多重比对着色软件包 TEXshade 图解安装教程

 
【絮语】: TEXshade 是 Latex 的一个宏包,可以对 MSF或 ALN 格式的多重比对文件以不同的方式进行着色美化,并可以对重要的位置和区域作出标记。用 TEXshade软件包能做出来的多重比对可视化效果,常常让人耳目一新,当然也是投高IF期刊所必须的。

如果有 LaTeX 基础,TEXshade 可能只是小菜一碟;但如果没有任何的Latex基础,也不担心,看完教程相信也会收获,先上张效果图养养眼。

准备工作:

(1)中文的 LaTeX - CTEX,下载地址:http://ftp.ctex.org/pub/tex/systems/ctex/2.9/CTeX_2.9.2.164.exe (基础版,203M)

(2)LaTeX 的*.tex 的编辑工具-Texmarker,下载地址:http://www.xm1math.net/texmaker/texmakerwin32_install.exe (46.3M)

(3)TEXshade宏包,请移步到网盘下载:http://raindy.ys168.com/  (生信软件目录下texshade.zip 压缩包, 1.1M)

安装流程:

(1) 直接双击运行下载的CTEX,安装过程中,可以不安装Ghostscript、GSview和WinEdt三个组件,如下图所示:

(2)双击安装Texmaker,直接下一步下一步安装,直至出现下面窗口后,点击“Close”完成。

(3)将 texshade.zip 压缩包解出来,最好放在非系统盘下,如本例路径为 D:\TEXshade\,注意检查该目录下是否有 texshade.ins 文件。

(4) 在 Windows的 “开始”-运行中输入“cmd”,调出Windows 的命令行窗口,将当前路径转到 TEXshade所在的目录下( D:\TEXshade\),如下图所示,此时输入“Latex texshade.ins”,回车,如果出现下图的信息,说明编译通过。

重复输入“Latex texshade.ins”再次编译,texshade.ins 编译2-3次后退出Windows命令行窗口,返回到TEXshade目录,此时比先前多了一些文件,这些是都编译生成的,如:AQPDNA.MSF 是比对的示例文件。

原文引自:http://user.qzone.qq.com/58001704/2?ptlang=2052

TEXshade教程- 多重比对着色软件包的更多相关文章

  1. Termux基础教程(二):软件包安装

    Termux基础教程(二):软件包安装 Termux是一个在安卓手机上模拟Linux系统的高级终端,这个终端十分强大,实用. Termux可以安装Liunx的各种软件包,这就是Termux的灵魂所在. ...

  2. WebGL简易教程(二):向着色器传输数据

    目录 1. 概述 2. 示例:绘制一个点(改进版) 1) attribute变量 2) uniform变量 3) varying变量 3. 结果 4. 参考 1. 概述 在上一篇教程<WebGL ...

  3. Linux系列教程(十一)——Linux软件包管理之RPM命令

    前面我们介绍了Linux系统的常用命令介绍和文本编辑器vim命令的介绍.那么从这篇博客开始,我们会正式的讲解Linux的系统管理,首先要讲的是Linux的软件包管理. 1.Linux软件包分类 一.源 ...

  4. Linux系列教程(十三)——Linux软件包管理之源码包、脚本安装包

    上篇博客我们讲解了网络yum源和光盘yum源的搭建步骤,然后详细介绍了相关的yum命令,yum 最重要是解决了软件包依赖性问题.在安装软件时,我们使用yum命令将会简单方便很多.我们知道yum命令只能 ...

  5. Direct3D 11 Tutorial 3: Shaders and Effect System_Direct3D 11 教程3:着色器和效果系统

    概述 在上一个教程中,我们设置了一个顶点缓冲区并将一个三角形传递给GPU. 现在,我们将逐步完成图形管道并查看每个阶段的工作原理. 将解释着色器和效果系统的概念. 请注意,本教程与前一个源代码共享相同 ...

  6. GPU深度发掘(一)::GPGPU数学基础教程

    作者:Dominik Göddeke                 译者:华文广 Contents 介绍 准备条件 硬件设备要求 软件设备要求 两者选择 初始化OpenGL GLUT OpenGL ...

  7. 【转载】GPU深度发掘(一)::GPGPU数学基础教程

    作者:Dominik Göddeke                 译者:华文广 Contents 介绍 准备条件 硬件设备要求 软件设备要求 两者选择 初始化OpenGL GLUT OpenGL ...

  8. OpenGL着色器入门简介

    说明:本文翻译自LearnOpengl经典教程,OpenGL着色器基础介绍的比较通俗易懂,特总结分享一下! 为什么要使用着色器?我们知道,OpenGL一般使用经典的固定渲染管线来渲染对象,但是随着Op ...

  9. WebGL简易教程(三):绘制一个三角形(缓冲区对象)

    目录 1. 概述 2. 示例:绘制三角形 1) HelloTriangle.html 2) HelloTriangle.js 3) 缓冲区对象 (1) 创建缓冲区对象(gl.createBuffer( ...

随机推荐

  1. [转] ServletContext 与application的异同

    相同:其实servletContext和application 是一样的,就相当于一个类创建了两个不同名称的变量.在 servlet中ServletContext就是application对象.大家只 ...

  2. ES6新特性:增加新类型:Symbol

    本文所有Demo的运行环境都为nodeJS, 参考:让nodeJS支持ES6的词法----babel的安装和使用 : ES6新增了一种数据类型:Symbol,Symbol是用来定义对象的唯一属性名的不 ...

  3. hdu4549 矩阵快速幂 + 欧拉降幂

    R - M斐波那契数列 Time Limit:1000MS     Memory Limit:32768KB     64bit IO Format:%I64d & %I64u Submit  ...

  4. ELK系统中kibana展示数据的时区问题

    在采用ELK记录系统日志时,日志存入elasticsearch时,一般是以本地时区存入(如北京东8区) 在elasticsearch中直接查询时也没有任何问题,但是kibana在做日志展示时,对日志时 ...

  5. 如何在HTMl网页中插入百度地图

    方法/步骤 1.打开"百度地图生成器"的网址:http://api.map.baidu.com/lbsapi/creatmap/index.html 如下图: 2.在"1 ...

  6. Web前端性能优化教程05:网站样式和脚本

    本文是Web前端性能优化系列文章中的第五篇,主要讲述内容:网站样式和脚本代码的放置位置.使用外部javascript和css.完整教程可查看:Web前端性能优化 一.将样式表放在顶部 可视性回馈的重要 ...

  7. 【USACO 1.3】Combination Lock

    /* TASK:combo LANG:C++ URL:http://train.usaco.org/usacoprob2?a=E6RZnAhV9zn&S=combo SOLVE:自己做,想的是 ...

  8. 通过Minimal版的iso安装CentOS7之后升级Desktop

    重新安装了CentOS7,但是使用的是Minimal的iso镜像安装的,所以安装之后只有文本界面,这里记录一下重新安装图形界面的过程. 连接网络 通过文本界面登陆后是没有连接网络的,所以需要修改配置连 ...

  9. C++ 参考网站

    Reference Web cites for the C++ standard library cppreference cplusplus sgi IBM MSDN isocpp More res ...

  10. As环境下添加android support library依赖库

    2015年的google大会上,google发布了新的Android Support Design库的新组件之一,以此来全面支持Material Design 设计风格的UI效果,为了可以使用这些新颖 ...