思路：

　　1、主要使用 Cordova的File插件

　　2、获取需要替换的js文件安装后的路径

　　3、软件使用js发起ajax请求，后台返回版本号跟客户端版本号对比

　　4、如果发现需要更新js文件，则用js调用cordova的File插件下载服务器的js文件，替换本地js文件。

　　5、然后载入本地js文件。

伪代码实现

index.html

<html>

	<head>

		<title>示例</title>

	</head>

	<body>

		<!--显示加载中-->

		<div id="loading">loading....</div>

		<my-app></my-app>

		<!--第三方的js文件-->

		<script type="text/javascript" src="3rdlibs.js"></script>

		<!--app自己的js文件加载控制器-->

		<script type="text/javascript" src="appJsFileLoader.js"></script>

	</body>

</html>

　　

appJsFileLoader.js

(function () {

	//获取当前安装的js文件的版本号

	var localVersion = getLocalVersion();

	//将本地版本发送到后台，后台判断是否本地版本需要更新，并告诉前台需要更新那些文件。

	$.get("/xx/xx/getNewAppVersion.json",data:{localVersion:localVersion},function (result) {

		 //发现新版本

		 if (result.isDiscoverNewVersion) {

		 	  //更新需要更新的文件(包含js、css、image等)

		 	  cordovaDownloadJSFile(result.appFileUrlList,function  (argument) {

		 	  		//替换本地js文件完成，则在html中加载js文件

		 	  		loadLocalJSFile();

		 	  		//隐藏loading

		 	  		$("#loading").hide()

		 	  });

		 }else{

		 	//没有新版本，直接加载本地js文件。

			loadLocalJSFile();

			//隐藏loading

		 	$("#loading").hide()

		 }

	});

})()

　　

我怎么获取到我的js文件的路径呢?

　　　　----- cordova.file.applicationDirectory    获取的是asset文件夹

 
 

参考资料

 
http://www.cnblogs.com/lhp2012/p/5333154.html

http://www.yiibai.com/cordova/cordova_file_system.html

https://www.npmjs.com/package/cordova-plugin-file

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