Linux批量处理文件脚本
Linux shell字符串截取与拼接
一 Linux 的字符串截取很有用。有八种方法。
假设有变量 var=http://www.linuxidc.com/123.htm
1 # 号截取,删除左边字符,保留右边字符。
echo ${var#*//}
其中 var 是变量名,# 号是运算符,*// 表示从左边开始删除第一个 // 号及左边的所有字符
即删除 http://
结果是 :www.linuxidc.com/123.htm
2 ## 号截取,删除左边字符,保留右边字符。
echo ${var##*/}
##*/ 表示从左边开始删除最后(最右边)一个 / 号及左边的所有字符
即删除 http://www.linuxidc.com/
结果是 123.htm
3 %号截取,删除右边字符,保留左边字符
echo ${var%/*}
%/* 表示从右边开始,删除第一个 / 号及右边的字符
结果是:http://www.linuxidc.com
4 %% 号截取,删除右边字符,保留左边字符
echo ${var%%/*}
%%/* 表示从右边开始,删除最后(最左边)一个 / 号及右边的字符
结果是:http:
5 从左边第几个字符开始,及字符的个数
echo ${var:0:5}
其中的 0 表示左边第一个字符开始,5 表示字符的总个数。
结果是:http:
6 从左边第几个字符开始,一直到结束。
echo ${var:7}
其中的 7 表示左边第8个字符开始,一直到结束。
结果是 :www.linuxidc.com/123.htm
7 从右边第几个字符开始,及字符的个数
echo ${var:0-7:3}
其中的 0-7 表示右边算起第七个字符开始,3 表示字符的个数。
结果是:123
8 从右边第几个字符开始,一直到结束。
echo ${var:0-7}
表示从右边第七个字符开始,一直到结束。
结果是:123.htm
注:(左边的第一个字符是用 0 表示,右边的第一个字符用 0-1 表示)
二 Linux Shell 脚本中字符串的拼接方法
如果想要在变量后面添加一个字符,可以用一下方法:
$value1=home
$value2=${value1}"="
echo $value2
把要添加的字符串变量添加{},并且需要把$放到外面。
这样输出的结果是:home=,也就是说连接成功。
又如:
[root@localhost sh]# var1=/etc/
[root@localhost sh]# var2=yum.repos.d/
[root@localhost sh]# var3=${var1}${var2}
[root@localhost sh]# echo $var3
/etc/yum.repos.d/
判断文件是否存在的shell脚本代码
#!/bin/sh
# 判断文件是否存在
# link:www.jb51.net
# date:// myPath="/var/log/httpd/"
myFile="/var /log/httpd/access.log" # 这里的-x 参数判断$myPath是否存在并且是否具有可执行权限
if [ ! -x "$myPath"]; then
mkdir "$myPath"
fi
# 这里的-d 参数判断$myPath是否存在
if [ ! -d "$myPath"]; then
mkdir "$myPath"
fi # 这里的-f参数判断$myFile是否存在
if [ ! -f "$myFile" ]; then
touch "$myFile"
fi
# 其他参数还有-n,-n是判断一个变量是否是否有值
if [ ! -n "$myVar" ]; then
echo "$myVar is empty"
exit
fi # 两个变量判断是否相等
if [ "$var1" = "$var2" ]; then
echo '$var1 eq $var2'
else
echo '$var1 not eq $var2'
fi
一个实例
步骤:
1)遍历Manesh_fasta文件夹
2)将文件夹中的.fasta文件名改为.diso文件并赋予一个变量
3)判断这个.diso文件在Manesh_diso目录中是否存在
若不存在,则执行如下命令
#!/bin/bash fasta_files=`ls /ifs/home/fanchao/Manesh_fasta`
for filename in $fasta_files
do
diso_file="${filename%.*}".diso""
if [ ! -f "/ifs/home/fanchao/Manesh_diso/$diso_file" ]; then
/ifs/home/fanchao/disopred2./disopred/rundisopred /ifs/home/fanchao/Manesh_fasta/$filename
fi
done
bash变量的设定

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