开发背景:

医生在实际使用PACS软件观察病灶时,经常会测量不规则病灶的周长和面积,使用画笔工具勾勒比较耗时且准度欠佳,

或者在标记人工智能训练样本时少则几百张,多则几千张,为极大减少耗时和极大提高工作效率,故开发此功能用来自动勾勒病灶范围并自动测量。

国际惯例,先看效果:

思路流程概览:

①以鼠标按下作为漫水算法中心点向外扩散填充

②裁剪最大外接矩形,缩小计算范围

③灰度转换

④Canny算子或Sobel算子提取轮廓

⑤背景降噪

⑥提取边界轮廓

⑦设置容差范围

⑧可变多边形坐标转化

⑨缩放、平移、旋转后的坐标映射

准备一张样本并以手臂骨头作为假设病灶:

①以鼠标按下作为漫水算法中心点向外扩散填充

通过给定指定的中心坐标,和指定染色的颜色值,向四周扩撒,遇到一样或近似值将其包含在范围内,网上源码很多,很容易实现。

②裁剪最大外接矩形,缩小计算范围

将漫水填充范围的最大外接矩形裁剪出来,提高后续计算效率。

③灰度转换

转换成灰度图,为后续计算做准备。

④Canny算子或Sobel算子进行边缘检测

Canny算子和Sobel算子区别:

Canny算子:

在计算前先将图像进行高斯滤波转换,得到一个相对模糊的图像,使得噪点在平滑过度时的影响降到最低:

根据算法原理得到如下结果:

Sobel算子:

根据算法原理得到如下结果:

其中直观区别是canny算子计算的结果清晰,但不连续,容易受噪点影响,而sobel算子线条相对柔和,连续性强。

⑤背景降噪

进行一次手动背景降噪,使得展现的无用边缘更少,结果更清晰:

⑥提取边界轮廓

经过上面的计算后会得到一个边界坐标集合记为List<Point> list;

这些点是不连续的,不首尾相连的,我们需要将非边缘坐标删除,并将边缘坐标按顺时针或逆时针排序;

此时虽然得到了边缘坐标,但他是非连续性的,当我们把这些点连起来的时候就会出现问题:

所以我们将这些边缘坐标按逆时针或顺时针排序:

⑦在界面上增加滑块控件并设置容差范围

当碰到边界不是很清晰的时候,我们需要调整容差范围,以影响漫水扩散时的范围准确性:

观察容差范围10和20的区别:

⑧可变多边形坐标转化

根据本系列教程的测量工具开发,在此基础上我们将标识的范围转化为可变多边形:

微调结果并显示周长和面积:

⑨缩放、平移、旋转后的坐标映射

当图像发生放大、平移、旋转时,要注意边缘坐标的映射以保证结果正确:

配合色彩增强,食用效果更佳!

C#处理医学影像(三):基于漫水边界自动选取病灶范围的实现思路的更多相关文章

  1. 基于cornerstone.js的dicom医学影像查看浏览功能

    最近由于项目需求,需要医学影像.dcm文件的预览功能,功能完成后,基于原生Demo做一个开源分享. 心急的小伙伴可以先看如下基于原生js的全部代码: 一.全部代码 <!DOCTYPE html& ...

  2. 释放至强平台 AI 加速潜能 汇医慧影打造全周期 AI 医学影像解决方案

    基于英特尔架构实现软硬协同加速,显著提升新冠肺炎.乳腺癌等疾病的检测和筛查效率,并帮助医疗科研平台预防"维度灾难"问题 <PAGE 1 LEFT COLUMN: CUSTOM ...

  3. 医学影像工作站程序ProDicom的说明

    转载 http://blog.csdn.net/prodicom/article/details/4015064 注意:以下内容为转载,但保留了第一人称,请注意,以免造成不必要的麻烦. 医网联影像工作 ...

  4. word2vec原理(三) 基于Negative Sampling的模型

    word2vec原理(一) CBOW与Skip-Gram模型基础 word2vec原理(二) 基于Hierarchical Softmax的模型 word2vec原理(三) 基于Negative Sa ...

  5. {django模型层(二)多表操作}一 创建模型 二 添加表记录 三 基于对象的跨表查询 四 基于双下划线的跨表查询 五 聚合查询、分组查询、F查询和Q查询

    Django基础五之django模型层(二)多表操作 本节目录 一 创建模型 二 添加表记录 三 基于对象的跨表查询 四 基于双下划线的跨表查询 五 聚合查询.分组查询.F查询和Q查询 六 xxx 七 ...

  6. 区域医疗移动医疗影像解决方案--基于HTML5的PACS--HTML5图像处理【转】

    基于HTML5的PACS--图像伪彩 摘要: 要查看此系统更多的图像处理功能请参考:区域医疗移动医疗影像解决方案--基于HTML5的PACS--HTML5图像处理套用句广告语:哪里不会点哪里,so e ...

  7. C#开发医学影像胶片打印系统(一):万能花式布局的实现思路

    本篇文章将介绍开发医学影像胶片打印系统(printscu模式)遇到不规则排版时的一种思路, 一般来讲,医院打印胶片时都是整张胶片打印,但有时需要将多个病人或一个病人的多个检查打印在同一张胶片上, 这时 ...

  8. STC8H开发(三): 基于FwLib_STC8的模数转换ADC介绍和演示用例说明

    目录 STC8H开发(一): 在Keil5中配置和使用FwLib_STC8封装库(图文详解) STC8H开发(二): 在Linux VSCode中配置和使用FwLib_STC8封装库(图文详解) ST ...

  9. Keil MDK STM32系列(三) 基于标准外设库SPL的STM32F407开发

    Keil MDK STM32系列 Keil MDK STM32系列(一) 基于标准外设库SPL的STM32F103开发 Keil MDK STM32系列(二) 基于标准外设库SPL的STM32F401 ...

随机推荐

  1. Ajax使用post方式发送数据注意事项

    Ajax使用post方式给服务器传递数据时,需要将传递的字符串转化为模拟from表单发送数据的XML格式 在open之后奢姿头协议信息,模拟from表单传递数据 xhr.setRequestHeade ...

  2. 【转】linux shell编程实例总结

    查找当前目录中所有大于500M的文件,把这些文件名写到一个文本文件中,并统计其个数 find ./ -size +500M -type f | tee file_list | wc 在目录/tmp下找 ...

  3. shell编程之免交互 (不要再让你的双手过度劳累了)

    shell编程之免交互 1.Here Document免交互 2.Expect免交互 3.免交互磁盘创建 1.Here Document免交互 概述: Here Document使用I/O重定向的方式 ...

  4. iOS 如何监听用户在手机设置里改变了系统的时间?

    如何监听用户未退出APP但通过Home键在手机设置里改变了系统的时间? 用户虽未退出APP,但是当它按Home键退到后台时 ,会调用该方法: - (void)applicationDidEnterBa ...

  5. C#动态规划法计算文本相似度

    C# 采用动态规划算法,计算两个字符串之间的相似程度. public static double CountTextSimilarity(string textX, string textY, boo ...

  6. SonarQube之采购选型参考

    SonarQube是DevOps实践中主流的一款质量内建工具,过插件机制,Sonar 可以集成不同的测试工具,代码分析工具,以及持续集成工具,比如pmd-cpd.checkstyle.findbugs ...

  7. Latex公式导出word,Latex转换MathML使用POI导出公式可编辑的Word文件

    背景 之前在 使用spire.doc导出支持编辑Latex公式的标准格式word 博客中写过,使用spire.doc来生成word,不得不说spire.doc的api操作起来还是比较方便,但是使用的过 ...

  8. 利用iptables做网络转发

    常见的网络拓扑图结构如下: 但是内网服务器偶尔有上网需求,比如yum工具,wget文件.而我们又不能让重要业务直接暴露在公网上. 好用的安全策略有:三层交换机.路由器做nat映射,防火墙做安全策略. ...

  9. python中随机生成整数

    1 #可以多运行几次,看看结果是不是随机生成的~ 2 3 import random 4 #调用random模块,与 5 a = random.randint(1,100) 6 # 随机生成1-100 ...

  10. Java线程池进阶

    线程池是日常开发中常用的技术,使用也非常简单,不过想使用好线程池也不是件容易的事,开发者需要不断探索底层的实现原理,才能在不同的场景中选择合适的策略,最大程度发挥线程池的作用以及避免踩坑. 一.线程池 ...