，当代码运行到这个地方时，就会自动进入交互式调试模式。

import ipdb

def sum(x):
    r = 0
    for ii in x:
        r += ii
    return r

def mul(x):
    r = 1
    for ii in x:
        r *= 11
    return r

ipdb.set_trace()
x = [1, 2, 3, 4, 5]
r = sum(x)
r = mul(x)

> /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py(19)<module>()
     18 ipdb.set_trace()
---> 19 x = [1, 2, 3, 4, 5]
     20 r = sum(x)

ipdb> l 1,5  # l(ist) 1,5 的缩写，查看第 1 行到第 5 行的代码
      1 import ipdb
      2
      3
      4 def sum(x):
      5     r = 0

ipdb> n  # n(ext) 的缩写执行下一步
> /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py(20)<module>()
     19 x = [1, 2, 3, 4, 5]
---> 20 r = sum(x)
     21 r = mul(x)

ipdb> s  # s(tep) 的缩写，进入 sum 函数内部
--Call--
> /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py(4)sum()
      3
----> 4 def sum(x):
      5     r = 0

ipdb> n  # n(ext) 单步执行
> /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py(5)sum()
      4 def sum(x):
----> 5     r = 0
      6     for ii in x:

ipdb> n
> /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py(6)sum()
      5     r = 0
----> 6     for ii in x:
      7         r += ii

ipdb> u  # u(p) 的缩写，调回上一层的调用
> /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py(20)<module>()
     19 x = [1, 2, 3, 4, 5]
---> 20 r = sum(x)
     21 r = mul(x)

ipdb> d  # d(own) 的缩写，跳到调用的下一层
> /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py(6)sum()
      5     r = 0
----> 6     for ii in x:
      7         r += ii

ipdb> n
> /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py(7)sum()
      6     for ii in x:
----> 7         r += ii
      8     return r

ipdb> !r  # 查看变量 r 的值，该变量名与调试命令 `r(eturn)` 冲突
0

ipdb> return  # 继续运行知道函数返回
--Return--
15
> /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py(8)sum()
      7         r += ii
----> 8     return r
      9 

ipdb> n
> /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py(21)<module>()
     19 x = [1, 2, 3, 4, 5]
     20 r = sum(x)
---> 21 r = mul(x)

ipdb> x  # 查看变量 x
[1, 2, 3, 4, 5]

ipdb> x[0] = 10000  # 修改变量 x

ipdb> x
[10000, 2, 3, 4, 5]

ipdb> b 12  # b(reak) 的缩写，在第 10 行设置断点
Breakpoint 1 at /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py:12

ipdb> c  # c(ontinue) 的缩写，继续运行，直到遇到断点
> /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py(12)mul()
     11 def mul(x):
1--> 12     r = 1
     13     for ii in x:

ipdb> return  # 可以看到计算的是修改之后的 x 的乘积
--Return--
1200000
> /Users/mac/Desktop/jupyter/test.py(15)mul()
     14         r *= ii
---> 15     return r
     16 

ipdb> q  # q(uit) 的缩写，退出 debug

上述只是给出了 ipdb 的一部分使用方法，关于 ipdb 还有一些小的使用技巧：

• 键能够自动补齐，补齐用法和 IPython 中的类似
• j(ump) 能够跳过中间某些行的代码的执行
• 可以直接在 ipdb 中修改变量的值
• help 能够查看调试命令的用法，比如 h h 可以查看 help 命令的用法，h j(ump) 能够查看 j(ump) 命令的用法

三、在 PyTorch 中 Debug

PyTorch 作为一个动态图框架，和 ipdb 结合使用能够让调试过程更加便捷，下面我们将距离说明以下三点：

• 如何在 PyTorch 中查看神经网络各个层的输出
• 如何在 PyTorch 中分析各个参数的梯度
• 如何动态修改 PyTorch 的训练流程

首先，运行上一篇文章给出的“猫狗大战”程序：python main.py train --debug-file='debug/debug.txt'

程序运行一段时间后，在debug目录下创建debug.txt标识文件，当程序检测到这个文件存在时，会自动进入debug模式。

99it [00:17,  6.07it/s]loss: 0.22854854568839075
119it [00:21,  5.79it/s]loss: 0.21267264398435753
139it [00:24,  5.99it/s]loss: 0.19839374726372108
> e:/Users/mac/Desktop/jupyter/mdFile/deeplearning/main.py(80)train()
     79         loss_meter.reset()
---> 80         confusion_matrix.reset()
     81         for ii, (data, label) in tqdm(enumerate(train_dataloader)):

ipdb> break 88    # 在第88行设置断点，当程序运行到此处进入debug模式
Breakpoint 1 at e:/Users/mac/Desktop/jupyter/mdFile/deeplearning/main.py:88

ipdb> # 打印所有参数及其梯度的标准差
for (name,p) in model.named_parameters(): \
    print(name,p.data.std(),p.grad.data.std())
model.features.0.weight tensor(0.2615, device='cuda:0') tensor(0.3769, device='cuda:0')
model.features.0.bias tensor(0.4862, device='cuda:0') tensor(0.3368, device='cuda:0')
model.features.3.squeeze.weight tensor(0.2738, device='cuda:0') tensor(0.3023, device='cuda:0')
model.features.3.squeeze.bias tensor(0.5867, device='cuda:0') tensor(0.3753, device='cuda:0')
model.features.3.expand1x1.weight tensor(0.2168, device='cuda:0') tensor(0.2883, device='cuda:0')
model.features.3.expand1x1.bias tensor(0.2256, device='cuda:0') tensor(0.1147, device='cuda:0')
model.features.3.expand3x3.weight tensor(0.0935, device='cuda:0') tensor(0.1605, device='cuda:0')
model.features.3.expand3x3.bias tensor(0.1421, device='cuda:0') tensor(0.0583, device='cuda:0')
model.features.4.squeeze.weight tensor(0.1976, device='cuda:0') tensor(0.2137, device='cuda:0')
model.features.4.squeeze.bias tensor(0.4058, device='cuda:0') tensor(0.1798, device='cuda:0')
model.features.4.expand1x1.weight tensor(0.2144, device='cuda:0') tensor(0.4214, device='cuda:0')
model.features.4.expand1x1.bias tensor(0.4994, device='cuda:0') tensor(0.0958, device='cuda:0')
model.features.4.expand3x3.weight tensor(0.1063, device='cuda:0') tensor(0.2963, device='cuda:0')
model.features.4.expand3x3.bias tensor(0.0489, device='cuda:0') tensor(0.0719, device='cuda:0')
model.features.6.squeeze.weight tensor(0.1736, device='cuda:0') tensor(0.3544, device='cuda:0')
model.features.6.squeeze.bias tensor(0.2420, device='cuda:0') tensor(0.0896, device='cuda:0')
model.features.6.expand1x1.weight tensor(0.1211, device='cuda:0') tensor(0.2428, device='cuda:0')
model.features.6.expand1x1.bias tensor(0.0670, device='cuda:0') tensor(0.0162, device='cuda:0')
model.features.6.expand3x3.weight tensor(0.0593, device='cuda:0') tensor(0.1917, device='cuda:0')
model.features.6.expand3x3.bias tensor(0.0227, device='cuda:0') tensor(0.0160, device='cuda:0')
model.features.7.squeeze.weight tensor(0.1207, device='cuda:0') tensor(0.2179, device='cuda:0')
model.features.7.squeeze.bias tensor(0.1484, device='cuda:0') tensor(0.0381, device='cuda:0')
model.features.7.expand1x1.weight tensor(0.1235, device='cuda:0') tensor(0.2279, device='cuda:0')
model.features.7.expand1x1.bias tensor(0.0450, device='cuda:0') tensor(0.0100, device='cuda:0')
model.features.7.expand3x3.weight tensor(0.0609, device='cuda:0') tensor(0.1628, device='cuda:0')
model.features.7.expand3x3.bias tensor(0.0132, device='cuda:0') tensor(0.0079, device='cuda:0')
model.features.9.squeeze.weight tensor(0.1093, device='cuda:0') tensor(0.2459, device='cuda:0')
model.features.9.squeeze.bias tensor(0.0646, device='cuda:0') tensor(0.0135, device='cuda:0')
model.features.9.expand1x1.weight tensor(0.0840, device='cuda:0') tensor(0.1860, device='cuda:0')
model.features.9.expand1x1.bias tensor(0.0177, device='cuda:0') tensor(0.0033, device='cuda:0')
model.features.9.expand3x3.weight tensor(0.0476, device='cuda:0') tensor(0.1393, device='cuda:0')
model.features.9.expand3x3.bias tensor(0.0058, device='cuda:0') tensor(0.0030, device='cuda:0')
model.features.10.squeeze.weight tensor(0.0872, device='cuda:0') tensor(0.1676, device='cuda:0')
model.features.10.squeeze.bias tensor(0.0484, device='cuda:0') tensor(0.0088, device='cuda:0')
model.features.10.expand1x1.weight tensor(0.0859, device='cuda:0') tensor(0.2145, device='cuda:0')
model.features.10.expand1x1.bias tensor(0.0160, device='cuda:0') tensor(0.0025, device='cuda:0')
model.features.10.expand3x3.weight tensor(0.0456, device='cuda:0') tensor(0.1429, device='cuda:0')
model.features.10.expand3x3.bias tensor(0.0070, device='cuda:0') tensor(0.0021, device='cuda:0')
model.features.11.squeeze.weight tensor(0.0786, device='cuda:0') tensor(0.2003, device='cuda:0')
model.features.11.squeeze.bias tensor(0.0422, device='cuda:0') tensor(0.0069, device='cuda:0')
model.features.11.expand1x1.weight tensor(0.0690, device='cuda:0') tensor(0.1400, device='cuda:0')
model.features.11.expand1x1.bias tensor(0.0138, device='cuda:0') tensor(0.0022, device='cuda:0')
model.features.11.expand3x3.weight tensor(0.0366, device='cuda:0') tensor(0.1517, device='cuda:0')
model.features.11.expand3x3.bias tensor(0.0109, device='cuda:0') tensor(0.0023, device='cuda:0')
model.features.12.squeeze.weight tensor(0.0729, device='cuda:0') tensor(0.1736, device='cuda:0')
model.features.12.squeeze.bias tensor(0.0814, device='cuda:0') tensor(0.0084, device='cuda:0')
model.features.12.expand1x1.weight tensor(0.0977, device='cuda:0') tensor(0.1385, device='cuda:0')
model.features.12.expand1x1.bias tensor(0.0102, device='cuda:0') tensor(0.0032, device='cuda:0')
model.features.12.expand3x3.weight tensor(0.0365, device='cuda:0') tensor(0.1312, device='cuda:0')
model.features.12.expand3x3.bias tensor(0.0038, device='cuda:0') tensor(0.0026, device='cuda:0')
model.classifier.1.weight tensor(0.0285, device='cuda:0') tensor(0.0865, device='cuda:0')
model.classifier.1.bias tensor(0.0362, device='cuda:0') tensor(0.0192, device='cuda:0')

ipdb> opt.lr    # 查看学习率
0.001

ipdb> opt.lr = 0.002    # 更改学习率

ipdb> for p in optimizer.param_groups: \
    p['lr'] = opt.lr

ipdb> model.save()    # 保存模型
'checkpoints/squeezenet_20191004212249.pth'

ipdb> c    # 继续运行，直到第88行暂停
222it [16:38, 35.62s/it]> e:/Users/mac/Desktop/jupyter/mdFile/deeplearning/main.py(88)train()
     87             optimizer.zero_grad()
1--> 88             score = model(input)
     89             loss = criterion(score, target)

ipdb> s    # 进入model(input)内部，即model.__call__(input)
--Call--
> c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\torch\nn\modules\module.py(537)__call__()
    536
--> 537     def __call__(self, *input, **kwargs):
    538         for hook in self._forward_pre_hooks.values():

ipdb> n    # 下一步
> c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\torch\nn\modules\module.py(538)__call__()
    537     def __call__(self, *input, **kwargs):
--> 538         for hook in self._forward_pre_hooks.values():
    539             result = hook(self, input)

ipdb> n    # 下一步
> c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\torch\nn\modules\module.py(544)__call__()
    543                 input = result
--> 544         if torch._C._get_tracing_state():
    545             result = self._slow_forward(*input, **kwargs)

ipdb> n    # 下一步
> c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\torch\nn\modules\module.py(547)__call__()
    546         else:
--> 547             result = self.forward(*input, **kwargs)
    548         for hook in self._forward_hooks.values():

ipdb> s    # 进入forward函数内容
--Call--
> c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\torch\nn\modules\loss.py(914)forward()
    913
--> 914     def forward(self, input, target):
    915         return F.cross_entropy(input, target, weight=self.weight,

ipdb> input    # 查看input变量值
tensor([[4.5005, 2.0725],
        [3.5933, 7.8643],
        [2.9086, 3.4209],
        [2.7740, 4.4332],
        [6.0164, 2.3033],
        [5.2261, 3.2189],
        [2.6529, 2.0749],
        [6.3259, 2.2383],
        [3.0629, 3.4832],
        [2.7008, 8.2818],
        [5.5684, 2.1567],
        [3.0689, 6.1022],
        [3.4848, 5.3831],
        [1.7920, 5.7709],
        [6.5032, 2.8080],
        [2.3071, 5.2417],
        [3.7474, 5.0263],
        [4.3682, 3.6707],
        [2.2196, 6.9298],
        [5.2201, 2.3034],
        [6.4315, 1.4970],
        [3.4684, 4.0371],
        [3.9620, 1.7629],
        [1.7069, 7.8898],
        [3.0462, 1.6505],
        [2.4081, 6.4456],
        [2.1932, 7.4614],
        [2.3405, 2.7603],
        [1.9478, 8.4156],
        [2.7935, 7.8331],
        [1.8898, 3.8836],
        [3.3008, 1.6832]], device='cuda:0', grad_fn=<AsStridedBackward>)

ipdb> input.data.mean()    # 查看input的均值和标准差
tensor(3.9630, device='cuda:0')
ipdb> input.data.std()
tensor(1.9513, device='cuda:0')

ipdb> u    # 跳回上一层
> c:\programdata\anaconda3\lib\site-packages\torch\nn\modules\module.py(547)__call__()
    546         else:
--> 547             result = self.forward(*input, **kwargs)
    548         for hook in self._forward_hooks.values():

ipdb> u    # 跳回上一层
> e:/Users/mac/Desktop/jupyter/mdFile/deeplearning/main.py(88)train()
     87             optimizer.zero_grad()
1--> 88             score = model(input)
     89             loss = criterion(score, target)

ipdb> clear    # 清除所有断点
Clear all breaks? y
Deleted breakpoint 1 at e:/Users/mac/Desktop/jupyter/mdFile/deeplearning/main.py:88

ipdb> c    # 继续运行，记得先删除"debug/debug.txt"，否则很快又会进入调试模式
59it [06:21,  5.75it/s]loss: 0.24856307208538073
76it [06:24,  5.91it/s]

当我们想要进入 debug 模式，修改程序中某些参数值或者想分析程序时，就可以通过创建 debug 标识文件，此时程序会进入调试模式，调试完成之后删除这个文件并在 ipdb 调试接口输入 c 继续运行程序。如果想退出程序，也可以使用这种方式，先创建 debug 标识文件，然后输入 quit 在退出 debug 的同时退出程序。这种退出程序的方式，与使用 Ctrl + C 的方式相比更安全，因为这能保证数据加载的多进程程序也能正确地退出，并释放内存、显存等资源。

PyTorch 和 ipdb 集合能完成很多其他框架所不能完成或很难完成的功能。根据笔者日常使用的总结，主要有以下几个部分：

1. 通过 debug 暂停程序。当程序进入 debug 模式后，将不再执行 CPU 和 GPU 运算，但是内存和显存及相应的堆栈空间不会释放。
2. 通过 debug 分析程序，查看每个层的输出，查看网络的参数情况。通过 u(p) 、 d(own) 、 s(tep) 等命令，能够进入指定的代码，通过 n(ext) 可以单步执行，从而看到每一层的运算结果，便于分析网络的数值分布等信息。
3. 作为动态图框架， PyTorch 拥有 Python 动态语言解释执行的优点，我们能够在运行程序时，用过 ipdb 修改某些变量的值或属性，这些修改能够立即生效。例如可以在训练开始不久根据损失函数调整学习率，不必重启程序。
4. 如果在 IPython 中通过 %run 魔法方法运行程序，那么在程序异常退出时，可以使用 %debug 命令，直接进入 debug 模式，通过 u(p) 和 d(own) 跳到报错的地方，查看对应的变量，找出原因后修改相应的代码即可。有时我们的模式训练了好几个小时，却在将要保存模式之前，因为一个小小的拼写错误异常退出。此时，如果修改错误再重新运行程序又要花费好几个小时，太浪费时间。因此最好的方法就是看利用 %debug 进入调试模式，在调试模式中直接运行 model . save() 保存模型。在 IPython 中， %pdb 魔术方法能够使得程序出现问题后，不用手动输入 %debug 而自动进入 debug 模式，建议使用。

四、 通过PyTorch实现项目中容易遇到的问题

PyTorch 调用 CuDNN 报错时，报错信息诸如 CUDNN_STATUS_BAD_PARAM，从这些报错内容很难得到有用的帮助信息，最后先利用 PCU 运行代码，此时一般会得到相对友好的报错信息，例如在 ipdb 中执行 model.cpu() （input.cpu()）， PyTorch 底层的 TH 库会给出相对比较详细的信息。

常见的错误主要有以下几种：

• 类型不匹配问题。例如 CrossEntropyLoss 的输入 target 应该是一个 LongTensor ，而很多人输入 FloatTensor 。
• 部分数据忘记从 CPU 转移到 GPU 。例如，当 model 存放于 GPU 时，输入 input 也需要转移到 GPU 才能输入到 model 中。还有可能就是把多个 model 存放于一个 list 对象，而在执行 model.cuda() 时，这个 list 中的对象是不会被转移到 CUDA 上的，正确的用法是用 ModuleList 代替。
• Tensor 形状不匹配。此类问题一般是输入数据形状不对，或是网络结构设计有问题，一般通过 u(p) 跳到指定代码，查看输入和模型参数的形状即可得知。

此外，可能还会经常遇到程序正常运行、没有报错，但是模型无法收敛的问题。例如对于二分类问题，交叉熵损失一直徘徊在 0.69 附近（ln2），或者是数值出现溢出等问题，此时可以进入 debug 模式，用单步执行查看，每一层输出的均值和方差，观察从哪一层的输出开始出现数值异常。还要查看每个参数梯度的均值和方差，查看是否出现梯度消失或者梯度爆炸等问题。一般来说，通过再激活函数之前增加 BatchNorm 层、合理的参数初始化、使用 Adam 优化器、学习率设为0.001，基本就能确保模型在一定程度收敛。

五、第八章总结

本章带同学们从头实现了一个 Kaggle 上的经典竞赛，重点讲解了如何合理地组合安排程序，同时介绍了一些在PyTorch中调试的技巧，下章将正式的进入编程实战之旅，其中一些细节不会再讲的如此详细，做好心理准备。