这个时代的生信,统计遗传,不懂或不会用这个数据库就说不过去了。

看看10年GWAS里是如何定位和评价UK biobank的:

For the near future, the UK Biobank is pushing the barriers further by releasing both genome-wide genotypes and rich phenotypic data on 500,000 people to the international research community.

Nature 4连发 - 这四篇基本把能做的分析都做了

我们应该重点关注的是这个数据挖掘的部分 - health genetics,挖掘得最好的都发在NG上了。

The UK Biobank resource with deep phenotyping and genomic data  - 介绍UK biobank数据库的特性

Genome-wide gene-environment analyses of depression and reported lifetime traumatic experiences in UK Biobank - 之前有篇抑郁症depression的NG paper

UKbiobank数据是好,但是基本的分析别人早就做过了,你想再做只能往深处继续挖掘了,否则想发NG是不可能的。

做UKbiobank最大的好处就是考验你的数据挖掘能力,因为一般中小课题组根本拿不到这么大的项目,所以90%搞统计遗传的一辈子都拿不到这样规模的数据,现在UKbiobank免费给你数据,你还不偷着乐啊。

我现在有机会拿到现成的UKbiobank数据,但是能力不足,所以必须先看看别人是怎么做得!

现在最火的当之无愧就是neuron imaging的data

2018 - Association analysis in over 329,000 individuals identifies 116 independent variants influencing neuroticism - 没做什么深入的分析,无非就是找到位点,做了个pathway enrichment而已。

2018 - Genome-wide analyses using UK Biobank data provide insights into the genetic architecture of osteoarthritis

2018 - Genome-wide association meta-analysis of individuals of European ancestry identifies new loci explaining a substantial fraction of hair color variation and heritability

2018 - Signatures of negative selection in the genetic architecture of human complex traits 这才是我期待的最完美的数据挖掘,自成一套的算法,再挖UKBB的数据。

UK Biobank专题的更多相关文章

  1. Genome-wide gene-environment analyses of depression and reported lifetime traumatic experiences in UK Biobank

    Genome-wide gene-environment analyses of depression and reported lifetime traumatic experiences in U ...

  2. 如何解压从UK biobank下载下来的tsv.bgz文件?

    今天碰到一个问题,就是从UK biobank下载下来的gwas result file是filename.tsv.bgz格式.这东西需要解压才能阅历,可是用zip或者rar都是搞不定,网上搜了一圈,说 ...

  3. 文献笔记:Genome-wide associations for birth weight and correlations with adult disease

    该文献纳入了EGG(Early Growth Genetics Consortium)和UK biobank两大数据库,分为欧洲祖先和非欧洲祖先群体.这两个数据用到的样本量分别如下: Early Gr ...

  4. Google云平台使用方法 | Hail | GWAS | 分布式回归 | LASSO

    参考: Hail Hail - Tutorial  windows也可以安装:Spark在Windows下的环境搭建 spark-2.2.0-bin-hadoop2.7 - Hail依赖的平台,并行处 ...

  5. 媲美GWAS Catalog,囊括45万人数据,778个表型,3千万个位点的公共数据库:GeneATLAS

    欢迎关注微信公众号"bio生物信息" GeneATLAS的数据全部来自 UK Biobank 的452,264个英国白人样本. 总共囊括的表型有778个,位点有三千万个. 优点 网 ...

  6. GWAS这十年 | 10 Years of GWAS Discovery: Biology, Function, and Translation

    相关文章: A Unified Framework for Association Analysis with Multiple Related Phenotypes 太重要了,不得不单独拿出来分析一 ...

  7. 【ESRI论坛6周年征文】ArcEngine注记(Anno/ Label/Element等)处理专题 -入门篇

    原发表于ESRI中国社区,转过来.我的社区帐号:jhlong http://bbs.esrichina-bj.cn/ESRI/viewthread.php?tid=122097 ----------- ...

  8. GDAL——命令使用专题——ogrinfo命令

    GDAL——命令使用专题——ogrinfo命令 前言 GDAL(Geospatial Data Abstraction Library)是一个在X/MIT许可协议下的开源栅格空间数据转换库.它利用抽象 ...

  9. 2016年中国微信小程序专题研究报告

    2016年12月29日,全球领先的移动互联网第三方数据挖掘和分析机构iiMedia Research(艾媒咨询)权威首发<2016年中国微信小程序专题研究报告>. 报告显示,82.6%手机 ...

随机推荐

  1. 聊Java中的任务调度的实现方法及比较

    前言 任务调度是指基于给定时间点,给定时间间隔或者给定执行次数自动执行任务.本文由浅入深介绍四种任务调度的 Java 实现: Timer ScheduledExecutor 开源工具包 Quartz ...

  2. Python学习日记(二十一) 异常处理

    程序中异常的类型 BaseException 所有异常的基类 SystemExit 解释器请求退出 KeyboardInterrupt 用户中断执行(通常是输入^C) Exception 常规错误的基 ...

  3. web workers 实例

    <!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset="UTF-8&quo ...

  4. 一种使用gitlab的CI/CD功能实现Nginx配置更新的方法

    至于nginx的docker制作,前面已介绍过. 现在使用gitlab在线编辑的方式,可实现Nginx的自定义配置并更新. .gitlab-ci.yml内容如下: variables: project ...

  5. 题解 洛谷P2258 【子矩阵】

    应该很容易想到暴力骗分. 我们考虑暴力\(dfs\)枚举所有行的选择,列的选择,每次跑一遍记下分值即可. 时间复杂度:\(O(C_n^r \times C_m^c \times r \times c) ...

  6. test20190825 AmberFrame

    100+0+99=199,第二题一分没得不应该. count 给定 \(n\),求合法的 \((x_1,x_2,x_3,\dots,x_{2m})\) 组数.一组 \(x\) 是合法的,当且仅当 \[ ...

  7. Dubbo源码分析(1):Spring集成Dubbo

    spring与dubbo事件 类图

  8. HTML锚点控制,跳转页面后定位到相应位置

    想在点击更多的页面 跳转后  用户能看到的是新闻  不用再用scollbar拖下来到新闻页面  这时候就需要在链接上 做下处理 <a href="/article/list/page/ ...

  9. Win10 Subsystem Linux : Ubuntu 的root密码

    安装完Ubuntu后忽然意识到没有设置root密码, 不知道密码自然就无法进入根用户下.Ubuntu的默认root密码是随机的, 即每次开机都有一个新的root密码.我们可以在终端输入命令 sudo ...

  10. QEventLoop以及QT事件循环

    1.一般我们的事件循环都是由exec()来开启的,例如下面的例子: 1 QCoreApplicaton::exec() 2 QApplication::exec() 3 QDialog::exec() ...