普通用户安装 R 包

转自 http://bnuzhutao.cn/archives/901

一般 R 语言的书籍上，介绍安装 R 包的方法都是这样的：

install.packages("packagename");

一般而言这不会成功，因为它默认会安装到系统目录下面，而普通用户在这个目录里并没有写入的权限。

因此，需要在 install.packages 这个函数里面指定安装的路径，例如想安装到 /home/myname/R 这个目录，就这么写：

install.packages("packagename", lib="/home/myname/R");

但这样子也不简单，比如安装完之后需要用 library 函数“载入”包吧？这时你还是要告诉 R 这个目录的位置。如果需要载入一连串的依赖包，就太麻烦了，需要输入 N 次目录。因此，最好是在 R 启动时就告诉它，我的自定义安装 R 包的目录在什么地方？方法是在家目录下面新建一个 .Rprofile 配置文件，然后在里面写入：

.libPaths(new="/home/myname/R")

这样，每当 R 启动时，它就会感知到这个目录，无论是安装包（install()），还是载入包（library()），都会使用这个目录，无需你反复地去指定。

另外，安装 R 包还有一个特别需要注意的问题是设置下载网址。默认情况下它会从国外的网站下载，速度很慢。我们可以改成国内的网站（例如我喜欢用 http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/ 这个科大的镜像），在 .Rprofile 配置文件里面写入：

local({r <- getOption("repos")
      r["CRAN"] <- "http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN"
           options(repos=r)})

这样，下载速度就快多了。