spm 一阶分析的Microtime onset应该如何填写?
1. 如果对数据进行了slice timing, 那么在进行一阶分析时应该修改microtime onset和 microtime resolution这两个参数,
假设数据的slice order= [1:2:47 2:2:46],reference slice= 47 (中间层),
那么microtime onset = 24,microtime resolution = 47(即slice number)
参考来源:
link: SPM/Slice Timing - Wikibooks, open books for an open world

以上图片指出: reference slice 和microtime onset的区别在于,前者是在空间中的位置,后者是时间上的位置,比如我们以中间时刻扫描的那一层作为参考层,那么在这个数据中,在中间时刻扫描的是第47层,
因此reference slice = 47, microtime onset则是参考层在时间上所处的位置,因为我们的参考层选择的是中间时刻,所以microtime onset则是24。
同理,假如slice order = [47:-1:1],选择第一层作为参考层(即最先扫描的那一层),那么reference slice= 47,microtime onset = 1。
豆丁上也有作者整理了完整的spm处理流程,其中作者也指出了microtime onset的设置,与前文的设置一致,原文链接和相关截图如下:
link: SPM-fMRI数据分析总述 - 豆丁网Docin


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